Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.37577	Mbtps2	membrane-bound transcription factor protease, site 2	X		270669
Mm.37577	AI662535	expressed sequence AI662535	X		102930
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 93 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAAGCAAAAA (4) AAATTGGACA (3) GCCTCTGAGA (3) TGTGTGTGTG (2) TTTGATGGAT (5) 35.8 0.0358 Cb medulloblastoma AAAGCAAAAA (4) GCCTCTGAGA (3) TGTGTGTGTG (2) 37 0.037 P8 GC+1d culture AAAGCAAAAA (4) AAATTGGACA (3) CAATCAATGT GCCTCTGAGA (3) TACATATTAT (2) TCCACCTCTT TGTGTGTGTG (2) TTTGATGGAT (5) 46.7 0.0467 P8 GC+SHH+1d culture AAATTGGACA (3) GCCTCTGAGA (3) TACATATTAT (2) TCCACCTCTT TCCAGCCCTT (2) TGTGTGTGTG (2) TTTGATGGAT (5) 48.1 0.0481 3T3 fibroblasts AAATTGGACA (3) GCCTCTGAGA (3) TCCACCTCTT TGTGTGTGTG (2) 42 0.042 P1 cortex AAATTGGACA (3) TGTGTGTGTG (2) 54.6 0.0546 Hypothalamus AAATTGGACA (3) CAATCAATGT GCCTCTGAGA (3) TGTGTGTGTG (2) 34.4 0.0344 E12.5 retina AAAGCAAAAA (4) AAATTGGACA (3) GCCTCTGAGA (3) TGTGTGTGTG (2) 50.8 0.0508 E14.5 retina AAAGCAAAAA (4) AAATTGGACA (3) GCCTCTGAGA (3) TCCACCTCTT TGTGTGTGTG (2) 67.4 0.0674 E16.5 retina AAAGCAAAAA (4) AAATTGGACA (3) GCCTCTGAGA (3) TCCACCTCTT TCCAGCCCTT (2) TGTGTGTGTG (2) TTTGATGGAT (5) 54.2 0.0542 E18.5 retina AAAGCAAAAA (4) AAATTGGACA (3) CAATCAATGT GCCTCTGAGA (3) TGTGTGTGTG (2) 56.3 0.0563 P0.5 retina AAATTGGACA (3) CAATCAATGT GCCTCTGAGA (3) TCCACCTCTT TGTGTGTGTG (2) 47.2 0.0472 P2.5 retina CAATCAATGT GCCTCTGAGA (3) TACATATTAT (2) TGTGTGTGTG (2) TTTGATGGAT (5) 47.6 0.0476 P4.5 retina AAAGCAAAAA (4) AAATTGGACA (3) GCCTCTGAGA (3) TGTGTGTGTG (2) 69.5 0.0695 P6.5 retina AAAGCAAAAA (4) AAATTGGACA (3) CAATCAATGT TCCACCTCTT TCCAGCCCTT (2) TGTGTGTGTG (2) 61.7 0.0617 P10.5 crx- retina AAAGCAAAAA (4) AAATTGGACA (3) TCCACCTCTT TGTGTGTGTG (2) 68.8 0.0688 P10.5 crx+ retina AAAGCAAAAA (4) AAATTGGACA (3) CAATCAATGT GCCTCTGAGA (3) TCCAGCCCTT (2) TGTGTGTGTG (2) 73 0.073 Adult retinal AAAGCAAAAA (4) AAATTGGACA (3) GCCTCTGAGA (3) TCCACCTCTT TGTGTGTGTG (2) 79.7 0.0797 ONL AAAGCAAAAA (4) AAATTGGACA (3) TCCAGCCCTT (2) TGTGTGTGTG (2) 57.5 0.0575