Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.331389	4930599N24Rik	RIKEN cDNA 4930599N24 gene	3		75383
Mm.331389	Ppp3ca	protein phosphatase 3, catalytic subunit, alpha isoform	3		19055
Gene Ontology	calcium ion transport | calmodulin binding | CTD phosphatase activity | dephosphorylation | G1/S transition of mitotic cell cycle | hydrolase activity | manganese ion binding | myosin phosphatase activity | protein binding | protein phosphatase type 1 activity | protein phosphatase type 2A activity | protein phosphatase type 2C activity | protein serine/threonine phosphatase activity | protein serine/threonine phosphatase complex | protein-nucleus import | response to stress
Human Homolog	PPP3CA[protein phosphatase 3 (formerly 2B), catalytic subunit, alpha isoform (calcineurin A alpha)]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 192 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAAAAAAAAA (2) AAAAATAAAA (3) AACTTAAAAA (3) AAGGACTGAT (2) ATAGTGTAAA (2) ATCTATACAA (2) ATGGGATTGC (2) CCCTGCAGCT (3) CTTACCTCAG (2) TGCCACAAAA (3) 238.1 0.2381 Cb medulloblastoma AAAAAAAAAA (2) AAAAATAAAA (3) AACTTAAAAA (3) AAGGACTGAT (2) AAGGAGGGCA (3) ATAGTGTAAA (2) ATGGGATTGC (2) CCCTCTGACG (2) CCCTGCAGCT (3) CTTACCTCAG (2) CTTTGATCGT (2) TGCCACAAAA (3) TGTGACATCC (4) TTTTTTAAGG (2) 943.3 0.9433 P8 GC+1d culture AAAAAAAAAA (2) AAAAATAAAA (3) AACTTAAAAA (3) ATAGTGTAAA (2) ATCTATACAA (2) CACCTGTACC (2) CCCTCTGACG (2) CCCTGCAGCT (3) CTTTGATCGT (2) GTCCTGGAAA (4) TGCACAAATA (2) TGCCACAAAA (3) TTTTTTAAGG (2) 245.2 0.2452 P8 GC+SHH+1d culture AAAAAAAAAA (2) AAAAATAAAA (3) AAAAATAAAT (2) AACTTAAAAA (3) AAGGACTGAT (2) ATAGTGTAAA (2) CCCTCTGACG (2) CCCTGCAGCT (3) CTTACCTCAG (2) GTGTCCTCTG TGCACAAATA (2) TGCCACAAAA (3) TGTGACATCC (4) TTTTAAAGGG TTTTTTAAGG (2) 323.4 0.3234 3T3 fibroblasts AAAAAAAAAA (2) 28 0.028 E15 cortex AAAAAAAAAA (2) AAGGACTGAT (2) ATGGGATTGC (2) CCCTGCAGCT (3) 227.5 0.2275 P1 cortex AAAAAAAAAA (2) AAAAATAAAA (3) AAAACACTAA (3) AACTTAAAAA (3) AAGGACTGAT (2) ATAGTGTAAA (2) CTTACCTCAG (2) CTTTGATCGT (2) 295.2 0.2952 Hypothalamus AAAAAAAAAA (2) AAAAATAAAA (3) AACTTAAAAA (3) ATCTATACAA (2) CACCTGTACC (2) CCCTCTGACG (2) CCCTGCAGCT (3) CTTACCTCAG (2) GTGTCCTCTG TGCCACAAAA (3) TTTTTTAAGG (2) 177.4 0.1774 E12.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAAAATAAAA (3) AACTTGAAAA (3) AATGTAGGCA (2) CACCTGTACC (2) CTTACCTCAG (2) CTTTGATCGT (2) TAAATGAAGG (2) TGCACAAATA (2) TGCCACAAAA (3) 156 0.156 E14.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAAAATAAAA (3) AACTTAAAAA (3) AACTTGAAAA (3) AATGTAGGCA (2) ATAGTGTAAA (2) CCCTGCAGCT (3) CTTACCTCAG (2) CTTTGATCGT (2) GTAACCGTTA (2) TGCACAAATA (2) TTTTTTAAGG (2) 140 0.14 E16.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAAAATAAAA (3) AACTTAAAAA (3) CCCTGCAGCT (3) CCCTGTAGCT (3) CTTTGATCGT (2) GTCCTGGAAA (4) TGCACAAATA (2) TTTTAAAGGG 76.1 0.0761 E18.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAAAATAAAA (3) AAAAATAAAT (2) AACTTAAAAA (3) AACTTGAAAA (3) CACCTGTACC (2) CCCTGCAGCT (3) CTTACCTCAG (2) GTAACCGTTA (2) TAAATGAAGG (2) TGCACAAATA (2) TGCCACAAAA (3) TTTTTTAAGG (2) 414.6 0.4146 P0.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAAAATAAAA (3) AACTTAAAAA (3) AAGGACTGAT (2) CCCTCTGACG (2) CCCTGTAGCT (3) CTTTGATCGT (2) TGCACAAATA (2) TTTTTTAAGG (2) 135.7 0.1357 P2.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAAAATAAAA (3) AACTTAAAAA (3) CACCTGTACC (2) CCCTGCAGCT (3) CTTACCTCAG (2) TGCCACAAAA (3) TTTTAAAGGG TTTTTTAAGG (2) 355.7 0.3557 P4.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAAAATAAAA (3) AAAACACTAA (3) AACTTAAAAA (3) AATGTAGGCA (2) CCCTGCAGCT (3) TGCACAAATA (2) TGTGACATCC (4) TTTTTTAAGG (2) 317 0.317 P6.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAAAATAAAA (3) AAAAATAAAT (2) AACTTAAAAA (3) CCCTCTGACG (2) CCCTGCAGCT (3) CCCTGTAGCT (3) CTTTGATCGT (2) GTGTCCTCTG TAAATGAAGG (2) TGCACAAATA (2) TGCCACAAAA (3) TTTTTTAAGG (2) 327 0.327 P10.5 crx- retina AAAAAAAAAA (2) AAAAATAAAA (3) AAAAATAAAT (2) AACTTAAAAA (3) AAGGAGGGCA (3) AATGTAGGCA (2) CCCTGTAGCT (3) 68.9 0.0689 P10.5 crx+ retina AAAAAAAAAA (2) AAAAATAAAA (3) AACTTAAAAA (3) AAGGACTGAT (2) CCCTCTGACG (2) CCCTGCAGCT (3) TGCACAAATA (2) 121 0.121 Adult retinal AAAAAAAAAA (2) AAAAATAAAA (3) AAAACACTAA (3) AACTTAAAAA (3) AACTTGAAAA (3) CCCTGCAGCT (3) GTCCTGGAAA (4) GTGTCCTCTG 72.5 0.0725 ONL AAAAAAAAAA (2) AAAAATAAAT (2) AAAACACTAA (3) AAGGAGGGCA (3) CCCTCTGACG (2) CCCTGCAGCT (3) CTTACCTCAG (2) CTTTGATCGT (2) GTAACCGTTA (2) GTGTCCTCTG 133.9 0.1339