Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.34869	Ndufa1	NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 1	X		54405
Gene Ontology	extracellular space | mitochondrion | oxidoreductase activity
Human Homolog	NDUFA1[NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 1, 7.5kDa]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 46 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC TTATGAAATG (2) 37.5 0.0375 P8 Cb GC CTATGAAATG (2) 1.6 0.0016 Cb medulloblastoma TTATGAAATG (2) 39.3 0.0393 Cb medulloblastoma CTATGAAATG (2) 2.3 0.0023 P8 GC+1d culture TTATGAAATG (2) 34.2 0.0342 P8 GC+SHH+1d culture TTATGAAATG (2) 35.1 0.0351 3T3 fibroblasts GTCATAGCTG (590) 10.5 0.0105 3T3 fibroblasts TTATGAAATG (2) 3.5 0.0035 E15 cortex TTATGAAATG (2) 9.9 0.0099 E15 cortex GTCATAGCTG (590) 4.9 0.0049 P1 cortex TTATGAAATG (2) 27.3 0.0273 Hypothalamus TTATGAAATG (2) 70.6 0.0706 Hypothalamus TGATGAAATG (7) 5.4 0.0054 Hypothalamus AGGGGGTTGG (3) 3.6 0.0036 Hypothalamus CTATGAAATG (2) 1.8 0.0018 Hypothalamus TTATGGAATG (2) 1.8 0.0018 E12.5 retina TTATGAAATG (2) 30 0.03 E12.5 retina CGCATAGTAT 1.9 0.0019 E14.5 retina TTATGAAATG (2) 34.6 0.0346 E14.5 retina CTATGAAATG (2) 1.8 0.0018 E16.5 retina TTATGAAATG (2) 47.1 0.0471 E16.5 retina CGCATAGTAT 3.6 0.0036 E18.5 retina TTATGAAATG (2) 85.5 0.0855 P0.5 retina TTATGAAATG (2) 21.6 0.0216 P0.5 retina GTCATAGCTG (590) 3.9 0.0039 P0.5 retina TGATGAAATG (7) 2 0.002 P2.5 retina TTATGAAATG (2) 35.2 0.0352 P2.5 retina GTCATAGCTG (590) 1.8 0.0018 P4.5 retina TTATGAAATG (2) 37.6 0.0376 P4.5 retina CTATGAAATG (2) 2 0.002 P4.5 retina GTCATAGCTG (590) 2 0.002 P4.5 retina TGATGAAATG (7) 2 0.002 P4.5 retina TTATGGAATG (2) 2 0.002 P6.5 retina TTATGAAATG (2) 56.7 0.0567 P6.5 retina GTCATAGCTG (590) 3.3 0.0033 P10.5 crx- retina TTATGAAATG (2) 46.4 0.0464 P10.5 crx- retina TGATGAAATG (7) 5.6 0.0056 P10.5 crx+ retina TTATGAAATG (2) 36.5 0.0365 P10.5 crx+ retina TGATGAAATG (7) 1.9 0.0019 Adult retinal TTATGAAATG (2) 22.2 0.0222 Adult retinal GTCATAGCTG (590) 1.9 0.0019 Adult retinal TGATGAAATG (7) 1.9 0.0019 ONL TTATGAAATG (2) 19.2 0.0192 ONL GTCATAGCTG (590) 5.7 0.0057 ONL AGGGGGTTGG (3) 3.8 0.0038 ONL TGATGAAATG (7) 1.9 0.0019