Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.297650	C630002N23Rik	RIKEN cDNA C630002N23 gene	1		381283
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 123 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC ACAAAGTGTC CAAAAAAAAA (2) CAACACAAAA CAACACACAA CAACACACAT CACACAAAAA (3) 65.2 0.0652 Cb medulloblastoma ACAAAGTGTC ACGAATTGTG CAAAAAAAAA (2) CAACAAAAAA (7) CAACACAAAA CAACACACAA CCCCACCCCC (2) TCAACATCTA (2) 154.9 0.1549 P8 GC+1d culture ACAAAGTGTC ACGAATTGTG CAAAAAAAAA (2) CAACACAAAA CAACACACAA CAACACACAT CACACAAAAA (3) GCTTGCCACA TCAACATCTA (2) 68.4 0.0684 P8 GC+SHH+1d culture ACAAAGTGTC CAAAAAAAAA (2) CAACACAAAA CAACACACAA CAACACACAT CACACAAAAA (3) CCCCACCCCC (2) TCAACATCTA (2) 87.8 0.0878 E15 cortex CAAAAAAAAA (2) CAACACACAA CACACAAAAA (3) CCCCACCCCC (2) TCAACATCTA (2) 59.2 0.0592 P1 cortex ACAAAGTGTC CAAAAAAAAA (2) CAACAAAAAA (7) CAACACACAA CACACAAAAA (3) TCAACATCTA (2) 49.8 0.0498 Hypothalamus ACAAAGTGTC CAAAAAAAAA (2) CAACAAAAAA (7) CAACACAAAA CAACACACAA 81.4 0.0814 E12.5 retina ACAAAGTGTC CAAAAAAAAA (2) CAACAAAAAA (7) CAACACAAAA TCAACATCTA (2) 50.7 0.0507 E14.5 retina ACAAAGTGTC ACGAATTGTG CAAAAAAAAA (2) CAACACAAAA CAACACACAA CCCCACCCCC (2) 29.1 0.0291 E16.5 retina CAAAAAAAAA (2) CAACACAAAA CAACACACAA CCCCACCCCC (2) TCAACATCTA (2) 34.5 0.0345 E18.5 retina ACAAAGTGTC CAAAAAAAAA (2) CAACACAAAA CAACACACAA TCAACATCTA (2) 74.5 0.0745 P0.5 retina ACAAAGTGTC CAAAAAAAAA (2) CAACAAAAAA (7) CAACACAAAA CAACACACAA CAACACACAT 164.9 0.1649 P2.5 retina ACAAAGTGTC ACGAATTGTG CAAAAAAAAA (2) CAACACAAAA CAACACACAA CAACACACAT CACACAAAAA (3) CCCCACCCCC (2) TCAACATCTA (2) 84.7 0.0847 P4.5 retina CAAAAAAAAA (2) CAACAAAAAA (7) CAACACAAAA CAACACACAA CAACACACAT CACACAAAAA (3) TCAACATCTA (2) 71.4 0.0714 P6.5 retina ACAAAGTGTC CAAAAAAAAA (2) CAACACAAAA CAACACACAA CAACACACAT TCAACATCTA (2) 71.8 0.0718 P10.5 crx- retina ACGAATTGTG CAAAAAAAAA (2) CAACAAAAAA (7) CAACACAAAA CAACACACAA CAACACACAT CCCCACCCCC (2) GCTTGCCACA 33.6 0.0336 P10.5 crx+ retina ACAAAGTGTC ACGAATTGTG CAAAAAAAAA (2) CAACAAAAAA (7) CAACACAAAA CAACACACAA CAACACACAT CACACAAAAA (3) GCTTGCCACA 57.5 0.0575 Adult retinal ACAAAGTGTC CAAAAAAAAA (2) CAACACAAAA CAACACACAA CAACACACAT CACACAAAAA (3) CCCCACCCCC (2) 63.2 0.0632 ONL CAAAAAAAAA (2) CAACACAAAA CACACAAAAA (3) 22.9 0.0229