Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.319530	Mrp63	mitochondrial ribosomal protein 63	14		67840
Gene Ontology	mitochondrial ribosome | protein biosynthesis | structural constituent of ribosome
Human Homolog	MRP63[mitochondrial ribosomal protein 63]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 68 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC TTTGCTTTAA (10) 32.6 0.0326 P8 Cb GC ATTGATTAAT (5) 11.4 0.0114 P8 Cb GC ATTGATTAAA (6) 6.5 0.0065 P8 Cb GC GTGGTGCATA (8) 1.6 0.0016 Cb medulloblastoma TTTGCTTTAA (10) 6.9 0.0069 Cb medulloblastoma ATTGATTAAA (6) 4.6 0.0046 Cb medulloblastoma ATTGATTAAT (5) 4.6 0.0046 P8 GC+1d culture TTTGCTTTAA (10) 19.4 0.0194 P8 GC+1d culture ATTGATTAAT (5) 6.8 0.0068 P8 GC+1d culture ATTGATTAAA (6) 3.4 0.0034 P8 GC+1d culture GTGGTGCATA (8) 2.3 0.0023 P8 GC+1d culture CATTCTTAAT (2) 1.1 0.0011 P8 GC+SHH+1d culture TTTGCTTTAA (10) 38.6 0.0386 P8 GC+SHH+1d culture ATTGATTAAT (5) 10.5 0.0105 P8 GC+SHH+1d culture ATTGATTAAA (6) 8.2 0.0082 P8 GC+SHH+1d culture GTGGTGCATA (8) 4.7 0.0047 P8 GC+SHH+1d culture CATTCTTAAT (2) 2.3 0.0023 3T3 fibroblasts GTGGTGCATA (8) 14 0.014 3T3 fibroblasts TTTGCTTTAA (10) 3.5 0.0035 P1 cortex TTTGCTTTAA (10) 18.2 0.0182 P1 cortex GTGGTGCATA (8) 4.5 0.0045 Hypothalamus TTTGCTTTAA (10) 21.7 0.0217 Hypothalamus ATTGATTAAA (6) 7.2 0.0072 Hypothalamus ATTGATTAAT (5) 5.4 0.0054 E12.5 retina TTTGCTTTAA (10) 22.5 0.0225 E12.5 retina GTGGTGCATA (8) 5.6 0.0056 E12.5 retina ATTGATTAAA (6) 3.8 0.0038 E12.5 retina ATTGATTAAT (5) 1.9 0.0019 E14.5 retina TTTGCTTTAA (10) 43.7 0.0437 E14.5 retina ATTGATTAAA (6) 12.8 0.0128 E14.5 retina GTGGTGCATA (8) 3.6 0.0036 E16.5 retina TTTGCTTTAA (10) 47.1 0.0471 E16.5 retina ATTGATTAAA (6) 7.2 0.0072 E16.5 retina ATTGATTAAT (5) 5.4 0.0054 E16.5 retina GTGGTGCATA (8) 3.6 0.0036 E18.5 retina TTTGCTTTAA (10) 41.8 0.0418 E18.5 retina ATTGATTAAA (6) 21.8 0.0218 E18.5 retina ATTGATTAAT (5) 10.9 0.0109 E18.5 retina GTGGTGCATA (8) 3.6 0.0036 P0.5 retina TTTGCTTTAA (10) 15.7 0.0157 P0.5 retina ATTGATTAAA (6) 5.9 0.0059 P0.5 retina ATTGATTAAT (5) 3.9 0.0039 P0.5 retina GTGGTGCATA (8) 2 0.002 P2.5 retina TTTGCTTTAA (10) 38.7 0.0387 P2.5 retina ATTGATTAAA (6) 8.8 0.0088 P2.5 retina GTGGTGCATA (8) 7 0.007 P2.5 retina ATTGATTAAT (5) 3.5 0.0035 P4.5 retina TTTGCTTTAA (10) 47.6 0.0476 P4.5 retina ATTGATTAAA (6) 5.9 0.0059 P4.5 retina ATTGATTAAT (5) 5.9 0.0059 P4.5 retina GTGGTGCATA (8) 2 0.002 P6.5 retina TTTGCTTTAA (10) 48.4 0.0484 P6.5 retina ATTGATTAAA (6) 11.7 0.0117 P6.5 retina ATTGATTAAT (5) 5 0.005 P6.5 retina GTGGTGCATA (8) 3.3 0.0033 P10.5 crx- retina TTTGCTTTAA (10) 31.6 0.0316 P10.5 crx- retina ATTGATTAAA (6) 7.4 0.0074 P10.5 crx- retina GTGGTGCATA (8) 1.9 0.0019 P10.5 crx+ retina TTTGCTTTAA (10) 28.8 0.0288 P10.5 crx+ retina ATTGATTAAA (6) 7.7 0.0077 P10.5 crx+ retina GTGGTGCATA (8) 3.8 0.0038 P10.5 crx+ retina ATTGATTAAT (5) 1.9 0.0019 Adult retinal GTGGTGCATA (8) 7.4 0.0074 Adult retinal TTTGCTTTAA (10) 7.4 0.0074 Adult retinal ATTGATTAAA (6) 1.9 0.0019 ONL TTTGCTTTAA (10) 15.3 0.0153 ONL ATTGATTAAA (6) 3.8 0.0038 ONL GTGGTGCATA (8) 1.9 0.0019