Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.289936	Psat1	phosphoserine aminotransferase 1	19	19 32.5 cM	107272
Mm.289936	AL024083	expressed sequence AL024083	19		404582
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 108 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAAAGATCTA (3) AACAAAAAAA (2) AACAACCAGA (2) ACCAGCCACG (4) GAAAACATTA (5) GAATACATTA (4) GGAAGCCACC (2) 26 0.026 Cb medulloblastoma AACAAAAAAA (2) ACCAGCCACG (4) GAAAACATTA (5) GAATACATTA (4) GAGATCTGCT GGACCCCGGG (2) GGGAGGGGGG (2) TGACCTGGGA (4) 27.6 0.0276 P8 GC+1d culture AAAAGATCTA (3) AACAAAAAAA (2) GAAAACATTA (5) GAGATCTGCT GGACCCCGGG (2) GGATTTTTTT (3) GGCTGAACAA (2) GGGAGGGGGG (2) TGACCTGGGA (4) 20.3 0.0203 P8 GC+SHH+1d culture AACAAAAAAA (2) GAAAACATTA (5) GAGATCTGCT GGAAGCCACC (2) GGACCCCGGG (2) GGATTTTTTT (3) GGCTGAACAA (2) GGGAGGGGGG (2) 31.8 0.0318 3T3 fibroblasts AAAAGATCTA (3) TGACCTGGAA (2) TGACCTGGGA (4) 17.5 0.0175 E15 cortex AACAAAAAAA (2) GAAAGTCACG 9.8 0.0098 P1 cortex CTTATTACAG (3) GGGAGGGGGG (2) 9 0.009 Hypothalamus AACAAAAAAA (2) GAAAACATTA (5) GAATACATTA (4) GGAAGCCACC (2) GGGAGGGGGG (2) TGACCTGGGA (4) 34.3 0.0343 E12.5 retina AAAAGATCTA (3) AACAAAAAAA (2) GAAAACATTA (5) GGACCCCGGG (2) GGGAGGGGGG (2) 24.5 0.0245 E14.5 retina AAAAGATCTA (3) AACAAAAAAA (2) GAAAACATTA (5) GAAGCAACCA (3) GGACCCCGGG (2) TCCCTCAACT (4) 23.6 0.0236 E16.5 retina AACAACCAGA (2) GAAAACATTA (5) GAAAGTCACG GAATACATTA (4) GAGATCTGCT GGAAGCCACC (2) GGCTGAACAA (2) TCCCTCAACT (4) 27.1 0.0271 E18.5 retina AACAAAAAAA (2) AACAACCAGA (2) ACCAGCCACG (4) GAAAACATTA (5) GAGATCTGCT GGAAGCCACC (2) GGACCCCGGG (2) GGATTTTTTT (3) 25.4 0.0254 P0.5 retina AACAAAAAAA (2) GAAAACATTA (5) GAGATCTGCT GGAAGCCACC (2) GGGAGGGGGG (2) 17.7 0.0177 P2.5 retina AACAAAAAAA (2) ACCAGCCACG (4) GAAAACATTA (5) GAAGCAACCA (3) GGAAGCCACC (2) GGACCCCGGG (2) TCCCTCAACT (4) TGACCTGGGA (4) 33.7 0.0337 P4.5 retina AACAAAAAAA (2) ACCAGCCACG (4) GAAAACATTA (5) TGACCTGGGA (4) 23.9 0.0239 P6.5 retina GAAAACATTA (5) 13.3 0.0133 P10.5 crx- retina AAAAGATCTA (3) AACAAAAAAA (2) GAAAACATTA (5) GAAAGTCACG GAATACATTA (4) GAGATCTGCT TGACCTGGGA (4) 22.4 0.0224 P10.5 crx+ retina AACAAAAAAA (2) AACAACCAGA (2) GAAAACATTA (5) GAAAGTCACG GAATACATTA (4) GGAAGCCACC (2) TGACCTGGGA (4) 19.1 0.0191 Adult retinal TCCCTCAACT (4) TGACCTGGAA (2) TGACCTGGGA (4) 5.7 0.0057 ONL TGACCTGGGA (4) 3.8 0.0038