Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.331640 Rod1ROD1 regulator of differentiation 1 (S. pombe) 4    230257 
 Mm.331640 1700018M17RikRIKEN cDNA 1700018M17 gene 4    72245 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 38 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCACTATGATTG (3)
GCATCTGTAC (2)
GGATCATTTA (2)
GGATCTTTTA (2)
TTTTAAATTT (3)
11.40.0114
Cb medulloblastomaGCATCTGTAA (2)
GCATCTGTAC (2)
4.60.0046
P8 GC+1d cultureACTATGATTG (3)
GCATCTGTAC (2)
TAAAACATTA (3)
TTTGAAGCCA (2)
TTTTAAATTT (3)
12.50.0125
P8 GC+SHH+1d cultureGCATCTGTAA (2)
GCATCTGTAC (2)
GGATCATTTA (2)
TTTGAAGCCA (2)
5.90.0059
E15 cortexTTTTAAATTT (3)
4.90.0049
P1 cortexGCATCTGTAC (2)
4.50.0045
HypothalamusGCATCTGTAA (2)
1.80.0018
E12.5 retinaGGATCTTTTA (2)
TTTGAAGCCA (2)
TTTTAAATTT (3)
7.60.0076
E14.5 retinaGCATCTGTAA (2)
GCATCTGTAC (2)
TAAAACATTA (3)
TTTTAAATTT (3)
12.70.0127
E16.5 retinaGCATCTGTAC (2)
GGATCATTTA (2)
3.60.0036
E18.5 retinaGCATCTGTAA (2)
GCATCTGTAC (2)
3.60.0036
P2.5 retinaGCATCTGTAC (2)
TTTTAAATTT (3)
3.60.0036
P6.5 retinaGCATCTGTAC (2)
1.70.0017
P10.5 crx- retinaGCATCTGTAC (2)
TTTTAAATTT (3)
3.80.0038
P10.5 crx+ retinaGCATCTGTAC (2)
GGATCTTTTA (2)
3.80.0038
ONLTTTTAAATTT (3)
1.90.0019