Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.29044	B230110O18Rik	RIKEN cDNA B230110O18 gene	14		77844
Mm.29044	AI448102	expressed sequence AI448102	14		328419
Mm.29044	5033406L14Rik	RIKEN cDNA 5033406L14 gene	14		75965
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 69 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC CTATTAAATA (4) TACAAATGTA (2) TGACAGATGT (2) 11.4 0.0114 Cb medulloblastoma TGCACTATGG (3) TTTAAAAAAA (3) 9.2 0.0092 P8 GC+1d culture CTATTAAATA (4) TACAAATGTA (2) TGACAGATGT (2) TGCACTATGG (3) 50.2 0.0502 P8 GC+SHH+1d culture ATTACAGACA (4) CTATTAAATA (4) GTAGGAAACA (3) TACAAATGTA (2) TTTAAAAAAA (3) 35.3 0.0353 3T3 fibroblasts TGCACTATGG (3) 7 0.007 E15 cortex CTATTAAATA (4) 4.9 0.0049 P1 cortex CTATTAAATA (4) 9.1 0.0091 Hypothalamus CTATTAAATA (4) TACAAATATG TGCACTATGG (3) TTTAAAAAAA (3) 29 0.029 E12.5 retina CTATTAAATA (4) GGATTTGGGG (3) TGACAGATGT (2) TTTAAAAAAA (3) 20.7 0.0207 E14.5 retina CTATTAAATA (4) TGACAGATGT (2) TTTAAAAAAA (3) 36.4 0.0364 E16.5 retina CTATTAAATA (4) TATAAATATT TTTAAAAAAA (3) 21.7 0.0217 E18.5 retina CTATTAAATA (4) GGATTTGGGG (3) TGACAGATGT (2) TTTAAAAAAA (3) 36.3 0.0363 P0.5 retina ATTACAGACA (4) CTATTAAATA (4) GTAGGAAACA (3) TGACAGATGT (2) TGCACTATGG (3) TTTAAAAAAA (3) 21.7 0.0217 P2.5 retina CTATTAAATA (4) GTAGGAAACA (3) TGACAGATGT (2) TTTAAAAAAA (3) 21.2 0.0212 P4.5 retina ATTACAGACA (4) CTATTAAATA (4) TATAAATATT TTTAAAAAAA (3) 31.7 0.0317 P6.5 retina ATTACAGACA (4) CTATTAAATA (4) TACAAATATG TACAAATGTA (2) TGACAGATGT (2) TGCACTATGG (3) TTTAAAAAAA (3) 33.5 0.0335 P10.5 crx- retina ATTACAGACA (4) CTATTAAATA (4) TACAAATATG TACAAATGTA (2) TATAAATATT 29.8 0.0298 P10.5 crx+ retina CTATTAAATA (4) TACAAATATG TGACAGATGT (2) 19.2 0.0192 Adult retinal CTATTAAATA (4) TACAAATGTA (2) TGCACTATGG (3) 5.7 0.0057 ONL CTATTAAATA (4) TTTAAAAAAA (3) 13.4 0.0134