Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.341886 1110067M05RikRIKEN cDNA 1110067M05 gene 11    68851 
 Mm.341886 Thrap1thyroid hormone receptor associated protein 1 11    327987 
 Mm.341886 2700033K15RikRIKEN cDNA 2700033K15 gene 11    72594 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 56 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAGCCAAAAA (4)
AAGCCTTAAA (3)
ACAAACAATT (3)
CTTACATCCG (3)
GAGGTGATGC (3)
9.70.0097
Cb medulloblastomaAAGCAAAAAA (4)
AAGCCTTAAA (3)
AAGCCTTCAA (3)
TTAAAAAGAA (5)
16.10.0161
P8 GC+1d cultureAAGCAAAAAA (4)
AAGCCTTAAA (3)
AAGCCTTCAA (3)
ACAAACAATT (3)
GCAGGAAGAG (3)
TTAAAAAGAA (5)
TTGAAAAGAA (4)
12.40.0124
P8 GC+SHH+1d cultureAAGCCTTCAA (3)
TTAAAAAGAA (5)
3.50.0035
3T3 fibroblastsAAGCCTTCAA (3)
CTTACATCCG (3)
70.007
E15 cortexCTTACATCCG (3)
4.90.0049
E12.5 retinaAAGCCTTAAA (3)
GAGGTGATGC (3)
3.80.0038
E14.5 retinaAAGCAAAAAA (4)
AAGCCTTAAA (3)
AAGCCTTCAA (3)
TTGAAAAGAA (4)
10.80.0108
E16.5 retinaAAGCCTTCAA (3)
TTGAAAAGAA (4)
5.40.0054
E18.5 retinaAAGCAAAAAA (4)
AAGCCAAAAA (4)
AAGCCTTAAA (3)
AAGCCTTCAA (3)
18.20.0182
P0.5 retinaAAGCCTTCAA (3)
20.002
P2.5 retinaAAGCAAAAAA (4)
AAGCCAAAAA (4)
AAGCCTTAAA (3)
AAGCCTTCAA (3)
14.10.0141
P4.5 retinaAAGCCTTAAA (3)
AAGCCTTCAA (3)
GCAGGAAGAG (3)
TTGAAAAGAA (4)
120.012
P6.5 retinaAAGCCAAAAA (4)
AAGCCTTAAA (3)
AAGCCTTCAA (3)
TTGAAAAGAA (4)
6.80.0068
P10.5 crx- retinaAAGCCTTAAA (3)
ACAAACAATT (3)
5.60.0056
P10.5 crx+ retinaAAGCCTTAAA (3)
AAGCCTTCAA (3)
3.80.0038
Adult retinalAAGCCTTCAA (3)
GCAGGAAGAG (3)
3.80.0038
ONLAAGCCAAAAA (4)
AAGCCTTAAA (3)
AAGCCTTCAA (3)
GAGGTGATGC (3)
24.80.0248