Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.35754 6720425G15RikRIKEN cDNA 6720425G15 gene 12    217893 
 Mm.35754 C80068expressed sequence C80068 12    97810 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 99 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAATCCTGCTT (2)
ATGTCTCACA
CTACAGTTCC
CTCTGCTGCT (2)
GAGAAACACT
GCGGAGGTTT (2)
TAAAAAAAAA (3)
TCCTTCTTCT (2)
TGGACGATTT (2)
TGGGATCTGA (3)
76.60.0766
Cb medulloblastomaGCGGAGGTTT (2)
TAAAAAAAAA (3)
TGGACGATTT (2)
TGGGATCTGA (3)
120.20.1202
P8 GC+1d cultureCTACAGTTCC
GCGGAGGTTT (2)
GTTGCCCTAG
TAAAAAAAAA (3)
TGGACGATTT (2)
82.10.0821
P8 GC+SHH+1d cultureAATCCTGCTT (2)
CTACAGTTCC
GCGGAGGTTT (2)
TAAAAAAAAA (3)
TGGACGATTT (2)
111.20.1112
3T3 fibroblastsTAAAAAAAAA (3)
70.007
E15 cortexCTACAGTTCC
GCGGAGGTTT (2)
TAAAAAAAAA (3)
TCCTTCTTCT (2)
TGGACGATTT (2)
34.50.0345
P1 cortexCTACAGTTCC
GTTGCCCTAG
TAAAAAAAAA (3)
TGGACGATTT (2)
72.70.0727
HypothalamusAATCCTGCTT (2)
GCGGAGGTTT (2)
GGGCTGCAGG (2)
TAAAAAAAAA (3)
TGGACGATTT (2)
TGGGATCTGA (3)
57.90.0579
E12.5 retinaATGTCTCACA
GAGAAACACT
GCGGAGGTTT (2)
GGGCTGCAGG (2)
TAAAAAAAAA (3)
TGGACGATTT (2)
39.50.0395
E14.5 retinaAATCCTGCTT (2)
CTACAGTTCC
GCGGAGGTTT (2)
TAAAAAAAAA (3)
TGGACGATTT (2)
63.80.0638
E16.5 retinaATGTCTCACA
GCGGAGGTTT (2)
TAAAAAAAAA (3)
TCCTTCTTCT (2)
TGGACGATTT (2)
470.047
E18.5 retinaGCGGAGGTTT (2)
TAAAAAAAAA (3)
TGGACGATTT (2)
121.80.1218
P0.5 retinaAATCCTGCTT (2)
CTACAGTTCC
GCGGAGGTTT (2)
TAAAAAAAAA (3)
TGGACGATTT (2)
55.10.0551
P2.5 retinaAATCCTGCTT (2)
GCGGAGGTTT (2)
GTTGCCCTAG
TAAAAAAAAA (3)
TGGACGATTT (2)
88.10.0881
P4.5 retinaAATCCTGCTT (2)
CTCTGCTGCT (2)
GCGGAGGTTT (2)
TAAAAAAAAA (3)
TGGACGATTT (2)
148.60.1486
P6.5 retinaCTACAGTTCC
GCGGAGGTTT (2)
TAAAAAAAAA (3)
TGGACGATTT (2)
86.70.0867
P10.5 crx- retinaAATCCTGCTT (2)
GGGCTGCAGG (2)
TAAAAAAAAA (3)
TGGACGATTT (2)
20.50.0205
P10.5 crx+ retinaAATCCTGCTT (2)
GAGAAACACT
GCGGAGGTTT (2)
GTTGCCCTAG
TAAAAAAAAA (3)
TGGACGATTT (2)
480.048
Adult retinalCTACAGTTCC
GAGAAACACT
GCGGAGGTTT (2)
GTTGCCCTAG
TAAAAAAAAA (3)
TCCTTCTTCT (2)
TGGACGATTT (2)
410.041
ONLCTCTGCTGCT (2)
GCGGAGGTTT (2)
TAAAAAAAAA (3)
TGGACGATTT (2)
38.20.0382