Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.276348	2210403E04Rik	RIKEN cDNA 2210403E04 gene	11		75674
Mm.276348	Ogdh	oxoglutarate dehydrogenase (lipoamide)	11		18293
Gene Ontology	glycolysis | metabolism | mitochondrion | oxidoreductase activity | oxidoreductase activity, acting on the aldehyde or oxo group of donors, disulfide as acceptor | oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring) activity
Human Homolog	OGDH[oxoglutarate (alpha-ketoglutarate) dehydrogenase (lipoamide)]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 260 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAAAAAAAAA (2) ACGCTCTTTG (2) GAAAAAAAAA (2) GAGGAGGAGG (2) GCAAAAAAAA (2) GCAAAAAAAT (5) GCCAAAAAAA (4) GCCAGCAAAA (5) GGCAAAAAAA (2) GGGTATTTAG (2) GTAGATGTGG (2) TACTTTCTAT (2) TAGCACAGCT (2) TGGGTTGTCA TGGTTGCTGG TTTTTTTTTT (2) 365.3 0.3653 Cb medulloblastoma AAAAAAAAAA (2) ACCAGAGACA (2) ATAACTTAGT (2) GAAAAAAAAA (2) GCAAAAAAAA (2) GCACAGTGCA (3) GCCAAAAAAA (4) GCCAGCAAAA (5) GCCCAAAAAA GGCAAAAAAA (2) GGGTATTTAG (2) TCCACCAGAT (2) TGGTTGCTGG TGTTGCACAC (2) TTTTTTTTTT (2) 1190.7 1.1907 P8 GC+1d culture AAAAAAAAAA (2) ACCAGAGACA (2) ATAACTTAGT (2) CTGTACATTG (2) GAAAAAAAAA (2) GAGGGAGGAG GCAAAAAAAA (2) GCAAAAAAAT (5) GCCAAAAAAA (4) GGGATGCTGC (2) GGGTATTTAG (2) TCCAAGAAGC TGGGTTGTCA TGGTTGCTGG TGTATTTGTG TTTTTTTTTT (2) 357 0.357 P8 GC+SHH+1d culture AAAAAAAAAA (2) ACCAGAGACA (2) CTGTACATTG (2) GAAAAAAAAA (2) GAGGAGGAGG (2) GAGGGAGGAG GCAAAAAAAA (2) GCAAAAAAAT (5) GCCAAAAAAA (4) GGCAAAAAAA (2) GGGTATTTAG (2) TACTTTCTAT (2) TGGTTGCTGG TGTTGCACAC (2) TTTTTTTTTT (2) 503.7 0.5037 3T3 fibroblasts AAAAAAAAAA (2) GAGGAGGAGG (2) GCAAAAAAAA (2) GCACAGTGCA (3) GCCAGCAAAA (5) GTAGATGTGG (2) TGGTTGCTGG 269.8 0.2698 E15 cortex AAAAAAAAAA (2) GAAAAAAAAA (2) GAGGAGGAGG (2) GCAAAAAAAA (2) GCCAAAAAAA (4) GCCAGCAAAA (5) TCCACCAGAT (2) TGGTTGCTGG TTTTTTTTTT (2) 578.7 0.5787 P1 cortex AAAAAAAAAA (2) GAAAAAAAAA (2) GAAGGACTAT (2) GAGGAGGAGG (2) GCAAAAAAAA (2) GCATTTGGCT GCCAAAAAAA (4) GGGTATTTAG (2) GTAGATGTGG (2) TGGGTTGTCA TGGTTGCTGG TTTTTTTTTT (2) 427 0.427 Hypothalamus AAAAAAAAAA (2) AAGCTGACTG CTGTACATTG (2) GAAAAAAAAA (2) GAAGGACTAT (2) GAGGAGGAGG (2) GCAAAAAAAA (2) GCAAAAAAAT (5) GCATTTGGCT GCCAAAAAAA (4) GGCAAAAAAA (2) GTAGATGTGG (2) TGGTTGCTGG TTTTTTTTTT (2) 599.4 0.5994 E12.5 retina AAAAAAAAAA (2) ATAACTTAGT (2) GAAAAAAAAA (2) GAGGAGGAGG (2) GCAAAAAAAA (2) GCATTTGGCT TACAAACAGA (2) TGGTTGCTGG TTTTTTTTTT (2) 368 0.368 E14.5 retina AAAAAAAAAA (2) ACCAGAGACA (2) GAAAAAAAAA (2) GCAAAAAAAA (2) GCCAAAAAAA (4) GGCAAAAAAA (2) GTAGATGTGG (2) TAGCACAGCT (2) TGGGTTGTCA TGGTTGCTGG TGTATTTGTG TTTTTTTTTT (2) 1124 1.124 E16.