Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.288567	Hbb	hemoglobin beta chain complex	7	7 50.0 cM	15127
Mm.288567	Hbb-b1	hemoglobin, beta adult major chain	7	7 50.0 cM	15129
Mm.288567	Hbb-b2	hemoglobin, beta adult minor chain	7	7 50.0 cM	15130
Mm.288567	Hbb-bh1	hemoglobin Z, beta-like embryonic chain	7	7 49.96 cM	15132
Mm.288567	Hbb-y	hemoglobin Y, beta-like embryonic chain	7	7 49.95 cM	15135
Gene Ontology	hemoglobin complex | oxygen transport | oxygen transporter activity | transport
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 594 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAAAGATCTA (3) AAAGAAAGTT (3) AGAAAATCAG (5) ATCATTTTGG (2) ATGTTTGTTT (5) ATTTTTTTTC (2) CAAAAAAAAA (2) CATCCTGAGA (6) CTGAAGATCA GAAAGAAAAT (5) GAAATAATGT GACAGCCTCA (5) GCAAAAAAAT (5) GCAAGAAAGT (5) GGCAAAAAAA (2) GGCAAAGATT (6) GGCAATATTA (6) GGCCTTACTT (3) GGGTTAATGG GGTTAATGTT (2) GTGCACCTGA (5) GTTAAATGTT (6) GTTAATAAAG (2) GTTAATGTTT (2) GTTTTAAAAA (3) TATTTCAGTG (2) TGAATCCTGA (6) TGGATCCTAG TGGATCCTGA (5) TGGGATCTGA (3) TGGTTCTTGA (7) TGTAATAAGA (3) TGTCAGTTGT (6) TGTGTGTGAA (2) TTAATAAAAT (3) TTGAATAAAG (6) TTGATCCTGG 270.6 0.2706 Cb medulloblastoma AAAGAAAGTT (3) AATAAGTGAA (5) AATAATTTAA (2) AGAAAATCAG (5) ATAGCAGAGG (5) ATTTTTTTTC (2) CAAAAAAAAA (2) CAAAGAAAAA CATAAAGATT (3) CATCCTGAGA (6) GAAATAATGT GCAAGAAAAA (3) GGCAAAAAAA (2) GGCAAAGATT (6) GGCAATATTA (6) GGGTTAATGG GGTTAATGTT (2) GTTAATAAAG (2) GTTTTAAAAA (3) TATTTCAGTG (2) TGGAATCCTG (5) TGGATCCTGA (5) TGGATCCTGG (2) TGGGATCTGA (3) TGTGTGTGAA (2) TTGATCCTGG 321 0.321 P8 GC+1d culture AAAAGATCTA (3) AAAGAAAGTT (3) AATAAGTGAA (5) AATTGCACTT (2) ACAAAAGAAT (5) AGAAAATCAG (5) ATCAAATGGT (5) ATTGAAAACT ATTTTTTTTC (2) CAAAAAAAAA (2) CATAAAAAAA (6) GAAATAATGT GCAAAAAAAT (5) GCCTTCCAAA (5) GGCAAAGATT (6) GGCAATATTA (6) GGGCCCTTCA GGGTTAATGG GGTTAATGTT (2) GTTAATAAAG (2) GTTTTAAAAA (3) TATTTCAACT TATTTCAGTG (2) TGAATCCTGA (6) TGGATCCTAG TGGATCCTGA (5) TGGATCCTGG (2) TGGATTCTTA (2) TGGTTCCTGG (2) TGGTTCTTGA (7) TGTGTGTGAA (2) TTAATAAAAT (3) TTAATAAAGA (2) TTGATCCTGG TTTATAAAAT TTTGGTGTTT (7) TTTTATAAAG 149.9 0.1499 P8 GC+SHH+1d culture AAAGAAAGTT (3) AATTGCACTT (2) ATTGAAAACT ATTTTTTTTC (2) CAAAAAAAAA (2) CAAAGAAAAA CAGCTTGTAA CATCCTGAGA (6) CTGAAGATCA GAAATAATGT GACAGCCTCA (5) GCAAAAAAAT (5) GCAACAAACT (4) GCAAGAAAAA (3) GGCAAAAAAA (2) GGCAAAGATT (6) GGTTAATGTT (2) GTTTTAAAAA (3) TACACACAAA (2) TATTTCAACT