Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.337558 Nap1l1nucleosome assembly protein 1-like 1 10  10 60.0 cM  53605 
 Gene Ontology DNA binding | nucleosome assembly | nucleus
 Human Homolog NAP1L1[nucleosome assembly protein 1-like 1]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 99 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCACTATTCACA
ATAATCATCG
ATGAACCTAT (3)
ATTTTTAAAA (4)
GGAAACTGTT (2)
TCACTGAGCA
TGAAGACAGT
TTGTTAGAGG (3)
30.90.0309
Cb medulloblastomaATTTTTAAAA (4)
11.60.0116
P8 GC+1d cultureACTATTCACA
ATGAACCTAT (3)
ATTTTTAAAA (4)
TGAAGACAGT
TTGTTAGAGG (3)
35.40.0354
P8 GC+SHH+1d cultureACTATTCACA
ATGAACCTAT (3)
ATTTTTAAAA (4)
GGAAACTGTT (2)
TGAAGACAGT
TTGTTAGAGG (3)
35.10.0351
3T3 fibroblastsATCTCGAGAG (3)
TCACTGAGCA
TGAAGACAGT
TTGTTAGAGG (3)
630.063
E15 cortexACTATTCACA
ATCTCGAGAG (3)
ATGAACCTAT (3)
TGAAGACAGT
TTGTTAGAGG (3)
24.50.0245
P1 cortexATGAACCTAT (3)
ATTTTTAAAA (4)
TTGTTAGAGG (3)
36.30.0363
HypothalamusACTATTCACA
ATAATCATCG
ATTTTTAAAA (4)
TCACTGAGCA
TTGTTAGAGG (3)
23.50.0235
E12.5 retinaACTATTCACA
ATCTCGAGAG (3)
ATGAACCTAT (3)
ATTTTTAAAA (4)
TCACTGAGCA
TGAAGACAGT
TTGTTAGAGG (3)
41.40.0414
E14.5 retinaACTATTCACA
ATTTTTAAAA (4)
TGAAGACAGT
7.20.0072
E16.5 retinaACTATTCACA
ATAATCATCG
ATCTCGAGAG (3)
TCACTGAGCA
TGAAGACAGT
TTCATTTATT (3)
TTGTTAGAGG (3)
21.60.0216
E18.5 retinaACTATTCACA
ATGAACCTAT (3)
ATTTTTAAAA (4)
GGAAACTGTT (2)
TGAAGACAGT
TTCATTTATT (3)
TTGTTAGAGG (3)
27.30.0273
P0.5 retinaACTATTCACA
ATCTCGAGAG (3)
ATGAACCTAT (3)
ATTTTTAAAA (4)
TTGTTAGAGG (3)
31.50.0315
P2.5 retinaATGAACCTAT (3)
ATTTTTAAAA (4)
TCACTGAGCA
TGAAGACAGT
TTCATTTATT (3)
TTGTTAGAGG (3)
14.20.0142
P4.5 retinaACTATTCACA
ATTTTTAAAA (4)
TGAAGACAGT
TTCATTTATT (3)
TTGTTAGAGG (3)
13.90.0139
P6.5 retinaATCTCGAGAG (3)
ATGAACCTAT (3)
ATTTTTAAAA (4)
TGAAGACAGT
TTGTTAGAGG (3)
28.30.0283
P10.5 crx- retinaATAATCATCG
ATTTTTAAAA (4)
TTGTTAGAGG (3)
11.20.0112
P10.5 crx+ retinaATCTCGAGAG (3)
ATGAACCTAT (3)
ATTTTTAAAA (4)
TCACTGAGCA
TGAAGACAGT
TTGTTAGAGG (3)
17.20.0172
Adult retinalATGAACCTAT (3)
ATTTTTAAAA (4)
TCACTGAGCA
TGAAGACAGT
TTGTTAGAGG (3)
16.90.0169
ONLATGAACCTAT (3)
ATTTTTAAAA (4)
TTCATTTATT (3)
17.20.0172