Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.284710 9030419F21RikRIKEN cDNA 9030419F21 gene 15    71512 
 Mm.284710 5730502D15RikRIKEN cDNA 5730502D15 gene 15    67976 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 133 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCTGCTGACAG (2)
GCCTCTGGTG (2)
GGACCACTGA (2)
TCGAAGGTGT (5)
TGGCATTGCC (2)
TGTACAGGCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
44.10.0441
Cb medulloblastomaACCAGTCCCC
CTGCTGACAG (2)
GCCTCTGGTG (2)
TTTTTAAGTA (3)
TTTTTTTTTT (2)
300.03
P8 GC+1d cultureACCAGTCCCC
CCTCTAATCC (2)
GCCTCTGGTG (2)
GGAAGTAGCT (3)
GGACCACTGA (2)
TGTACAGGCT (2)
TTTTTAAGTA (3)
TTTTTTTTTT (2)
47.80.0478
P8 GC+SHH+1d cultureATCCTGTCTG (4)
CCTCTAATCC (2)
GCAACCATCC (4)
GCCTCTGGTG (2)
GGAAGTAGCT (3)
GGACCACTGA (2)
TGTACAGGCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
480.048
3T3 fibroblastsGCCTCTGGTG (2)
31.50.0315
E15 cortexCCTCTAATCC (2)
GCTGTGGCAA
TGTACAGGCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
19.60.0196
P1 cortexCCTCTAATCC (2)
GCCTCTGGTG (2)
TTTTTTTTTT (2)
18.10.0181
HypothalamusAATGGGTGGC (3)
ACCAAGGTAA (2)
CCTCTAATCC (2)
GCCTCTGGTG (2)
GCTGTGGCAA
TGTACAGGCT (2)
TTTTTAAGTA (3)
TTTTTTTTTT (2)
36.10.0361
E12.5 retinaAATGGCTGGC (2)
ATCCTGTCTG (4)
GAGCAGTGAG (4)
GCCTCTGGTG (2)
GGAAGTAGCT (3)
TGGCATTGCC (2)
TTTTTTTTTT (2)
73.30.0733
E14.5 retinaCCTCTAATCC (2)
GCCTCTGGTG (2)
GGAAGTAGCT (3)
TGGCATTGCC (2)
TGTACAGGCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
58.20.0582
E16.5 retinaAATGGGTGGC (3)
CCTCTAATCC (2)
GAGCAGTGAG (4)
GCAACCATCC (4)
GCCTCTGGTG (2)
GGACCACTGA (2)
TGTACAGGCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
59.60.0596
E18.5 retinaCCTCTAATCC (2)
GCCTCTGGTG (2)
TTTTTAAGTA (3)
TTTTTTTTTT (2)
69.10.0691
P0.5 retinaAATGGCTGGC (2)
AATGGGTGGC (3)
CCTCTAATCC (2)
GAGCAGTGAG (4)
GCCTCTGGTG (2)
GGAAGTAGCT (3)
TGTACAGGCT (2)
TTTTTAAGTA (3)
TTTTTTTTTT (2)
76.70.0767
P2.5 retinaACCAGTCCCC
CCTCTAATCC (2)
GAGCAGTGAG (4)
GCCTCTGGTG (2)
GCTGTGGCAA
GGAAGTAGCT (3)
TCGAAGGTGT (5)
TGGCATTGCC (2)
TGTACAGGCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
740.074
P4.5 retinaACCAAGGTAA (2)
CTGCTGACAG (2)
GCAACCATCC (4)
GCCTCTGGTG (2)
GGAAGTAGCT (3)
TCGAAGGTGT (5)
TGTACAGGCT (2)
TTTTTAAGTA (3)
TTTTTTTTTT (2)
57.60.0576
P6.5 retinaCCTCTAATCC (2)
GCCTCTGGTG (2)
GGAAGTAGCT (3)
TCGAAGGTGT (5)
TGTACAGGCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
43.40.0434
P10.5 crx- retinaAATGGCTGGC (2)
ACCAGTCCCC
ATCCTGTCTG (4)
GCCTCTGGTG (2)
GGAAGTAGCT (3)
TGTACAGGCT (2)
TTTTTAAGTA (3)
39.10.0391
P10.5 crx+ retinaATCCTGTCTG (4)
GCCTCTGGTG (2)
GGAAGTAGCT (3)
TGGCATTGCC (2)
TGTACAGGCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
460.046
Adult retinalAATGGGTGGC (3)
ACCAAGGTAA (2)
ACCAGTCCCC
CCTCTAATCC (2)
CTGCTGACAG (2)
GCCTCTGGTG (2)
GGAAGTAGCT (3)
TGTACAGGCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
540.054
ONLACCAAGGTAA (2)
ACCAGTCCCC
CCTCTAATCC (2)
GCAACCATCC (4)
GCCTCTGGTG (2)
GCTGTGGCAA
TGTACAGGCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
32.40.0324