Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.28838 D930015E06RikRIKEN cDNA D930015E06 gene 3    229473 
 Mm.28838 4930509B17RikRIKEN cDNA 4930509B17 gene 3    75052 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 70 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCCTTTAATCC (355)52.20.0522
P8 Cb GCTGCCGCCTGT (6)8.20.0082
P8 Cb GCAACCTGGACA (5)1.60.0016
P8 Cb GCCAAGCCTGCT (7)1.60.0016
P8 Cb GCTGCAAGGAGT (3)1.60.0016
Cb medulloblastomaCCTTTAATCC (355)41.60.0416
Cb medulloblastomaAACCTGGACA (5)4.60.0046
P8 GC+1d cultureCCTTTAATCC (355)320.032
P8 GC+1d cultureTGAGGGACTG (2)6.80.0068
P8 GC+1d cultureTGCCGCCTGT (6)6.80.0068
P8 GC+1d cultureAACCTGGACA (5)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureCCTTTAATCC (355)25.80.0258
P8 GC+SHH+1d cultureTGCCGCCTGT (6)15.20.0152
P8 GC+SHH+1d cultureTGAGGGACTG (2)70.007
P8 GC+SHH+1d cultureAACCTGGACA (5)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureGCTGAGAAAA (15)1.20.0012
3T3 fibroblastsCCTTTAATCC (355)70.10.0701
3T3 fibroblastsTGCCGCCTGT (6)140.014
3T3 fibroblastsAACCTGGACA (5)3.50.0035
E15 cortexCCTTTAATCC (355)54.40.0544
E15 cortexTGAGGGACTG (2)4.90.0049
E15 cortexTGCAAGGAGT (3)4.90.0049
E15 cortexTGCCGCCTGT (6)4.90.0049
P1 cortexCCTTTAATCC (355)154.50.1545
P1 cortexTGAGGGACTG (2)9.10.0091
HypothalamusCCTTTAATCC (355)19.90.0199
HypothalamusGCTGAGAAAA (15)1.80.0018
E12.5 retinaCCTTTAATCC (355)75.10.0751
E12.5 retinaTGCCGCCTGT (6)5.60.0056
E12.5 retinaTGAGGGACTG (2)3.80.0038
E12.5 retinaTGCAAGGAGT (3)3.80.0038
E12.5 retinaAACCTGGACA (5)1.90.0019
E14.5 retinaCCTTTAATCC (355)120.30.1203
E14.5 retinaTGCCGCCTGT (6)10.90.0109
E14.5 retinaTGCAAGGAGT (3)9.10.0091
E14.5 retinaTGAGGGACTG (2)7.30.0073
E14.5 retinaCAAGCCTGCT (7)1.80.0018
E16.5 retinaCCTTTAATCC (355)68.80.0688
E16.5 retinaTGCAAGGAGT (3)14.50.0145
E16.5 retinaTGCCGCCTGT (6)7.20.0072
E16.5 retinaTGAGGGACTG (2)3.60.0036
E16.5 retinaAACCTGGACA (5)1.80.0018
E18.5 retinaCCTTTAATCC (355)23.60.0236
E18.5 retinaTGCAAGGAGT (3)3.60.0036
E18.5 retinaCAAGCCTGCT (7)1.80.0018
P0.5 retinaCCTTTAATCC (355)72.60.0726
P0.5 retinaTGCAAGGAGT (3)3.90.0039
P0.5 retinaTGAGGGACTG (2)20.002
P2.5 retinaCCTTTAATCC (355)70.40.0704
P2.5 retinaTGCCGCCTGT (6)5.30.0053
P2.5 retinaTGCAAGGAGT (3)1.80.0018
P4.5 retinaCCTTTAATCC (355)43.60.0436
P4.5 retinaTGCCGCCTGT (6)40.004
P4.5 retinaTGAGGGACTG (2)20.002
P6.5 retinaCCTTTAATCC (355)700.07
P6.5 retinaAACCTGGACA (5)50.005
P6.5 retinaTGCAAGGAGT (3)3.30.0033
P6.5 retinaTGAGGGACTG (2)1.70.0017
P10.5 crx- retinaCCTTTAATCC (355)63.20.0632
P10.5 crx- retinaTGAGGGACTG (2)3.70.0037
P10.5 crx+ retinaCCTTTAATCC (355)38.40.0384
P10.5 crx+ retinaCACCGTGGCC (2)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaGCTGAGAAAA (15)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaTGAGGGACTG (2)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTGCCGCCTGT (6)1.90.0019
Adult retinalCCTTTAATCC (355)129.60.1296
Adult retinalGCTGAGAAAA (15)1.90.0019
ONLCCTTTAATCC (355)84.30.0843
ONLAACCTGGACA (5)1.90.0019
ONLCACCGTGGCC (2)1.90.0019