TATTTCAGTG (2) TCACACACCC TGAATCCTGA (6) TGGAATCCTG (5) TGGATCCCTG (5) TGGATCCTGA (5) TGGATCCTGG (2) TGGATTCTTA (2) TGGTTCTTGA (7) TGTAATAAGA (3) TGTCAGTTGT (6) TTAATAAAAT (3) TTGATCCTGG TTTATAAAAT TTTTCTGTTC (4) 165.2 0.1652 3T3 fibroblasts AAAAGATCTA (3) AATTGCACTT (2) CACAGAAAGT (6) CATCCTGAGA (6) GAGAGTAATA GCAACAAACT (4) GCCAGAAAGT (5) GGCAATATTA (6) TCCTCCACCA TGGATCCTGG (2) TGGTTCTTGA (7) TGTCAGTTGT (6) TTGATCCTGG 59.5 0.0595 E15 cortex AAAGAAAGTT (3) ATCAAATGGT (5) ATGGATGATT (5) ATTTTTTTTC (2) CAAAAAAAAA (2) CGGATCCTGA (5) GCAAGAAAGT (5) GCCAGAAAGT (5) GGCAAAGATT (6) GGCAATATTA (6) GGTTAATGTT (2) GTTTTAAAAA (3) TGGAATCCTG (5) TGGATCCTGA (5) TGGATTCTTA (2) TGTCAGTTGT (6) TTGATCCTGG 296.2 0.2962 P1 cortex AAAGAAAGTT (3) AATAATTTAA (2) ATTTTTTTTC (2) CAAAAAAAAA (2) CATAAAGATT (3) CCTGGCTCAC (5) GCAACAAACT (4) TATTTCAGTG (2) TGGATCCTGA (5) TGGATTCTTA (2) TGTAATAAGA (3) TGTGTGTGAA (2) TTAATAAAAT (3) 136 0.136 Hypothalamus AAAGAAAGTT (3) AATTGCACTT (2) AGAAAATCAG (5) ATAGCAGAGG (5) ATCAAATGGT (5) ATGGATGATT (5) ATTTTTTTTC (2) CAAAAAAAAA (2) CAAAGAAAAA CAGCTTGTAA CATAAAAAAA (6) CATAAAGATT (3) GCAAAAAAAT (5) GGCAAAAAAA (2) GGCAAAGATT (6) GGCAATATTA (6) GGGTTAATGG GGTTAATGTT (2) GTTAAATGTT (6) TATTTCAGTG (2) TCTGACCTGA (2) TGAATCCTGA (6) TGCATACATA TGGAATCCTG (5) TGGATCCTGA (5) TGGATCCTGG (2) TGGGATCTGA (3) TGGTTCCTGG (2) TGTGTGTGAA (2) TTAATAAAAT (3) TTAATAAAGA (2) TTGATCCTGG TTTTATAAAG 211.4 0.2114 E12.5 retina AAAAGATCTA (3) AATAATTTAA (2) AGAAAATCAG (5) ATTTTTTTTC (2) CAAAAAAAAA (2) CAAAGAAAAA CACAGAAAGT (6) CAGCTTGTAA CTGAAGATCA GAAATAATGT GAATTTGGCT (2) GCAACAAACT (4) GGCAAAGATT (6) GGCAATATTA (6) GGTTAATGTT (2) GTTTTAAAAA (3) TACACACAAA (2) TATTTCAGTG (2) TCACACACCC TCTGACCTGA (2) TGAATCCTGA (6) TGGATCCTGA (5) TGGTTCTTGA (7) TGTAATAAGA (3) TGTGTGTGAA (2) TTAATAAAAT (3) TTGAATAAAG (6) TTTAATAAAG (6) 150.7 0.1507 E14.5 retina AAAAGATCTA (3) AAAGAAAGTT (3) AATTGCACTT (2) AGAAAATCAG (5) ATAGCAGAGG (5) ATGGATGATT (5) ATTTTTTTTC (2) CAAAAAAAAA (2) CAAAGAAAAA CACAGGAAGC (5) CAGCTTGTCA (5) CATAAAGATT (3) CATCCTGAGA (6) CTGAAGATCA GAAATAATGT GGCAAAAAAA (2) GGCAAAGATT (6) GGCAATATTA (6) GGTTAATGTT (2) GTGCACCTGA (5) GTTAATAAAG (2) GTTAATGTTT (2) GTTTTAAAAA (3) TAAATCCTAA (5) TACACACAAA (2) TATTTCAGTG (2) TCACACACCC TCTGACCTGA (2) TGAATCCTGA (6) TGGATCCTAG TGGATCCTGA (5) TGGATCCTGG (2) TGGTTCCTGG (2) TGGTTCTTGA (7) TGTCAGTTGT (6) TGTGTGTGAA (2) TTAATAAAAT (3) TTAATAAAGA (2) TTGATCCTGG TTTAATAAAA (8) TTTAATAAAG (6) 243.7 0.2437 E16.5 retina AAAGAAAGTT (3) AATAATTTAA (2) ATTGAAAACT ATTTTTTTTC (2) CAAAAAAAAA (2) CAAAGAAAAA CAGCTTGTAA CAGCTTGTCA (5) CATCCCTGAT GAAAGAAAAT (5) GAAATAATGT GCAACAAACT (4) GCAAGAAAGT (5) GCCTTCCAAA (5) GGCAAAGATT (6) GGCAATATTA (6) GGTTAATGTT (2) GTGCACCTGA (5) GTTTTAAAAA (3) TAAATCCTAA (5) TATTTCAGTG (2) TCCTCCACCA TGAATCCTGA (6) TGGAATCCTG (5) TGGATCCTGA (5) TGGATCCTGG (2) TGGATTCTTA (2) TGGTTCCTGG (2) TGGTTCTTGA (7) TGTCAGTTGT (6) TGTGTGTGAA (2) TTAATAAAAT (3) TTGATCCTGG 149.7 0.1497 E18.5 retina AAAGAAAGTT (3) AATAATTTAA (2) AGAAAATCAG (5) ATCAAATGGT (5) ATTGAAAACT ATTTTTTTTC (2) CAAAAAAAAA (2) CAAAGAAAAA CATAAAAAAA (6) CATAAAGATT (3) CATCCCTGAT CATCCTGAGA (6) GAAATAATGT GCAAAAAATT (5) GCAACAAACT (4) GGCAAAGATT (6) GGCAATATTA (6) GGTTAATGTT (2) GTTAATAAAG (2) GTTTTAAAAA (3) TACACACAAA (2) TATTTCAGTG (2) TGCATACATA TGGAATCCTG (5) TGGTTCTTGA (7) TGTGTGTGAA (2) TTAATAAAAT (3) TTAATAAAGA (2) TTGAATAAAG (6) TTTAATAAAG (6) TTTTCTGTTC (4) 197.9 0.1979 P0.5 retina AATTGCACTT (2) ACAAAAGAAT (5) ATTTTTTTTC (2) CAAAAAAAAA (2) CAAAGAAAAA CATAAAGATT (3) CTGAAGATCA GAAATAATGT GAGAGTAATA GCAACAAACT (4) GCCTTCCAAA (5) GGCAAAGATT (6) GGCAATATTA (6) GGGCCCTTCA GTTAATAAAG (2) TATTTCAACT TATTTCAGTG (2) TGAATCCTGA (6) TGCATACATA TGGAATCCTG (5) TGGATCCTGA (5) TGGATCCTGG (2) TGTCAGTTGT (6) TGTGTGTGAA (2) TTAATAAAAT (3) TTGATCCTGG 243.9 0.2439 P2.5 retina AAAGAAAGTT (3) AATAATTTAA (2) AATTGCACTT (2) ACAAAAGAAT (5) AGAAAATCAG (5) ATCAAATGGT (5) ATGTTTGTTT (5) ATTGAAAACT ATTTTTTTTC (2) CAAAAAAAAA (2) CAAAGAAAAA CATAAAGATT (3) CTGAAGATCA GAAAGAAAAT (5) GAAATAATGT GAATTTGGCT (2) GCAAAAAATT (5) GGCAAAGATT (6) GGCAATATTA (6) GGTTAATGTT (2) GTTAAATGTT (6) GTTAATAAAG (2) GTTTTAAAAA (3) TACACACAAA (2) TATTTCAACT TATTTCAGTG (2) TCTGACCTGA (2) TGAATCCTGA (6) TGCATACATA TGGAATCCTG (5) TGGATCCTGA (5) TGGATCCTGG (2) TGGATTCTTA (2) TGGTTCTTGA (7) TGTAATAAGA (3) TGTCAGTTGT (6) TGTGTGTGAA (2) TTAATAAAAT (3) TTGATCCTGG TTTAATAAAG (6) TTTTCTGTTC (4) 210.1 0.2101 P4.5 retina AAAGAAAGTT (3) AATAATTTAA (2) AATTGCACTT (2) AGAAAATCAG (5) ATCAAATGGT (5) ATGTTTGTTT (5) ATTGAAAACT ATTTTTTTTC (2) CAAAAAAAAA (2) CATAAAGATT (3) GCCAGAAAGT (5) GGCAAAAAAA (2) GGCAAAGATT (6) GGCAATATTA (6) GGTTAATGTT (2) GTTAATAAAG (2) GTTTTAAAAA (3) TACACACAAA (2) TATTTCAGTG (2) TGAATCCTGA (6) TGCATACATA TGGAATCCTG (5) TGGATCCTAG TGGATCCTGA (5) TGGATCCTGG (2) TGGTTCTTGA (7) TGTCAGTTGT (6) TGTGTGTGAA (2) TTAATAAAAT (3) TTGATCCTGG TTTAATAAAA (8) TTTATAAAAT 194.7 0.1947 P6.5 retina AAAGAAAGTT (3) AATAAGTGAA (5) AATAATTTAA (2) ATTGAAAACT ATTTTTTTTC (2) CAAAAAAAAA (2) CAAAGAAAAA CACAGAAAGT (6) CAGCTTGTAA CATAAAAAAA (6) CATAAAGATT (3) CATCCTGAGA (6) GAAAGAAAAT (5) GAAATAATGT GAGAGTAATA GCCAATTTAA (5) GCCAGAAAGT (5) GGCAAAAAAA (2) GGCAAAGATT (6) GGCAATATTA (6) GGCCTTACTT (3) GGGCCCTTCA GGTTAATGTT (2) GTTTTAAAAA (3) TAAATCCTAA (5) TACACACAAA (2) TATTTCAGTG (2) TGAACAATGG (5) TGCATACATA TGGAATCCTG (5) TGGATCCTGA (5) TGGATCCTGG (2) TGGTTCTTGA (7) TGTAATAAGA (3) TGTCAGTTGT (6) TGTGTGTGAA (2) TTAATAAAAT (3) TTAATAAAGA (2) TTGATCCTGG TTTATAAAAT TTTGGTGTTT (7) 190.7 0.1907 P10.5 crx- retina AAAAGATCTA (3) AAAGAAAGTT (3) AATAATTTAA (2) AATTGCACTT (2) ATAGCAGAGG (5) CAAAAAAAAA (2) CATAAAGATT (3) CATCCCTGAT CATCCTGAGA (6) CTGAAGATCA GAAATAATGT GAGAGTAATA GGCAAAAAAA (2) GGCAAAGATT (6) GGCAATATTA (6) GGTTAATGTT (2) GTGCACCTGA (5) TATTTCAGTG (2) TCCTCCACCA TGGAATCCTG (5) TGGATCCTGA (5) TGGATCCTGG (2) TGGTTCTTGA (7) TGTGTGTGAA (2) TTAATAAAAT (3) TTAATAAAGA (2) TTTGGTGTTT (7) 225.4 0.2254 P10.5 crx+ retina AAAGAAAGTT (3) AATAATTTAA (2) AGAAAATCAG (5) ATTTTTTTTC (2) CAAAAAAAAA (2) CACAGGAAGC (5) CATAAAGATT (3) CTGAAGATCA GAAATAATGT GCAAAAAAAT (5) GCAACAAACT (4) GCCAATTTAA (5) GGCAAAAAAA (2) GGCAAAGATT (6) GGCAATATTA (6) GGCCTTACTT (3) GGTTAATGTT (2) TACACACAAA (2) TATTTCAGTG (2) TGAACAATGG (5) TGCATACATA TGGAATCCTG (5) TGGATCCTAG TGGATCCTGA (5) TGGATCCTGG (2) TGGATTCTTA (2) TGGTTCTTGA (7) TGTCAGTTGT (6) TTAATAAAAT (3) TTTAATAAAA (8) TTTTCTGTTC (4) 199.4 0.1994 Adult retinal ATCATTTTGG (2) ATGAACACTG (9) ATTTTTTTTC (2) CAAAAAAAAA (2) CAAAGAAAAA CATAAAGATT (3) CCTGGCTCAC (5) GAAATAATGT GCAACAAACT (4) GCAAGAAAAA (3) GGCAAAGATT (6) GGCCTTACTT (3) GGGCCCTTCA GGTTAATGTT (2) TATTTCAGTG (2) TGAATCCTGA (6) TGGATCCTGA (5) TGGATCCTGG (2) TGGTTCCTGG (2) TGGTTCTTGA (7) TGTCAGTTGT (6) TGTGTGTGAA (2) TTAATAAAGA (2) TTGATCCTGG TTTAATAAAA (8) TTTGGTGTTT (7) 148.9 0.1489 ONL AAAGAAAGTT (3) ATCAAATGGT (5) ATCATTTTGG (2) ATGAACACTG (9) ATGGATGATT (5) ATTTTTTTTC (2) CAAAAAAAAA (2) CATAAAGATT (3) CATCCTGAGA (6) GAAAGAAAAT (5) GACAGCCTCA (5) GCAAGAAAGT (5) GGCAAAGATT (6) GGCCTTACTT (3) GTTTTAAAAA (3) TATTTCAGTG (2) TCTGACCTGA (2) TGGAATCCTG (5) TGGATCCTGA (5) TGGTTCCTGG (2) TGGTTCTTGA (7) TGTGTGTGAA (2) TTAATAAAAT (3) TTAATAAAGA (2) TTGATCCTGG TTTTATAAAG 118.2 0.1182