Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.291274 Rerearginine glutamic acid dipeptide (RE) repeats 4    68703 
 Mm.291274 E230012J19RikRIKEN cDNA E230012J19 gene 4    319664 
 Mm.291274 9430064G09RikRIKEN cDNA 9430064G09 gene 4    319852 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 123 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAGACCCTGTC (2)
AGATAACACA (3)
CCAGCCACAG (2)
GCAAACTACT (3)
GGATAGAAAG (2)
GGGCAGTAGG
TACACACACA (2)
TTGGTGGAGG
22.60.0226
Cb medulloblastomaAGACCCTGTC (2)
GGATAGAAAG (2)
TACACACACA (2)
TGCAGTGGCA (3)
36.90.0369
P8 GC+1d cultureAGACCCTGTC (2)
AGATAACACA (3)
CCACCACTTC (3)
CCAGCCACAG (2)
CCCCCACTTC
GAGCATTTTG
GGATAGAAAG (2)
GGGCAGCTAG (3)
GGGCAGTAGG
GTCCTGGGCT (4)
TTGGTGGAGG
320.032
P8 GC+SHH+1d cultureAGACCCTGTC (2)
AGATAACACA (3)
CCACCACTTC (3)
CCAGCCACAG (2)
CCCCCACTTC
CTGCTGCCCT (5)
GGATAGAAAG (2)
TTGGTGGAGG
15.30.0153
3T3 fibroblastsGTCCTGGGCT (4)
3.50.0035
E15 cortexAGACCCTGTC (2)
CCACCACTTC (3)
CTGCTGCCCT (5)
GGATAGAAAG (2)
TGCAGTGGCA (3)
TTGGTGGAGG
44.30.0443
P1 cortexAGACCCTGTC (2)
CCAGCCACAG (2)
CTGCTGCCCT (5)
13.50.0135
HypothalamusAGACCCTGTC (2)
GGATAGAAAG (2)
GGGCAGCTAG (3)
GTCCTGGGCT (4)
TACACACACA (2)
23.40.0234
E12.5 retinaAAGGCTTGTT (2)
AGACCCTGTC (2)
CCACCACTTC (3)
CCAGCCACAG (2)
CTGCTGCCCT (5)
GGATAGAAAG (2)
GGGCAGCTAG (3)
TACACACACA (2)
24.50.0245
E14.5 retinaAGACCCTGTC (2)
CCAGCCACAG (2)
CCCCCACTTC
CTGCTGCCCT (5)
GCAGCATTTG (2)
TACACACACA (2)
200.02
E16.5 retinaAGACCCTGTC (2)
CCACCACTTC (3)
CCAGCCACAG (2)
CTGCTGCCCT (5)
GCAGCATTTG (2)
TACACACACA (2)
21.60.0216
E18.5 retinaAGACCCTGTC (2)
CCACCACTTC (3)
CCAGCCACAG (2)
GCAGCATTTG (2)
GGATAGAAAG (2)
TACACACACA (2)
19.90.0199
P0.5 retinaAGACCCTGTC (2)
CCACCACTTC (3)
CCAGCCACAG (2)
CTGCTGCCCT (5)
GGATAGAAAG (2)
TACACACACA (2)
19.70.0197
P2.5 retinaAGACCCTGTC (2)
CCAGCCACAG (2)
GGATAGAAAG (2)
GGGCAGCTAG (3)
21.10.0211
P4.5 retinaAGACCCTGTC (2)
CAGGCACAAC
CTGCTGCCCT (5)
GAGCATTTTG
TACACACACA (2)
17.90.0179
P6.5 retinaAGACCCTGTC (2)
CCACCACTTC (3)
CCAGCCACAG (2)
GGATAGAAAG (2)
GGGCAGCTAG (3)
TACACACACA (2)
26.80.0268
P10.5 crx- retinaAAGGCTTGTT (2)
AGACCCTGTC (2)
AGATAACACA (3)
CCAGCCACAG (2)
CTGCTGCCCT (5)
GCAAACTACT (3)
GCAGCATTTG (2)
GGATAGAAAG (2)
GGGCAGTAGG
GTCCTGGGCT (4)
TACACACACA (2)
48.50.0485
P10.5 crx+ retinaAAGGCTTGTT (2)
AGACCCTGTC (2)
AGATAACACA (3)
GGATAGAAAG (2)
GGGCAGCTAG (3)
GGGCAGTAGG
TACACACACA (2)
32.60.0326
Adult retinalAGACCCTGTC (2)
CCACCACTTC (3)
CCAGCCACAG (2)
CTGCTGCCCT (5)
TACACACACA (2)
33.50.0335
ONLAAGGCTTGTT (2)
AGACCCTGTC (2)
AGATAACACA (3)
CAGGCACAAC
CCAGCCACAG (2)
GGATAGAAAG (2)
TACACACACA (2)
43.90.0439