Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.302831 E430026H10RikRIKEN cDNA E430026H10 gene 6    320241 
 Mm.302831 D130059P03RikRIKEN cDNA D130059P03 gene 6  6 B1  320538 
 Human Homolog FLJ25778[hypothetical protein FLJ25778]
 Clusters 
   Neighbors    

Total 9 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 78 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAGGCTCTCCA (4)1.60.0016
P8 Cb GCGCGGCTGCGG (4)1.60.0016
P8 Cb GCTTAACCAACT (3)1.60.0016
Cb medulloblastomaAGGCTCTCCA (4)9.20.0092
Cb medulloblastomaGGTCTCTTTA (2)4.60.0046
P8 GC+1d cultureAAATACATTT (4)3.40.0034
P8 GC+1d cultureTTAACCAACT (3)3.40.0034
P8 GC+1d cultureAGGCTCTCCA (4)2.30.0023
P8 GC+1d cultureGAGACGGAGG (6)2.30.0023
P8 GC+1d cultureGCGGCTGCGG (4)2.30.0023
P8 GC+1d cultureACATAGAATT (3)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureAGGCTCTCCA (4)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureGAGACGGAGG (6)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureGCGGCTGCGG (4)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureAAATACATTT (4)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureGGTCTCTTTA (2)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTTAACCAACT (3)1.20.0012
3T3 fibroblastsGCGGCTGCGG (4)3.50.0035
E15 cortexGAGACGGAGG (6)9.90.0099
P1 cortexTTAACCAACT (3)4.50.0045
HypothalamusAGGCTCTCCA (4)10.90.0109
HypothalamusAAATACATTT (4)1.80.0018
HypothalamusCAACTGAGGA (4)1.80.0018
HypothalamusGAGACGGAGG (6)1.80.0018
E12.5 retinaAGGCTCTCCA (4)5.60.0056
E14.5 retinaAAATACATTT (4)5.50.0055
E14.5 retinaAGGCTCTCCA (4)5.50.0055
E14.5 retinaACATAGAATT (3)1.80.0018
E14.5 retinaCAACTGAGGA (4)1.80.0018
E16.5 retinaAGGCTCTCCA (4)12.70.0127
E16.5 retinaTTAACCAACT (3)5.40.0054
E16.5 retinaAAATACATTT (4)1.80.0018
E16.5 retinaACATAGAATT (3)1.80.0018
E16.5 retinaATTACGCCAA (233)1.80.0018
E18.5 retinaAGGCTCTCCA (4)200.02
E18.5 retinaAAATACATTT (4)1.80.0018
E18.5 retinaAACTGTTTCA (2)1.80.0018
E18.5 retinaGAGACGGAGG (6)1.80.0018
E18.5 retinaGGCCATCATA (2)1.80.0018
E18.5 retinaTTAACCAACT (3)1.80.0018
P0.5 retinaAGGCTCTCCA (4)11.80.0118
P0.5 retinaGAGACGGAGG (6)7.90.0079
P0.5 retinaATTACGCCAA (233)20.002
P2.5 retinaAGGCTCTCCA (4)24.60.0246
P2.5 retinaTTAACCAACT (3)70.007
P2.5 retinaAAATACATTT (4)1.80.0018
P2.5 retinaGAGACGGAGG (6)1.80.0018
P2.5 retinaGCGGCTGCGG (4)1.80.0018
P2.5 retinaGGTCTCTTTA (2)1.80.0018
P4.5 retinaAGGCTCTCCA (4)25.80.0258
P4.5 retinaTTAACCAACT (3)13.90.0139
P4.5 retinaAAATACATTT (4)40.004
P4.5 retinaGAGACGGAGG (6)20.002
P4.5 retinaGGCCATCATA (2)20.002
P6.5 retinaAGGCTCTCCA (4)28.30.0283
P6.5 retinaTTAACCAACT (3)50.005
P6.5 retinaAAATACATTT (4)3.30.0033
P6.5 retinaCAACTGAGGA (4)1.70.0017
P6.5 retinaGAGACGGAGG (6)1.70.0017
P6.5 retinaGGTCTCTTTA (2)1.70.0017
P10.5 crx- retinaAGGCTCTCCA (4)3.70.0037
P10.5 crx- retinaGGTCTCTTTA (2)3.70.0037
P10.5 crx- retinaTTAACCAACT (3)3.70.0037
P10.5 crx- retinaAAATACATTT (4)1.90.0019
P10.5 crx- retinaGACAGAAACA (5)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaAGGCTCTCCA (4)9.60.0096
P10.5 crx+ retinaAAATACATTT (4)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaGACAGAAACA (5)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGGCCATCATA (2)1.90.0019
Adult retinalAGGCTCTCCA (4)5.60.0056
Adult retinalATTACGCCAA (233)3.70.0037
Adult retinalGAGACGGAGG (6)3.70.0037
Adult retinalAACTGTTTCA (2)1.90.0019
Adult retinalCAACTGAGGA (4)1.90.0019
Adult retinalTTAACCAACT (3)1.90.0019
ONLAACTGTTTCA (2)1.90.0019
ONLGACAGAAACA (5)1.90.0019
ONLGCGGCTGCGG (4)1.90.0019