Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.289702 Syt1synaptotagmin 1 10  10 D1 (10 58.0 cM)  20979 
 Mm.289702 5330428N10RikRIKEN cDNA 5330428N10 gene 10    78277 
 Mm.289702 6430709C05RikRIKEN cDNA 6430709C05 gene 10    76240 
 Mm.289702 A130086K04RikRIKEN cDNA A130086K04 gene 10    319988 
 Mm.289702 2900074G08RikRIKEN cDNA 2900074G08 gene 10    72989 
 Mm.289702 C030018G05RikRIKEN cDNA C030018G05 gene 10    77388 
 Mm.289702 C030044C18RikRIKEN cDNA C030044C18 gene 10    77637 
 Clusters 
   Neighbors    

Total 3 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 46 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCGGGTTGGCCG (9)
1.60.0016
Cb medulloblastomaAGCCGGTGAC (7)
GACACTCAAT (7)
GGGTTGGCCG (9)
101.70.1017
P8 GC+1d cultureGACACTCAAT (7)
GGAGATGATA (8)
10.20.0102
P8 GC+SHH+1d cultureGACACTCAAT (7)
GGGTTCACTA (9)
GGGTTGGCCG (9)
14.10.0141
3T3 fibroblastsTTGGCCAGGA (7)
3.50.0035
E15 cortexGACACTCAAT (7)
GGGTTGGCCG (9)
14.80.0148
P1 cortexGACACTCAAT (7)
22.70.0227
HypothalamusGACACTCAAT (7)
GGAGATGATA (8)
GGGTTCACTA (9)
92.30.0923
E12.5 retinaGACACTCAAT (7)
3.80.0038
E14.5 retinaGACACTCAAT (7)
14.60.0146
E16.5 retinaAGCCGGTGAC (7)
GACACTCAAT (7)
GGGTTCACTA (9)
GGGTTGGCCG (9)
18.10.0181
E18.5 retinaAAAAGATGAA (7)
GACACTCAAT (7)
GGGTTCACTA (9)
30.90.0309
P0.5 retinaGACACTCAAT (7)
5.90.0059
P2.5 retinaGACACTCAAT (7)
40.50.0405
P4.5 retinaAAAAGATGAA (7)
GACACTCAAT (7)
GGAGATGATA (8)
65.40.0654
P6.5 retinaGACACTCAAT (7)
GGGTTCACTA (9)
GGGTTGGCCG (9)
78.40.0784
P10.5 crx- retinaGACACTCAAT (7)
GGGTTCACTA (9)
GGGTTGGCCG (9)
37.20.0372
P10.5 crx+ retinaGACACTCAAT (7)
GGGTTCACTA (9)
TTGGCCAGGA (7)
126.80.1268
Adult retinalAGCCGGTGAC (7)
GACACTCAAT (7)
GGAGATGATA (8)
GGGTTCACTA (9)
GGGTTGGCCG (9)
68.60.0686
ONLAAAAGATGAA (7)
GACACTCAAT (7)
84.30.0843