Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.297976 Gpc1glypican 1 1    14733 
 Gene Ontology extracellular matrix | extracellular space
 Human Homolog GPC1[glypican 1]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 114 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATAGCCTTCT
CAAGCTCATC
CAGAAGGCCT (2)
CTGTACAGGG (2)
TAAAAAAAAA (3)
TTTTGGCCAA (2)
570.057
Cb medulloblastomaACCTCAAAAA
AGTCCTGCCA
CAGAAGGCCT (2)
CTGTACAGGG (2)
GGCCCAACAA
TAAAAAAAAA (3)
TTTTGGCCAA (2)
136.40.1364
P8 GC+1d cultureACCTCAAAAA
AGTCCTGCCA
ATAGCCTTCT
CAAGCTCATC
CTGTACAGGG (2)
GGCCCAACAA
GGGATGCTGG (2)
TAAAAAAAAA (3)
82.20.0822
P8 GC+SHH+1d cultureACCTCAAAAA
AGTCCTGCCA
ATAGCCTTCT
CAGAAGGCCT (2)
CTGTACAGGG (2)
GGCCCAACAA
GGGATGCTGG (2)
GGTGCTGCTG
TAAAAAAAAA (3)
124.20.1242
3T3 fibroblastsCAAGCTCATC
CAGAAGGCCT (2)
CTGTACAGGG (2)
TAAAAAAAAA (3)
24.50.0245
E15 cortexCAAGCTCATC
CTGTACAGGG (2)
GGGATGCTGG (2)
TAAAAAAAAA (3)
29.60.0296
P1 cortexCAAGCTCATC
CAGAAGGCCT (2)
GGCCCAACAA
TAAAAAAAAA (3)
TCTGCTGATG (6)
72.60.0726
HypothalamusACCTCAAAAA
AGTCCTGCCA
CAAGCTCATC
GGCCCAACAA
GGGATGCTGG (2)
TAAAAAAAAA (3)
470.047
E12.5 retinaACCTCAAAAA
CAAGCTCATC
CAGAAGGCCT (2)
CTGTACAGGG (2)
GGCCCAACAA
TAAAAAAAAA (3)
TCTGCTGATG (6)
39.50.0395
E14.5 retinaACCTCAAAAA
GGCCCAACAA
TAAAAAAAAA (3)
TTTTGGCCAA (2)
50.90.0509
E16.5 retinaCAGAAGGCCT (2)
CTGTACAGGG (2)
GGCCCAACAA
GGTGCTGCTG
TAAAAAAAAA (3)
30.70.0307
E18.5 retinaCAAGCTCATC
GGCCCAACAA
TAAAAAAAAA (3)
TTTTGGCCAA (2)
114.50.1145
P0.5 retinaAGTCCTGCCA
CAGAAGGCCT (2)
CTGTACAGGG (2)
GGCCCAACAA
GGGATGCTGG (2)
GGTGCTGCTG
TAAAAAAAAA (3)
TTTTGGCCAA (2)
59.10.0591
P2.5 retinaACCTCAAAAA
CAGAAGGCCT (2)
CTGTACAGGG (2)
GGCCCAACAA
GGTGCTGCTG
TAAAAAAAAA (3)
89.90.0899
P4.5 retinaACCTCAAAAA
AGTCCTGCCA
CAAGCTCATC
GGCCCAACAA
TAAAAAAAAA (3)
TCTGCTGATG (6)
134.80.1348
P6.5 retinaAGTCCTGCCA
CAAGCTCATC
CAGAAGGCCT (2)
CTGTACAGGG (2)
GGCCCAACAA
TAAAAAAAAA (3)
TTTTGGCCAA (2)
81.90.0819
P10.5 crx- retinaAGTCCTGCCA
CAGAAGGCCT (2)
CTGTACAGGG (2)
GGCCCAACAA
GGGATGCTGG (2)
TAAAAAAAAA (3)
22.40.0224
P10.5 crx+ retinaAGTCCTGCCA
CAGAAGGCCT (2)
GGCCCAACAA
TAAAAAAAAA (3)
30.70.0307
Adult retinalAGTCCTGCCA
CAAGCTCATC
GGGATGCTGG (2)
TAAAAAAAAA (3)
31.50.0315
ONLGGCCCAACAA
GGGATGCTGG (2)
TAAAAAAAAA (3)
TTTTGGCCAA (2)
34.40.0344