Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.280013 Psmd1proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 1 1    70247 
 Mm.280013 AA986695expressed sequence AA986695 1    98247 
 Mm.280013 4930438O05RikRIKEN cDNA 4930438O05 gene 1    78795 
 Human Homolog FLJ12584[hypothetical protein FLJ12584]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 192 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCACTCTGAATT
CTGAGACCTG (3)
GCCAAATTTG (4)
GCTCTGGCCT
GGAGGCAGCC (2)
GGCAACTTTG (6)
GGGTTCCCCT (2)
GGTTTTGTGT (4)
GTGGAGACCA
TAATTGTATT (4)
TCTTTAATGC (3)
TGAGTGTGAG (4)
TTTGTCAGTG (2)
39.10.0391
Cb medulloblastomaAACTTGGAAA (3)
ACTCTGAATT
CTGAGACCTG (3)
GCTCTGGCCT
GGGTTCCCCT (2)
GGTTTTGTGT (4)
TCCCCTGGAA
TCTTTAATGC (3)
29.90.0299
P8 GC+1d cultureACTCTGAATT
ATGAGAGCTG (4)
ATGAGATGCT
ATTCTGAAAA (3)
CTGAGACCTG (3)
GAGACGGAGG (4)
GCCAAATTTG (4)
GCTCTGGCCT
GGCAACTTTG (6)
GGTTCCCTCA (3)
GGTTTTGTGT (4)
TGTGCTCCCA (2)
44.50.0445
P8 GC+SHH+1d cultureACTCTGAATT
ATGAGAGCTG (4)
CCTTTAAAAA (4)
CTGAGACCTG (3)
GAGACGGAGG (4)
GCCAAATTTG (4)
GCTCTGGCCT
GGAGGCAGCC (2)
GGTTCCCTCA (3)
GGTTTTGTGT (4)
GTGGAGACCA
43.30.0433
3T3 fibroblastsCTGAGACCTG (3)
GCTCTGGCCT
GGAGGCAGCC (2)
GGGTTCCCCT (2)
GGTTCCCTCA (3)
87.50.0875
E15 cortexCTGAGACCTG (3)
GAGACGGAGG (4)
GCCAAATTTG (4)
GCTCTGGCCT
49.40.0494
P1 cortexACTCTGAATT
CTGAGACCTG (3)
GCTCTGGCCT
GGCTCCCTCA
GGTTTTGTGT (4)
GTGGAGACCA
31.60.0316
HypothalamusACTCTGAATT
ATGAGAGCTG (4)
ATTCTGAAAA (3)
CCTTTAAAAA (4)
CTGAGACCTG (3)
GAGACGGAGG (4)
GCCAAATTTG (4)
GCTCTGGCCT
GGCTCCCTCA
GGTTCCCTCA (3)
GGTTTTGTGT (4)
GTGGAGACCA
TAATTGTATT (4)
TGTGCTCCCA (2)
TTTGTCAGTG (2)
360.036
E12.5 retinaAACTTGGAAA (3)
ACTCTGAATT
CTGAGACCTG (3)
GAAACTTGGG (3)
GCCAAATTTG (4)
GCTCTGGCCT
TGTGCTCCCA (2)
32.10.0321
E14.5 retinaACTCTGAATT
ATGAGATGCT
ATTCATCAAG (3)
CTGAGACCTG (3)
GAAACTTGGG (3)
GCCAAATTTG (4)
GCTCTGGCCT
GGGTTCCCCT (2)
GGTTCCCTCA (3)
GGTTTTGTGT (4)
TCTTTAATGC (3)
TTTGTCAGTG (2)
41.60.0416
E16.5 retinaACTCTGAATT
ATGAGAGCTG (4)
ATTCATCAAG (3)
CTGAGACCTG (3)
GCCAAATTTG (4)
GCTCTGGCCT
GGGTTCCCCT (2)
GGTTCCCTCA (3)
GGTTTTGTGT (4)
TGATTATAGA (4)
TTTGTCAGTG (2)
560.056
E18.5 retinaACTCTGAATT
ATGAGAGCTG (4)
CCTTTAAAAA (4)
CTGAGACCTG (3)
GAGACGGAGG (4)
GCCAAATTTG (4)
GCTCTGGCCT
GGCAACTTTG (6)
GGTTCCCTCA (3)
TCCCCTGGAA
TGATTATAGA (4)
TTTGTCAGTG (2)
45.40.0454
P0.5 retinaATGAGAGCTG (4)
ATTCATCAAG (3)
CTGAGACCTG (3)
GAGACGGAGG (4)
GCCAAATTTG (4)
GCTCTGGCCT
GGCAACTTTG (6)
GGCTCCCTCA
47.30.0473
P2.5 retinaAACTTGGAAA (3)
ACTCTGAATT
ATGAGAGCTG (4)
CCTTTAAAAA (4)
CTGAGACCTG (3)
GAAACTTGGG (3)
GAGACGGAGG (4)
GCTCTGGCCT
GGGTTCCCCT (2)
GGTTCCCTCA (3)
GGTTTTGTGT (4)
GTGGAGACCA
320.032
P4.5 retinaACTCTGAATT
ATGAGAGCTG (4)
CTGAGACCTG (3)
GAGACGGAGG (4)
GCCAAATTTG (4)
GCTCTGGCCT
GTGGAGACCA
TCCCCTGGAA
220.022
P6.5 retinaACTCTGAATT
ATGAGAGCTG (4)
CACGCGCACA
CCTTTAAAAA (4)
CTGAGACCTG (3)
GAGACGGAGG (4)
GCCAAATTTG (4)
GCTCTGGCCT
GGGTTCCCCT (2)
GGTTCCCTCA (3)
GGTTTTGTGT (4)
TCCCCTGGAA
33.60.0336
P10.5 crx- retinaATGAGAGCTG (4)
CACGCGCACA
CTGAGACCTG (3)
GCCAAATTTG (4)
GCTCTGGCCT
GGAGGCAGCC (2)
GGGTTCCCCT (2)
GGTTTTGTGT (4)
TCCCCTGGAA
39.10.0391
P10.5 crx+ retinaACTCTGAATT
CTGAGACCTG (3)
GCCAAATTTG (4)
GCTCTGGCCT
GGAGGCAGCC (2)
GGTTTTGTGT (4)
GTGGAGACCA
TGTGCTCCCA (2)
26.70.0267
Adult retinalACTCTGAATT
ATTCTGAAAA (3)
CACGCGCACA
CTGAGACCTG (3)
GAAACTTGGG (3)
GAGACGGAGG (4)
GCCAAATTTG (4)
GCTCTGGCCT
GGAGGCAGCC (2)
GGCAACTTTG (6)
GGTTCCCTCA (3)
GGTTTTGTGT (4)
TGAGTGTGAG (4)
37.40.0374
ONLCTGAGACCTG (3)
GCCAAATTTG (4)
GCTCTGGCCT
GGTTCCCTCA (3)
GGTTTTGTGT (4)
TGAGTGTGAG (4)
15.20.0152