Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.293321 Ubxd2UBX domain containing 2 1    67812 
 Mm.293321 AA517465expressed sequence AA517465 1    98209 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 136 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCCTTTAATCC (355)52.20.0522
P8 Cb GCGCTGTTCAAA (4)4.90.0049
P8 Cb GCCCTTTGATCC (22)3.30.0033
P8 Cb GCAAATAGCTGG (2)1.60.0016
P8 Cb GCCGTGCACACA (2)1.60.0016
P8 Cb GCGAACCTAAGC (2)1.60.0016
P8 Cb GCGATGTTCAAA (3)1.60.0016
P8 Cb GCGTGGCTCACC (9)1.60.0016
P8 Cb GCGTTGAAAAAA (2)1.60.0016
Cb medulloblastomaCCTTTAATCC (355)41.60.0416
Cb medulloblastomaGCTGTTCAAA (4)16.20.0162
Cb medulloblastomaGTGGCTCACC (9)4.60.0046
Cb medulloblastomaCCTTTGATCC (22)2.30.0023
Cb medulloblastomaGATGTTCAAA (3)2.30.0023
Cb medulloblastomaGTAAAGATGA (5)2.30.0023
Cb medulloblastomaGTTGAAAAAA (2)2.30.0023
Cb medulloblastomaTTTCCCAGAA (2)2.30.0023
P8 GC+1d cultureCCTTTAATCC (355)320.032
P8 GC+1d cultureGCTGTTCAAA (4)4.60.0046
P8 GC+1d cultureGTGGCTCACC (9)3.40.0034
P8 GC+1d cultureGTTGAAAAAA (2)3.40.0034
P8 GC+1d cultureAAATAGCTGG (2)2.30.0023
P8 GC+1d cultureCCTTTGATCC (22)1.10.0011
P8 GC+1d cultureCGTGCACACA (2)1.10.0011
P8 GC+1d cultureTTCATTTAGA (4)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureCCTTTAATCC (355)25.80.0258
P8 GC+SHH+1d cultureGCTGTTCAAA (4)70.007
P8 GC+SHH+1d cultureAAATAGCTGG (2)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureGTGGCTCACC (9)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureGTTGAAAAAA (2)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureCCTTTGATCC (22)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureCGTGCACACA (2)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureGTAAAGATGA (5)1.20.0012
3T3 fibroblastsCCTTTAATCC (355)70.10.0701
3T3 fibroblastsGTGGCCTTGG (4)10.50.0105
3T3 fibroblastsGATGTTCAAA (3)70.007
3T3 fibroblastsTTTCCCAGAA (2)70.007
3T3 fibroblastsAAATAGCTGG (2)3.50.0035
3T3 fibroblastsGTGGCTCACC (9)3.50.0035
E15 cortexCCTTTAATCC (355)54.40.0544
E15 cortexGCTGTTCAAA (4)14.80.0148
E15 cortexGTGGCTCACC (9)9.90.0099
E15 cortexTTTCCCAGAA (2)9.90.0099
P1 cortexCCTTTAATCC (355)154.50.1545
P1 cortexCCTTTGATCC (22)13.60.0136
P1 cortexAAATAGCTGG (2)4.50.0045
P1 cortexGCTGTTCAAA (4)4.50.0045
P1 cortexGTAAAGATGA (5)4.50.0045
P1 cortexGTGGCTCACC (9)4.50.0045
P1 cortexTTTGACTTTT (3)4.50.0045
HypothalamusCCTTTAATCC (355)19.90.0199
HypothalamusGCTGTTCAAA (4)10.90.0109
HypothalamusGTGGCTCACC (9)3.60.0036
HypothalamusCGTGCACACA (2)1.80.0018
HypothalamusGCAAGGAACA (14)1.80.0018
E12.5 retinaCCTTTAATCC (355)75.10.0751
E12.5 retinaGCTGTTCAAA (4)7.50.0075
E12.5 retinaCCTTTGATCC (22)5.60.0056
E12.5 retinaAAATAGCTGG (2)3.80.0038
E12.5 retinaGATGTTCAAA (3)3.80.0038
E12.5 retinaGTGGCTCACC (9)1.90.0019
