Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.283339 Prpf39PRP39 pre-mRNA processing factor 39 homolog (yeast) 12    328110 
 Human Homolog PRPF39[PRP39 pre-mRNA processing factor 39 homolog (yeast)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 99 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCACAACATTAA (2)
ACACTTTTTG (2)
CAAAAAAAAA (2)
CAGCAAAAAA (2)
CTCTGCCTTT
GTGACATTTA
60.20.0602
Cb medulloblastomaACACTTTTTG (2)
CAAAAAAAAA (2)
CAGCAAAAAA (2)
CCTTTCTGCG (3)
106.30.1063
P8 GC+1d cultureACACTTTTTG (2)
AGCTGCAAAA
CAAAAAAAAA (2)
CCTTTCTGCG (3)
47.90.0479
P8 GC+SHH+1d cultureACACTTTTAT (3)
ACACTTTTTG (2)
AGCTGCAAAA
CAAAAAAAAA (2)
CAGCAAAAAA (2)
TGAAATCAAA
69.20.0692
E15 cortexACACTTTTTG (2)
CAAAAAAAAA (2)
39.50.0395
P1 cortexACACTTTTTG (2)
CAAAAAAAAA (2)
31.80.0318
HypothalamusACACTTTTTG (2)
AGCTGCAAAA
CAAAAAAAAA (2)
CAGCAAAAAA (2)
CCTTTCTGCG (3)
GGGCTGGGAT
TGAAATCAAA
560.056
E12.5 retinaACAACATTAA (2)
ACACTTTTAT (3)
ACACTTTTTG (2)
CAAAAAAAAA (2)
CAGCAAAAAA (2)
CCTTTCTGCG (3)
GGGCTGGGAT
TAAAACTTAT
43.40.0434
E14.5 retinaACACTTTTAT (3)
AGCTGCAAAA
CAAAAAAAAA (2)
CAGCAAAAAA (2)
CCTTTCTGCG (3)
CTCTGCCTTT
TACAAAATAA (2)
27.20.0272
E16.5 retinaACACTTTTAT (3)
ACACTTTTTG (2)
AGCTGCAAAA
CAAAAAAAAA (2)
CCTTTCTGCG (3)
CTCTGCCTTT
GTGACATTTA
23.50.0235
E18.5 retinaACACTTTTTG (2)
AGCTGCAAAA
CAAAAAAAAA (2)
CAGCAAAAAA (2)
CCTTTCTGCG (3)
TAAAACTTAT
TGAAATCAAA
61.70.0617
P0.5 retinaACACTTTTTG (2)
AGCTGCAAAA
CAAAAAAAAA (2)
CCTTTCTGCG (3)
TAAAACTTAT
147.30.1473
P2.5 retinaACACTTTTTG (2)
CAAAAAAAAA (2)
CAGCAAAAAA (2)
CCTTTCTGCG (3)
TAAAACTTAT
TACAAAATAA (2)
75.60.0756
P4.5 retinaACACTTTTTG (2)
AGCTGCAAAA
CAAAAAAAAA (2)
TACAAAATAA (2)
51.50.0515
P6.5 retinaAGCTGCAAAA
CAAAAAAAAA (2)
CAGCAAAAAA (2)
CCTTTCTGCG (3)
41.70.0417
P10.5 crx- retinaACAACATTAA (2)
ACACTTTTTG (2)
AGCTGCAAAA
CAAAAAAAAA (2)
CAGCAAAAAA (2)
CCTTTCTGCG (3)
GTGACATTTA
35.40.0354
P10.5 crx+ retinaACACTTTTTG (2)
AGCTGCAAAA
CAAAAAAAAA (2)
CAGCAAAAAA (2)
CCTTTCTGCG (3)
GGGCTGGGAT
GTGACATTTA
65.30.0653
Adult retinalACACTTTTAT (3)
AGCTGCAAAA
CAAAAAAAAA (2)
CCTTTCTGCG (3)
35.30.0353
ONLAGCTGCAAAA
CAAAAAAAAA (2)
22.90.0229