Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.30929 9530001N24RikRIKEN cDNA 9530001N24 gene 4    77436 
 Mm.30929 Prdx1peroxiredoxin 1 4  4 47.0 cM  18477 
 Gene Ontology antioxidant activity | oxidoreductase activity | peroxidase activity | response to oxidative stress
 Human Homolog PRDX1[peroxiredoxin 1]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 144 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCGATTAAAACA (3)27.70.0277
P8 Cb GCATGTGGTGTG (2)24.50.0245
P8 Cb GCAACATTCCCT (4)4.90.0049
P8 Cb GCGTTGGAACCT (8)4.90.0049
P8 Cb GCCCTTTATTCC (18)3.30.0033
P8 Cb GCTGTACCATTA (3)3.30.0033
P8 Cb GCGAGGTGGTGG (8)1.60.0016
P8 Cb GCGTGGAAGCTG (11)1.60.0016
P8 Cb GCTCTTTAGGTT (2)1.60.0016
P8 Cb GCTGTTTAAGCA (2)1.60.0016
P8 Cb GCTTTGTCAGTG (5)1.60.0016
Cb medulloblastomaGATTAAAACA (3)370.037
Cb medulloblastomaGGGGAGGTTG (2)9.20.0092
Cb medulloblastomaATGTGGTGTG (2)4.60.0046
Cb medulloblastomaTGTACCATTA (3)4.60.0046
Cb medulloblastomaTTTTTAAGCA (4)4.60.0046
Cb medulloblastomaGATTACCATA (2)2.30.0023
P8 GC+1d cultureATGTGGTGTG (2)240.024
P8 GC+1d cultureGATTAAAACA (3)10.30.0103
P8 GC+1d cultureCCTTTATTCC (18)6.80.0068
P8 GC+1d cultureGTTGGAACCT (8)3.40.0034
P8 GC+1d cultureGATGTGGGTG (13)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureATGTGGTGTG (2)31.60.0316
P8 GC+SHH+1d cultureGATTAAAACA (3)14.10.0141
P8 GC+SHH+1d cultureGTTGGAACCT (8)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureGTGAATGTTT (4)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureCCTTTATTCC (18)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTCCCTGAAAA (3)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTGTACCATTA (3)1.20.0012
3T3 fibroblastsATGTGGTGTG (2)350.035
3T3 fibroblastsGAGGTGGTGG (8)3.50.0035
3T3 fibroblastsGATGTGGGTG (13)3.50.0035
3T3 fibroblastsGTTGGAACCT (8)3.50.0035
E15 cortexGGGGAGGTTG (2)9.90.0099
E15 cortexGAGGTGGTGG (8)4.90.0049
P1 cortexCCTTTATTCC (18)27.30.0273
P1 cortexGGGGAGGTTG (2)18.20.0182
P1 cortexATGTGGTGTG (2)4.50.0045
P1 cortexGATTAAAACA (3)4.50.0045
HypothalamusGATTAAAACA (3)21.70.0217
HypothalamusATGTGGTGTG (2)10.90.0109
HypothalamusGGGGAGGTTG (2)1.80.0018
HypothalamusTGTTTAAGCA (2)1.80.0018
HypothalamusTTTGTCAGTG (5)1.80.0018
E12.5 retinaATGTGGTGTG (2)33.80.0338
E12.5 retinaGATTAAAACA (3)150.015
E12.5 retinaCCTTTATTCC (18)5.60.0056
E12.5 retinaGTTGGAACCT (8)3.80.0038
E12.5 retinaAACATTCCCT (4)1.90.0019
E12.5 retinaATGCGGTGTG (3)1.90.0019
E12.5 retinaGATTACCATA (2)1.90.0019
E12.5 retinaGGGGAGGTTG (2)1.90.0019
E12.5 retinaGTAACAAAAA (4)1.90.0019
E12.5 retinaGTGGAAGCTG (11)1.90.0019
E12.5 retinaTCTTTAGGTT (2)1.90.0019
E12.5 retinaTGTACCATTA (3)1.90.0019
E14.5 retinaGATTAAAACA (3)18.20.0182
E14.5 retinaCCTTTATTCC (18)12.80.0128
E14.5 retinaATGTGGTGTG (2)9.10.0091
E14.5 retinaGTGAAGTGTG (3)7.30.0073
E14.5 retinaGTTGGAACCT (8)1.80.0018
E14.5 retinaTTTGTCAGTG (5)1.80.0018
E14.5 retinaTTTTTAAGCA (4)1.80.0018
E16.5 retinaATGTGGTGTG (2)19.90.0199
E16.5 retinaGATTAAAACA (3)18.10.0181
E16.5 retinaCCTTTATTCC (18)3.60.0036
