Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.305750	Rpl27a	ribosomal protein L27a	7	7 51.55 cM	26451
Gene Ontology	intracellular | protein biosynthesis | ribosome | structural constituent of ribosome
Human Homolog	RPL27A[ribosomal protein L27a]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 264 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAAAAAAAAA (2) CACACCACAG (3) CACCACCACA CCTACCTGCA (3) CCTCCAGCAT CGGCAAAAAA (2) GAAAACTTAA (2) GCGGTGGCAG GTAGCTCACA (3) TAAAAAAAAA (3) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TGTAAAAAAA (2) TTGGAAATCT (4) 396.4 0.3964 Cb medulloblastoma AAAAAAAAAA (2) CACCACCACA CCTACCTGCA (3) CGGCAAAAAA (2) GAAAACTTAA (2) GAAAATGTTA GCGGTGGCAG GTAGCTCACA (3) TAAAAAAAAA (3) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TGGCAAAAAA (3) TGTAAAAAAA (2) 1084.3 1.0843 P8 GC+1d culture AAAAAAAAAA (2) AGACAGCTTC CACACCACAG (3) CACCACCACA CCTACCTGCA (3) CGGCAAAAAA (2) GCGGTGGCAG GTAGCTCACA (3) TAAAAAAAAA (3) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TGGTCTTTGC TGTAAAAAAA (2) 405 0.405 P8 GC+SHH+1d culture AAAAAAAAAA (2) CACCACCACA CCTACCTGCA (3) CCTCCAGCAT CGGCAAAAAA (2) GAAAACTTAA (2) GAAAATGTTA GCGGTGGCAG GTAGCTCACA (3) TAAAAAAAAA (3) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TGGCAAAAAA (3) TGTAAAAAAA (2) 526.9 0.5269 3T3 fibroblasts AAAAAAAAAA (2) CACACCACAG (3) CACCACCACA CCTACCTGCA (3) CCTCCAGCAT GCCTATCTGG (2) GCGGTGGCAG GTAGCTCACA (3) GTCATAGCTG (2) TAAAAAAAAA (3) TGAAAAAAAA (2) 378.4 0.3784 E15 cortex AAAAAAAAAA (2) CACCACCACA CGGCAAAAAA (2) GTAGCTCACA (3) GTCATAGCTG (2) TAAAAAAAAA (3) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TGTAAAAAAA (2) 336.3 0.3363 P1 cortex AAAAAAAAAA (2) CACCACCACA CCTACCTGCA (3) GAAAATGTTA GTAGCTCACA (3) TAAAAAAAAA (3) TGAAAAAAAA (2) TGTAAAAAAA (2) 354.3 0.3543 Hypothalamus AAAAAAAAAA (2) CACCACCACA CCTACCTGCA (3) CCTCCAGCAT CGGCAAAAAA (2) GAAAACTTAA (2) GAAAATGTTA GCGGTGGCAG GTAGCTCACA (3) TAAAAAAAAA (3) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TGGCAAAAAA (3) TGTAAAAAAA (2) TTGGAAATCT (4) 280.6 0.2806 E12.5 retina AAAAAAAAAA (2) CACCACCACA CCTACCTGCA (3) CCTCCAGCAT CGGCAAAAAA (2) GAAAACTTAA (2) GAAAATGTTA GCGGTGGCAG GTAGCTCACA (3) TAAAAAAAAA (3) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TGGTCTTTGC TGTAAAAAAA (2) TTGGAAATCT (4) 315.4 0.3154 E14.5 retina AAAAAAAAAA (2) AGACAGCTTC CACCACCACA CCTACCTGCA (3) CGGCAAAAAA (2) GAAAACTTAA (2) GAAAATGTTA GCGGTGGCAG GTAGCTCACA (3) TAAAAAAAAA (3) TAAACGTGTC (2) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TGTAAAAAAA (2) 271.5 0.2715 E16.5 retina AAAAAAAAAA (2) AGACAGCTTC CACCACCACA CCTACCTGCA (3) CGGCAAAAAA (2) GAAAACTTAA (2) GAAAATGTTA GCGGTGGCAG GTAGCTCACA (3) TAAAAAAAAA (3) TAAACGTGTC (2) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TGGCAAAAAA (3) TGTAAAAAAA (2) TTGGAAATCT (4) 188.3 0.1883 E18.5 retina AAAAAAAAAA (2) CACACCACAG (3) CACCACCACA CCTACCTGCA (3) CCTCCAGCAT CGGCAAAAAA (2) GAAAACTTAA (2) GCGGTGGCAG GTAGCTCACA (3) TAAAAAAAAA (3) TAAACGTGTC (2) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TGGCAAAAAA (3) TGGTCTTTGC TGTAAAAAAA (2) TTGGAAATCT (4) 683.9 0.6839 P0.5 retina AAAAAAAAAA (2) CACACCACAG (3) CACCACCACA CCTACCTGCA (3) CCTCCAGCAT CGGCAAAAAA (2) GAAAACTTAA (2) GCGGTGGCAG GTAGCTCACA (3) GTCATAGCTG (2) TAAAAAAAAA (3) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TGGCAAAAAA (3) TGTAAAAAAA (2) 294.4 0.2944 P2.5 retina AAAAAAAAAA (2) CACACCACAG (3) CACCACCACA CGGCAAAAAA (2) GAAAACTTAA (2) GAAAATGTTA GCGGTGGCAG GTAGCTCACA (3) GTCATAGCTG (2) TAAAAAAAAA (3) TAAACGTGTC (2) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TGGCAAAAAA (3) TGTAAAAAAA (2) 531.6 0.5316 P4.5 retina AAAAAAAAAA (2) CACCACCACA CCTACCTGCA (3) CGGCAAAAAA (2) GAAAACTTAA (2) GAAAATGTTA GCGGTGGCAG GTAGCTCACA (3) GTCATAGCTG (2) TAAAAAAAAA (3) TAAACGTGTC (2) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TGGCAAAAAA (3) TGTAAAAAAA (2) 556.8 0.5568 P6.5 retina AAAAAAAAAA (2) CACCACCACA CCTACCTGCA (3) CGGCAAAAAA (2) GAAAACTTAA (2) GCGGTGGCAG GTAGCTCACA (3) GTCATAGCTG (2) TAAAAAAAAA (3) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TGTAAAAAAA (2) TTGGAAATCT (4) 443.5 0.4435 P10.5 crx- retina AAAAAAAAAA (2) CACCACCACA CCTACCTGCA (3) CGGCAAAAAA (2) GAAAATGTTA GCCTATCTGG (2) GTAGCTCACA (3) TAAAAAAAAA (3) TAAACGTGTC (2) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TTGGAAATCT (4) 115.3 0.1153 P10.5 crx+ retina AAAAAAAAAA (2) CACCACCACA CCTACCTGCA (3) CGGCAAAAAA (2) GAAAACTTAA (2) GAAAATGTTA GCGGTGGCAG GTAGCTCACA (3) TAAAAAAAAA (3) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TGGTCTTTGC TGTAAAAAAA (2) 221 0.221 Adult retinal AAAAAAAAAA (2) CACCACCACA CCTACCTGCA (3) CGGCAAAAAA (2) GCCTATCTGG (2) GCGGTGGCAG GTAGCTCACA (3) GTCATAGCTG (2) TAAAAAAAAA (3) TAAACGTGTC (2) TGAAAAAAAA (2) TGGAAAAAAA (4) TGTAAAAAAA (2) 139.2 0.1392 ONL AAAAAAAAAA (2) CACCACCACA GCGGTGGCAG GTAGCTCACA (3) GTCATAGCTG (2) TAAAAAAAAA (3) TGAAAAAAAA (2) TGGCAAAAAA (3) TGTAAAAAAA (2) 214.4 0.2144