E12.5 retinaTTCATTTAGA (4)1.90.0019
E14.5 retinaCCTTTAATCC (355)120.30.1203
E14.5 retinaGTGGCTCACC (9)3.60.0036
E14.5 retinaAAATAGCTGG (2)1.80.0018
E14.5 retinaCCTTTGATCC (22)1.80.0018
E14.5 retinaGCTGTTCAAA (4)1.80.0018
E14.5 retinaTTTGACTTTT (3)1.80.0018
E16.5 retinaCCTTTAATCC (355)68.80.0688
E16.5 retinaGCTGTTCAAA (4)7.20.0072
E16.5 retinaCCTTTGATCC (22)3.60.0036
E16.5 retinaGTGGCTCACC (9)3.60.0036
E16.5 retinaGTTGAAAAAA (2)3.60.0036
E16.5 retinaCGTGCACACA (2)1.80.0018
E18.5 retinaGCTGTTCAAA (4)27.30.0273
E18.5 retinaCCTTTAATCC (355)23.60.0236
E18.5 retinaGTGGCTCACC (9)9.10.0091
E18.5 retinaAAATAGCTGG (2)3.60.0036
E18.5 retinaGATGTTCAAA (3)3.60.0036
E18.5 retinaCCTTTGATCC (22)1.80.0018
P0.5 retinaCCTTTAATCC (355)72.60.0726
P0.5 retinaGCTGTTCAAA (4)5.90.0059
P0.5 retinaGTGGCTCACC (9)5.90.0059
P0.5 retinaAAATAGCTGG (2)3.90.0039
P0.5 retinaCCTTTGATCC (22)20.002
P0.5 retinaGCAAGGAACA (14)20.002
P0.5 retinaGTTGAAAAAA (2)20.002
P0.5 retinaTTCATTTAGA (4)20.002
P0.5 retinaTTTCCCAGAA (2)20.002
P0.5 retinaTTTGACTTTT (3)20.002
P2.5 retinaCCTTTAATCC (355)70.40.0704
P2.5 retinaGCTGTTCAAA (4)10.60.0106
P2.5 retinaCCTTTGATCC (22)70.007
P2.5 retinaGTTGAAAAAA (2)3.50.0035
P2.5 retinaAAATAGCTGG (2)1.80.0018
P2.5 retinaGAACCTAAGC (2)1.80.0018
P2.5 retinaGTGGCTCACC (9)1.80.0018
P4.5 retinaCCTTTAATCC (355)43.60.0436
P4.5 retinaGTGGCTCACC (9)7.90.0079
P4.5 retinaCCTTTGATCC (22)5.90.0059
P4.5 retinaGCTGTTCAAA (4)5.90.0059
P4.5 retinaAAATAGCTGG (2)20.002
P4.5 retinaCGTGCACACA (2)20.002
P4.5 retinaGATGTTCAAA (3)20.002
P4.5 retinaGTTGAAAAAA (2)20.002
P4.5 retinaTTCATTTAGA (4)20.002
P6.5 retinaCCTTTAATCC (355)700.07
P6.5 retinaGCTGTTCAAA (4)150.015
P6.5 retinaGTGGCTCACC (9)6.70.0067
P6.5 retinaAAATAGCTGG (2)3.30.0033
P6.5 retinaCCTTTGATCC (22)3.30.0033
P10.5 crx- retinaCCTTTAATCC (355)63.20.0632
P10.5 crx- retinaGCTGTTCAAA (4)9.30.0093
P10.5 crx- retinaAAATAGCTGG (2)3.70.0037
P10.5 crx- retinaGCAAGGAACA (14)3.70.0037
P10.5 crx- retinaGTGGCTCACC (9)3.70.0037
P10.5 crx- retinaCGTGCACACA (2)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCCTTTAATCC (355)38.40.0384
P10.5 crx+ retinaGCTGTTCAAA (4)11.50.0115
P10.5 crx+ retinaCCTTTGATCC (22)5.80.0058
P10.5 crx+ retinaCGTGCACACA (2)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGTGGCTCACC (9)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTTTGACTTTT (3)1.90.0019
Adult retinalCCTTTAATCC (355)129.60.1296
Adult retinalGCTGTTCAAA (4)9.30.0093
Adult retinalGTGGCTCACC (9)5.60.0056
Adult retinalCGTGCACACA (2)1.90.0019
Adult retinalGCAAGGAACA (14)1.90.0019
Adult retinalGTTGAAAAAA (2)1.90.0019
ONLCCTTTAATCC (355)84.30.0843
ONLGCTGTTCAAA (4)13.40.0134
ONLGTGGCTCACC (9)9.60.0096
ONLCCTTTGATCC (22)5.70.0057
ONLAAATAGCTGG (2)1.90.0019
ONLGCAAGGAACA (14)1.90.0019
ONLTTTCCCAGAA (2)1.90.0019