E16.5 retinaGATTACCATA (2)3.60.0036
E16.5 retinaGTGGAAGCTG (11)3.60.0036
E16.5 retinaTTTGTCAGTG (5)3.60.0036
E16.5 retinaAACATTCCCT (4)1.80.0018
E16.5 retinaATGTGGGTGT (2)1.80.0018
E16.5 retinaGTGAATGTTT (4)1.80.0018
E16.5 retinaTCCCTGAAAA (3)1.80.0018
E18.5 retinaGATTAAAACA (3)29.10.0291
E18.5 retinaATGTGGTGTG (2)14.60.0146
E18.5 retinaCCTTTATTCC (18)7.30.0073
E18.5 retinaTGTACCATTA (3)5.50.0055
E18.5 retinaGTTGGAACCT (8)1.80.0018
E18.5 retinaTGTTTAAGCA (2)1.80.0018
E18.5 retinaTTTGTCAGTG (5)1.80.0018
P0.5 retinaATGTGGTGTG (2)25.50.0255
P0.5 retinaGATTAAAACA (3)9.80.0098
P0.5 retinaGGGGAGGTTG (2)5.90.0059
P0.5 retinaATGCGGTGTG (3)3.90.0039
P0.5 retinaAGGGGGGATC (3)20.002
P0.5 retinaCCTTTATTCC (18)20.002
P0.5 retinaGCCTTTTATG (2)20.002
P0.5 retinaGTAACAAAAA (4)20.002
P0.5 retinaGTTGGAACCT (8)20.002
P0.5 retinaTGTTTAAGCA (2)20.002
P2.5 retinaGATTAAAACA (3)31.70.0317
P2.5 retinaATGTGGTGTG (2)15.80.0158
P2.5 retinaCCTTTATTCC (18)3.50.0035
P2.5 retinaGGGGAGGTTG (2)3.50.0035
P2.5 retinaATGTGGGTGT (2)1.80.0018
P2.5 retinaGTGGAAGCTG (11)1.80.0018
P2.5 retinaTCTTTAGGTT (2)1.80.0018
P4.5 retinaGATTAAAACA (3)33.70.0337
P4.5 retinaCCTTTATTCC (18)7.90.0079
P4.5 retinaGTTGGAACCT (8)7.90.0079
P4.5 retinaATGTGGTGTG (2)40.004
P4.5 retinaAACATTCCCT (4)20.002
P4.5 retinaATGTGGGTGT (2)20.002
P4.5 retinaGATGTGGGTG (13)20.002
P6.5 retinaGATTAAAACA (3)31.70.0317
P6.5 retinaATGTGGTGTG (2)50.005
P6.5 retinaCCTTTATTCC (18)50.005
P6.5 retinaTCCCTGAAAA (3)50.005
P6.5 retinaAACATTCCTT (3)3.30.0033
P6.5 retinaGCCTTTTATG (2)3.30.0033
P6.5 retinaGGGGAGGTTG (2)1.70.0017
P6.5 retinaGTGGAAGCTG (11)1.70.0017
P6.5 retinaGTTGGAACCT (8)1.70.0017
P6.5 retinaTCTTTAGGTT (2)1.70.0017
P10.5 crx- retinaATGTGGTGTG (2)50.20.0502
P10.5 crx- retinaGATTAAAACA (3)14.90.0149
P10.5 crx- retinaCCTTTATTCC (18)3.70.0037
P10.5 crx- retinaTTTTTAAGCA (4)3.70.0037
P10.5 crx- retinaAACATTCCTT (3)1.90.0019
P10.5 crx- retinaGCCTTTTATG (2)1.90.0019
P10.5 crx- retinaGGGGAGGTTG (2)1.90.0019
P10.5 crx- retinaGTGAATGTTT (4)1.90.0019
P10.5 crx- retinaGTGGAAGCTG (11)1.90.0019
P10.5 crx- retinaTGTACCATTA (3)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaATGTGGTGTG (2)19.20.0192
P10.5 crx+ retinaGATTAAAACA (3)19.20.0192
P10.5 crx+ retinaCCTTTATTCC (18)7.70.0077
P10.5 crx+ retinaGTTGGAACCT (8)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaAGGGGGGATC (3)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGTAACAAAAA (4)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTCCCTGAAAA (3)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTCTTTAGGTT (2)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTGTACCATTA (3)1.90.0019
Adult retinalGATTAAAACA (3)18.50.0185
Adult retinalGGGGAGGTTG (2)5.60.0056
Adult retinalATGTGGTGTG (2)3.70.0037
Adult retinalAGGGGGGATC (3)1.90.0019
Adult retinalCCTTTATTCC (18)1.90.0019
Adult retinalGTTGGAACCT (8)1.90.0019
ONLGATTAAAACA (3)19.20.0192
ONLATGTGGTGTG (2)1.90.0019
ONLCCTTTATTCC (18)1.90.0019
ONLGTTGGAACCT (8)1.90.0019
ONLTTTTTAAGCA (4)1.90.0019