Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.292405 Za20d2zinc finger, A20 domain containing 2 19  19 B (19 15.0 cM)  22682 
 Mm.292405 D14Mgi24DNA Segment, Chr 14, Mouse Genome Informatics 24 14    105600 
 Mm.292405 5830475F03RikRIKEN cDNA 5830475F03 gene 19    76103 
 Clusters 
   Neighbors    

Total 11 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 114 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATTATGTGCA (4)
CTATTCAGCA (3)
CTTTTCAGCA (5)
GCCATTTTCC (4)
GGCTGCATTA (4)
TAGTAATTTT (3)
TGTGAGCCTG (3)
TTTGCAGCAT (6)
30.80.0308
Cb medulloblastomaATTATGTGCA (4)
CTATTCAGCA (3)
CTTTTCAGCA (5)
TAGTAATTTT (3)
TGAAGAGACT (4)
TGTGAGCCTG (3)
TTTGCAGCAT (6)
36.90.0369
P8 GC+1d cultureCCTCACTTAA (5)
CTATTCAGCA (3)
CTTTTCAGCA (5)
GCCATTTTCC (4)
GGCTGCATTA (4)
TGCATCTTTT (5)
TGTGAGCCTG (3)
TTTGCAGCAT (6)
66.10.0661
P8 GC+SHH+1d cultureATTATGTGCA (4)
CCTCACTTAA (5)
CTATTCAGCA (3)
CTTTTCAGCA (5)
GCCATTTTCA (5)
GCCATTTTCC (4)
GGCTGCATTA (4)
TGAAGAGACT (4)
TTTGCAGCAT (6)
65.70.0657
3T3 fibroblastsCTTTTCAGCA (5)
GGCTGCATTA (4)
210.021
E15 cortexCTATTCAGCA (3)
CTTTTCAGCA (5)
TGCATCTTTT (5)
TGTGAGCCTG (3)
TTTGCAGCAT (6)
34.40.0344
P1 cortexCTATTCAGCA (3)
CTTTTCAGCA (5)
27.20.0272
HypothalamusATTATGTGCA (4)
CCTCACTTAA (5)
CTATTCAGCA (3)
CTTTTCAGCA (5)
TGTGAGCCTG (3)
TTTGCAGCAT (6)
21.70.0217
E12.5 retinaATTATGTGCA (4)
CCTCACTTAA (5)
CTATTCAGCA (3)
CTTTTCAGCA (5)
GCCATTTTCC (4)
GGCTGCATTA (4)
TGTGAGCCTG (3)
TTTGCAGCAT (6)
47.10.0471
E14.5 retinaCCTCACTTAA (5)
CTATTCAGCA (3)
CTTTTCAGCA (5)
GCCATTTTCC (4)
GGCTGCATTA (4)
TGCATCTTTT (5)
TGTGAGCCTG (3)
TTTGCAGCAT (6)
47.30.0473
E16.5 retinaCCTCACTTAA (5)
CTATTCAGCA (3)
CTTTTCAGCA (5)
GGCTGCATTA (4)
TGTGAGCCTG (3)
39.80.0398
E18.5 retinaCCTCACTTAA (5)
CTATTCAGCA (3)
CTTTTCAGCA (5)
25.50.0255
P0.5 retinaATTATGTGCA (4)
CCTCACTTAA (5)
CTATTCAGCA (3)
CTTTTCAGCA (5)
GGCTGCATTA (4)
TGTGAGCCTG (3)
23.70.0237
P2.5 retinaCCTCACTTAA (5)
CTATTCAGCA (3)
CTTTTCAGCA (5)
GCCATTTTCC (4)
GGCTGCATTA (4)
TGTGAGCCTG (3)
510.051
P4.5 retinaATTATGTGCA (4)
CCTCACTTAA (5)
CTATTCAGCA (3)
CTTTTCAGCA (5)
TGTGAGCCTG (3)
TTTGCAGCAT (6)
39.60.0396
P6.5 retinaCCTCACTTAA (5)
CTATTCAGCA (3)
CTTTTCAGCA (5)
TGTGAGCCTG (3)
TTTGCAGCAT (6)
38.40.0384
P10.5 crx- retinaCCTCACTTAA (5)
CTATTCAGCA (3)
CTTTTCAGCA (5)
GGCTGCATTA (4)
TTTGCAGCAT (6)
280.028
P10.5 crx+ retinaCCTCACTTAA (5)
CTATTCAGCA (3)
CTTTTCAGCA (5)
TGAAGAGACT (4)
TGTGAGCCTG (3)
TTTGCAGCAT (6)
28.70.0287
Adult retinalCCTCACTTAA (5)
CTATTCAGCA (3)
CTTTTCAGCA (5)
TTTGCAGCAT (6)
33.40.0334
ONLCCTCACTTAA (5)
CTATTCAGCA (3)
CTTTTCAGCA (5)
GCCATTTTCC (4)
TTTGCAGCAT (6)
36.40.0364