Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.299566	Rps2	ribosomal protein S2	X		16898
Mm.299566	Rnu64	RNA, U64 small nucleolar			104366
Gene Ontology	biological_process unknown | small nucleolar ribonucleoprotein complex
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 145 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAGATCAAGT (2) AGACGGCATT (3) AGGATGCTTG (2) CAAGGGTGAC (4) CAAGGTGACA (4) CCAAGTGACA (4) CCACAGAGGC (2) GGCAACTTTG (6) TGCCCAAGAA 66.7 0.0667 Cb medulloblastoma AAGATCAAGT (2) AGGATGCTTG (2) CAAGGTGACA (4) GAACAGTGTG (2) GGAACAGGCC (3) TGCCCAAGAA 34.6 0.0346 P8 GC+1d culture AAGATCAAGT (2) AGGATGCTTG (2) CAAGGGTGAC (4) CAAGGTGACA (4) CCAAGTGACA (4) CCACAGAGGC (2) CCAGTGCAGA GAACAGTGTG (2) GGAACAGGCC (3) GGCAACTTTG (6) GTTTGTTTTG TGCCCAAGAA TGGCTCTGTG 68.3 0.0683 P8 GC+SHH+1d culture AGACGGCATT (3) AGGATGCTTG (2) CAAGGTGACA (4) CCAAGTGACA (4) CCACAGAGGC (2) CTGCTGTATA (2) GAACAGTGTG (2) GGAACAGGCC (3) TGCCCAAGAA TGGCTCTGTG 103 0.103 3T3 fibroblasts AAGTAAGGCG (2) CAAGGTGACA (4) CCAGTGCAGA GGAACAGGCC (3) 550.2 0.5502 E15 cortex AAGATCAAGT (2) CAAGGTGACA (4) CCAGTGCAGA 64.3 0.0643 P1 cortex AGGATGCTTG (2) CAAGGTGACA (4) 100 0.1 Hypothalamus AAGATCAAGT (2) AGGATGCTTG (2) CAAGGTGACA (4) CCAGTGCAGA CTGCTGTATA (2) GAACAGTGTG (2) TGCCCAAGAA 41.6 0.0416 E12.5 retina AGGATGCTTG (2) CAAGGTGACA (4) CCAGTGCAGA CTGCTGTATA (2) GAACAGTGTG (2) GTTTGTTTTG TGGCTCTGTG 159.6 0.1596 E14.5 retina AAGATCAAGT (2) AGACGGCATT (3) AGGATGCTTG (2) CAAGGTGACA (4) CCAAGTGACA (4) CCAGTGCAGA GAACAGTGTG (2) GGAACAGGCC (3) TGCCCAAGAA 61.8 0.0618 E16.5 retina AAGATCAAGT (2) AGGATGCTTG (2) CAAGGTGACA (4) CCACAGAGGC (2) GAACAGTGTG (2) GGAACAGGCC (3) GTGGGACTCA (2) GTTTGTTTTG TGGCTCTGTG 65.1 0.0651 E18.5 retina AGACGGCATT (3) AGGATGCTTG (2) CAAGGTGACA (4) CCAAGTGACA (4) GAACAGTGTG (2) GGAACAGGCC (3) GGCAACTTTG (6) TGGCTCTGTG 50.8 0.0508 P0.5 retina AAGTAAGGCG (2) AGGATGCTTG (2) CAAGGTGACA (4) CAAGGTGACC (4) CCAAGTGACA (4) CTGCTGTATA (2) GAACAGTGTG (2) GGCAACTTTG (6) GTTTGTTTTG TGCCCAAGAA TGGCTCTGTG 153.1 0.1531 P2.5 retina AGGATGCTTG (2) CAAGGTGACA (4) CAAGGTGACC (4) CCACAGAGGC (2) CCAGTGCAGA GAACAGTGTG (2) GGAACAGGCC (3) TGGCTCTGTG 60 0.06 P4.5 retina AAGTAAGGCG (2) AGGATGCTTG (2) CAAGGGTGAC (4) CAAGGTGACA (4) GAACAGTGTG (2) GGAACAGGCC (3) TGGCTCTGTG 45.6 0.0456 P6.5 retina AGGATGCTTG (2) CAAGGTGACA (4) CCAAGTGACA (4) GGAACAGGCC (3) GTGGGACTCA (2) TGCCCAAGAA TGGCTCTGTG 66.9 0.0669 P10.5 crx- retina AAGATCAAGT (2) AGGATGCTTG (2) CAAGGTGACA (4) GAACAGTGTG (2) GGAACAGGCC (3) GTGGGACTCA (2) GTTTGTTTTG 61.5 0.0615 P10.5 crx+ retina AGGATGCTTG (2) CAAGGTGACA (4) GAACAGTGTG (2) TGGCTCTGTG 44.2 0.0442 Adult retinal AGGATGCTTG (2) CAAGGTGACA (4) CAAGGTGACC (4) GAACAGTGTG (2) GGAACAGGCC (3) GGCAACTTTG (6) TGCCCAAGAA TGGCTCTGTG 64.9 0.0649 ONL AGACCCCGTG (2) CAAGGTGACA (4) CCAAGTGACA (4) CCAGTGCAGA GAACAGTGTG (2) TGGCTCTGTG 28.7 0.0287