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAGCTGACTG ACCAGAGACA (2) GAAAAAAAAA (2) GCAAAAAAAA (2) GCACAGTGCA (3) GCCAAAAAAA (4) TGGGTTGTCA TGGTTGCTGG TTGCTGTCTG (4) TTTTTTTTTT (2) 871.1 0.8711 E18.5 retina AAAAAAAAAA (2) ACCAGAGACA (2) ACGCTCTTTG (2) GAAAAAAAAA (2) GCAAAAAAAA (2) GCACAGTGCA (3) GCATTTGGCT GCCAAAAAAA (4) GCCCAAAAAA GGCACTTTTT GTAGATGTGG (2) TGGTTGCTGG TTTTTTTTTT (2) 769.3 0.7693 P0.5 retina AAAAAAAAAA (2) GAAAAAAAAA (2) GCAAAAAAAA (2) GCCAAAAAAA (4) GCCCAAAAAA GGGTATTTAG (2) GTAGATGTGG (2) TACTTTCTAT (2) TCCACCAGAT (2) TGGGTTGTCA TGGTTGCTGG TGTATTTGTG TTTTTTTTTT (2) 394.7 0.3947 P2.5 retina AAAAAAAAAA (2) GAAAAAAAAA (2) GAGGAGGAGG (2) GCAAAAAAAA (2) GCACAGTGCA (3) GCCAAAAAAA (4) GGCACTTTTT GTAGATGTGG (2) TACTTTCTAT (2) TCCACCAGAT (2) TGGGTTGTCA TGGTTGCTGG TTTTTTTTTT (2) 640.7 0.6407 P4.5 retina AAAAAAAAAA (2) ACCAGAGACA (2) ATAACTTAGT (2) GAAAAAAAAA (2) GAAGGACTAT (2) GAGGAGGAGG (2) GAGGGAGGAG GCAAAAAAAA (2) GCACAGTGCA (3) GCCAAAAAAA (4) GGCAAAAAAA (2) GTAGATGTGG (2) TGGTTGCTGG TTGCTGTCTG (4) TTTTTTTTTT (2) 555 0.555 P6.5 retina AAAAAAAAAA (2) ACCAGAGACA (2) GAAAAAAAAA (2) GCAAAAAAAA (2) GCACAGTGCA (3) GCCAAAAAAA (4) GCCAGCAAAA (5) GGCAAAAAAA (2) GGCACTTTTT GGGATGCTGC (2) GTAGATGTGG (2) TAGCACAGCT (2) TCCAAGAAGC TGGTTGCTGG TGTTGCACAC (2) TTTTTTTTTT (2) 528.7 0.5287 P10.5 crx- retina AAAAAAAAAA (2) ACCAGAGACA (2) GAAAAAAAAA (2) GAGGAGGAGG (2) GCAAAAAAAA (2) GCACAGTGCA (3) GCCAAAAAAA (4) GGCAAAAAAA (2) GGCACTTTTT GGGTATTTAG (2) GTAGATGTGG (2) TGGTTGCTGG 386.6 0.3866 P10.5 crx+ retina AAAAAAAAAA (2) ACCAGAGACA (2) GAAAAAAAAA (2) GCAAAAAAAA (2) GCAAAAAAAT (5) GCCAAAAAAA (4) GGCAAAAAAA (2) GGGTATTTAG (2) GTAGATGTGG (2) TCCAAGAAGC TGGTTGCTGG TTTTTTTTTT (2) 278.5 0.2785 Adult retinal AAAAAAAAAA (2) GAAAAAAAAA (2) GAGGAGGAGG (2) GAGGGAGGAG GCAAAAAAAA (2) GCACAGTGCA (3) GCATTTGGCT GCCAAAAAAA (4) GCCCAAAAAA GGGTATTTAG (2) GTAGATGTGG (2) TCCACCAGAT (2) TGGTTGCTGG TTGCTGTCTG (4) TTTTTTTTTT (2) 342.8 0.3428 ONL AAAAAAAAAA (2) AAGCTGACTG ACCAGAGACA (2) ATAACTTAGT (2) GAAAAAAAAA (2) GAGGAGGAGG (2) GCAAAAAAAA (2) GCACAGTGCA (3) GCCAAAAAAA (4) GGGATGCTGC (2) GGGTATTTAG (2) GTAGATGTGG (2) TACAAACAGA (2) TGGTTGCTGG TTTTTTTTTT (2) 568.5 0.5685