Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.38526 1100001I19RikRIKEN cDNA 1100001I19 gene 9    244745 
 Human Homolog KIAA0877[KIAA0877 protein]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 101 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAAAAAAAA (658)203.90.2039
P8 Cb GCAAAAATGAAA (6)1.60.0016
P8 Cb GCTAAACAAGGG1.60.0016
P8 Cb GCTGGGGGATAT (2)1.60.0016
Cb medulloblastomaAAAAAAAAAA (658)797.80.7978
Cb medulloblastomaAAAAATGAAA (6)2.30.0023
Cb medulloblastomaCTGGCAATGA (2)2.30.0023
Cb medulloblastomaGAAAAAAAGA (7)2.30.0023
Cb medulloblastomaGAGGGATGTT (14)2.30.0023
P8 GC+1d cultureAAAAAAAAAA (658)204.30.2043
P8 GC+1d cultureAAAAATGAAA (6)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTACTATATAT1.10.0011
P8 GC+1d cultureTGAACTTATT1.10.0011
P8 GC+1d cultureTGGGGGATAT (2)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureAAAAAAAAAA (658)278.70.2787
P8 GC+SHH+1d cultureAAAAATGAAA (6)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureTGAACTTATT2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureGAAAAAAAGA (7)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureGAGGGATGTT (14)1.20.0012
3T3 fibroblastsAAAAAAAAAA (658)280.028
3T3 fibroblastsCTGCTGGGCT (4)3.50.0035
3T3 fibroblastsGAGGGATGTT (14)3.50.0035
E15 cortexAAAAAAAAAA (658)212.80.2128
E15 cortexCTGCTGGGCT (4)4.90.0049
E15 cortexGAGGGATGTT (14)4.90.0049
P1 cortexAAAAAAAAAA (658)245.40.2454
P1 cortexCTGCTGGGCT (4)4.50.0045
HypothalamusAAAAAAAAAA (658)123.20.1232
HypothalamusTGGGGGATAT (2)3.60.0036
HypothalamusCCTGCCTGCT (8)1.80.0018
HypothalamusGAAAAAAAGA (7)1.80.0018
HypothalamusTACTATATAT1.80.0018
E12.5 retinaAAAAAAAAAA (658)138.90.1389
E12.5 retinaCTGGCAATGA (2)3.80.0038
E12.5 retinaGAGGGATGTT (14)3.80.0038
E12.5 retinaTGAACTTATT3.80.0038
E12.5 retinaTGGGGGATAT (2)1.90.0019
E14.5 retinaAAAAAAAAAA (658)94.70.0947
E14.5 retinaGAGGGATGTT (14)23.70.0237
E14.5 retinaTAAACAAGGG5.50.0055
E14.5 retinaAAAAATGAAA (6)1.80.0018
E14.5 retinaTACTATATAT1.80.0018
E14.5 retinaTGGGGGATAT (2)1.80.0018
E16.5 retinaAAAAAAAAAA (658)43.50.0435
E16.5 retinaGAGGGATGTT (14)5.40.0054
E16.5 retinaTGGGGGATAT (2)5.40.0054
E16.5 retinaTACTATATAT1.80.0018
E16.5 retinaTGGAAGAGTG (2)1.80.0018
E18.5 retinaAAAAAAAAAA (658)374.70.3747
E18.5 retinaGAGGGATGTT (14)3.60.0036
E18.5 retinaTGGAAGAGTG (2)3.60.0036
E18.5 retinaAAAAATGAAA (6)1.80.0018
E18.5 retinaCCTGCCTGCT (8)1.80.0018
E18.5 retinaTAAACAAGGG1.80.0018
P0.5 retinaAAAAAAAAAA (658)117.80.1178
P0.5 retinaTGGGGGATAT (2)3.90.0039
P0.5 retinaCCTGGCTGCT (5)20.002
P0.5 retinaGAAAAAAAGA (7)20.002
P0.5 retinaGAGGGATGTT (14)20.002
P2.5 retinaAAAAAAAAAA (658)329.10.3291
P2.5 retinaAAAAATGAAA (6)3.50.0035
P2.5 retinaGAGGGATGTT (14)1.80.0018
P2.5 retinaGCTCTGCATC (3)1.80.0018
P2.5 retinaTGAACTTATT1.80.0018
P4.5 retinaAAAAAAAAAA (658)283.30.2833
P4.5 retinaGAGGGATGTT (14)5.90.0059
P4.5 retinaCCTGCCTGCT (8)20.002
P4.5 retinaTGGAAGAGTG (2)20.002
P4.5 retinaTGGGGGATAT (2)20.002
P6.5 retinaAAAAAAAAAA (658)266.80.2668
P6.5 retinaCCTGGCTGCT (5)3.30.0033
P6.5 retinaAAAAATGAAA (6)1.70.0017
P6.5 retinaCCAGATAAAA (2)1.70.0017
P6.5 retinaGAGGGATGTT (14)1.70.0017
P6.5 retinaGCTCTGCATC (3)1.70.0017
P6.5 retinaTAAACAAGGG1.70.0017
P6.5 retinaTGAACTTATT1.70.0017
P6.5 retinaTGGGGGATAT (2)1.70.0017
P10.5 crx- retinaAAAAAAAAAA (658)44.60.0446
P10.5 crx- retinaTGGGGGATAT (2)7.40.0074
P10.5 crx- retinaGAGGGATGTT (14)1.90.0019
P10.5 crx- retinaGCTCTGCATC (3)1.90.0019
P10.5 crx- retinaTGAACTTATT1.90.0019
P10.5 crx+ retinaAAAAAAAAAA (658)96.10.0961
P10.5 crx+ retinaCCAGATAAAA (2)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaGAGGGATGTT (14)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaAAAAATGAAA (6)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCCTGGCTGCT (5)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGCTCTGCATC (3)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTACTATATAT1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTGAACTTATT1.90.0019
Adult retinalAAAAAAAAAA (658)57.40.0574
Adult retinalCCTGGCTGCT (5)5.60.0056
Adult retinalGAGGGATGTT (14)1.90.0019
ONLAAAAAAAAAA (658)103.40.1034
ONLGAGGGATGTT (14)5.70.0057
ONLAAAAATGAAA (6)1.90.0019
ONLCCTGGCTGCT (5)1.90.0019
ONLCTGCTGGGCT (4)1.90.0019
ONLGAAAAAAAGA (7)1.90.0019
ONLTGAACTTATT1.90.0019