| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | AAGAGTTATG (2) TAGCCTGGTC TGGTGGGTGC TGTGGGTTGG (3)
| 9.7 | 0.0097 |
| Cb medulloblastoma | TGGTGGGTGC
| 2.3 | 0.0023 |
| P8 GC+1d culture | AAGAGTTATG (2)
| 3.4 | 0.0034 |
| P8 GC+SHH+1d culture | AAGAGTTATG (2) TAGCCTGGTC
| 3.5 | 0.0035 |
| 3T3 fibroblasts | AGAAGGAGCG TGGTGGGTGC TGTGGGTTGG (3)
| 17.5 | 0.0175 |
| E15 cortex | TGGGAGGGCC
| 4.9 | 0.0049 |
| P1 cortex | TTGCTATGGT (2)
| 4.5 | 0.0045 |
| Hypothalamus | AAGAGTTATG (2) TGTGGGTTGG (3)
| 9 | 0.009 |
| E12.5 retina | AAGAGTTATG (2) TGTGGGTTGG (3)
| 11.2 | 0.0112 |
| E14.5 retina | AAGAGTTATG (2) AGAAGGAGCG TGGGAGGGCC TGGTGGGTGC
| 9 | 0.009 |
| E16.5 retina | TGGTGGGTGC TTGCTATGGT (2)
| 5.4 | 0.0054 |
| E18.5 retina | AAGAGTTATG (2) TGTGGGTTGG (3)
| 5.4 | 0.0054 |
| P0.5 retina | AAGAGTTATG (2) TGGTGGGTGC TGTGGGTTGG (3)
| 15.7 | 0.0157 |
| P2.5 retina | AAGAGTTATG (2) TGTGGGTTGG (3) TTGCTATGGT (2)
| 17.6 | 0.0176 |
| P4.5 retina | AAGAGTTATG (2) TGTGGGTTGG (3)
| 17.9 | 0.0179 |
| P6.5 retina | AAGAGTTATG (2) TAGCCTGGTC TGGGAGGGCC TGTGGGTTGG (3) TTGCTATGGT (2)
| 21.7 | 0.0217 |
| P10.5 crx- retina | AAGAGTTATG (2) TAGCCTGGTC TGGTGGGTGC
| 14.9 | 0.0149 |
| P10.5 crx+ retina | AAGAGTTATG (2) AGAAGGAGCG TGGTGGGTGC TGTGGGTTGG (3)
| 13.4 | 0.0134 |
| Adult retinal | AAGAGTTATG (2) TGTGGGTTGG (3) TTGCTATGGT (2)
| 14.9 | 0.0149 |
| ONL | AAGAGTTATG (2) TGTGGGTTGG (3)
| 5.7 | 0.0057 |