Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.289645	Gtl2	GTL2, imprinted maternally expressed untranslated mRNA	12	12 F1 (12 54.0 cM)	17263
Human Homolog	MEG3[maternally expressed 3]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 304 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC ATCATCTCCT GCCTTGACCT (2) GGTCCTTGGG GTGCTTTCAA GTGGCTGGTG (2) GTGGGAGGAA (2) TAGTTCAAGG TCCCCTCCCC TGTAATACAA (2) TGTGGAGGAG (2) TTAAGTAAAA 43.7 0.0437 Cb medulloblastoma ATGGGGTTGG (2) CACACACGCA (2) CATAGCCTAA CTAAGTAAAA GCCTTGACCT (2) GGTCCTTGGG GGTGGGGGAG GTGCTTTCAA GTGGCTGGTG (2) GTGGGAGGAA (2) TGCCCAGTGC (2) TGTAATACAA (2) TGTGGAGGAG (2) 83.1 0.0831 P8 GC+1d culture ATGGGGTTGG (2) CACACACGCA (2) CTGGAACCCA CTGTCCTAAC CTTCTAAGCA (2) GCAATGGCCT GCCTTGACCT (2) GTGCTTTCAA GTGGCTGGTG (2) GTGGGAGGAA (2) TGTGGAGGAG (2) TGTGGGAGGC (2) TTAAGTAAAA 61.4 0.0614 P8 GC+SHH+1d culture ATGGGGTTGG (2) GCAATGGCCT GCCTTGACCT (2) GGTCCTTGGG GTGCTTTCAA GTGGCTGGTG (2) GTGGGAGGAA (2) TGCCAAGTTC (2) TGTGGAGGAG (2) TGTGGGAGGC (2) TTAAGGAAGA (2) 51.7 0.0517 3T3 fibroblasts GTCATAGCTG (2) GTGGCTGGTG (2) GTGGGAGGAA (2) TGTGGAGGAG (2) TGTGGGAGGC (2) 59.5 0.0595 E15 cortex ACTGAATTAG ATGGGGTTGG (2) CAAAGAGAAC GGGATGGGGA GTCATAGCTG (2) GTGGCTGGTG (2) TGCCCAGTGC (2) TGTGGAGGAG (2) 64 0.064 P1 cortex ACTGAATTAG AGAGCAAATG AGCTTGGCCT (2) ATCCTAGGTC ATGGGGTTGG (2) CTAAGTAAAA GGGATGGCCA GTGCTTTCAA GTGGCTGGTG (2) GTGGGAGGAA (2) TGCCCAGTGC (2) 245.4 0.2454 Hypothalamus AATAGGGGGC ACCTGAGCTC AGAGCAAATG AGCTTGGCCT (2) ATCCTAGGTC ATGGGGTTGG (2) CAAAGAGAAC CACACACGCA (2) CAGCGGAGAG CATAGCCTAA CCGGCTGAAG CTAAGTAAAA CTAGGGGAGG CTGTCCTAAC GACCCTGAGA GAGGCTTGAA GCAATGGCCT GCCTTGACCT (2) GGGATGGCCA GGGATGGGGA GGGGTGGGGC GGTGGGGGAG GTGCTTTCAA GTGGCTGGTG (2) GTGGGAGGAA (2) TGCCAAGTTC (2) TGCCCAGTGC (2) TGTAATACAA (2) TGTCTCAACC TGTGGAGGAG (2) TTAAGGAAGA (2) 244.1 0.2441 E12.5 retina CATAGCCTAA CTGGAACCCA GCCTTGACCT (2) GGGATGGGGA GTGCTTTCAA GTGGCTGGTG (2) GTGGGAGGAA (2) TGCCAAGTTC (2) TGTGGAGGAG (2) 60.2 0.0602 E14.5 retina ATCATCTCCT ATCCTAGGTC ATGGGGTTGG (2) CACACACGCA (2) CTGTCCTAAC GCAATGGCCT GCCGGTGGGC GTGCTTTCAA GTGGCTGGTG (2) GTGGGAGGAA (2) TAGTTCAAGG TGCCCAGTGC (2) TGTGGAGGAG (2) TTAAGTAAAA 69.1 0.0691 E16.5 retina ACTGAATTAG ATGGGGTTGG (2) CACACAGGCA CCGGCTGAAG CTAAGTAAAA CTTCTAAGCA (2) GACCCTGAGA GCAATGGCCT GCCTTGACCT (2) GGGATGGGGA GTCAGTGTCT GTGCTTTCAA GTGGCTGGTG (2) GTGGGAGGAA (2) TAGTTCAAGG TGCCCAGTGC (2) TGTGGAGGAG (2) TTAAGGAAGA (2) 101.2 0.1012 E18.5 retina AGAGCAAATG CAGCGGAGAG CATAGCCTAA CTAAGTAAAA CTGTCCTAAC GCAATGGCCT GCCTTGACCT (2) GGGATGGCCA GTGCTTTCAA GTGGCTGGTG (2) TAGTTCAAGG TGCCCAGTGC (2) TGTAATACAA (2) TGTGGAGGAG (2) TTAAGGAAGA (2) TTAAGTAAAA 125.3 0.1253 P0.5 retina ACTGAATTAG AGCTTGGCCT (2) ATCCTAGGTC ATGGGGTTGG (2) CACACAGGCA CTAAGTAAAA CTGGAACCCA CTTCTAAGCA (2) GCAATGGCCT GGGATGGCCA GTCATAGCTG (2) GTGCTTTCAA GTGGCTGGTG (2) GTGGGAGGAA (2) TGCCCAGTGC (2) 125.7 0.1257 P2.5 retina ACTGAATTAG AGCTTGGCCT (2) ATCCTAGGTC ATGGGGTTGG (2) CTAAGTAAAA GCCGGTGGGC GCCTTGACCT (2) GGGATGGCCA GGGGTGGGGC GTCATAGCTG (2) GTGCTTTCAA GTGGCTGGTG (2) GTGGGAGGAA (2) TGCCAAGTTC (2) TGCCCAGTGC (2) TGTAATACAA (2) TGTGGAGGAG (2) TTAAGGAACA 144.5 0.1445 P4.5 retina AGAAACCTGT (2) AGAGCAAATG ATCATCTCCT ATGGGGTTGG (2) CACACACGCA (2) CACACAGGCA CTAAGTAAAA GACCCTGAGA GCCTTGACCT (2) GGGATGGCCA GGGATGGGGA GTCAGTGTCT GTCATAGCTG (2) GTGCTTTCAA GTGGCTGGTG (2) GTGGGAGGAA (2) TGCCCAGTGC (2) TGTGGAGGAG (2) 170.4 0.1704 P6.5 retina AGAGCAAATG AGCTTGGCCT (2) ATCATCTCCT ATGGGGTTGG (2) CACACACGCA (2) CACACAGGCA CAGCGGAGAG CATAGCCTAA CTAAGTAAAA CTTCTAAGCA (2) GCCGGTGGGC GCCTTGACCT (2) GGGATGGCCA GTCAGTGTCT GTCATAGCTG (2) GTGCTTTCAA GTGGCTGGTG (2) GTGGGAGGAA (2) TGCCCAGTGC (2) TGTAATACAA (2) TGTGGAGGAG (2) TTAAGTAAAA 128.5 0.1285 P10.5 crx- retina ACCTGAGCTC AGAGCAAATG ATCCTAGGTC ATGGGGTTGG (2) CACACACGCA (2) CACACAGGCA CCGGCTGAAG CTAAGTAAAA CTGGAACCCA GCAATGGCCT GCCTTGACCT (2) GGGATGGCCA GGGATGGGGA GTCAGTGTCT GTGCTTTCAA GTGGCTGGTG (2) GTGGGAGGAA (2) TCCCCTCCCC TGCCCAGTGC (2) TGTGGAGGAG (2) TTAAGGAAGA (2) 130.5 0.1305 P10.5 crx+ retina AGAAACCTGT (2) AGCTTGGCCT (2) ATCCTAGGTC ATGGGGTTGG (2) CACACACGCA (2) CACACAGGCA CATAGCCTAA CTAAGTAAAA CTTCTAAGCA (2) GCAATGGCCT GCCTTGACCT (2) GGGGTGGGGC GTCAGTGTCT GTGCTTTCAA GTGGCTGGTG (2) GTGGGAGGAA (2) TGCCCAGTGC (2) TGTGGAGGAG (2) TTAAGTAAAA 142.1 0.1421 Adult retinal ACTGAATTAG AGAAACCTGT (2) ATCCTAGGTC ATGGGGTTGG (2) CAAAGAGAAC CTAAGTAAAA GCAATGGCCT GCCTTGACCT (2) GGGATGGCCA GGTGGGGGAG GTCATAGCTG (2) GTGCTTTCAA GTGGCTGGTG (2) GTGGGAGGAA (2) TGCCAAGTTC (2) TGCCCAGTGC (2) TGTAATACAA (2) TGTGGAGGAG (2) 113.4 0.1134 ONL AGAGCAAATG ATGGGGTTGG (2) CACACACGCA (2) CACACAGGCA CTTCTAAGCA (2) GCCTTGACCT (2) GGTCCTTGGG GTCATAGCTG (2) GTGCTTTCAA GTGGCTGGTG (2) GTGGGAGGAA (2) TCCCCTCCCC TGTAATACAA (2) 47.7 0.0477