| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | CACAGCTGCT (3) TAAAAAGTCA TATCGCTGGT (2) TTTGTCACCA
| 31 | 0.031 |
| Cb medulloblastoma | TTTGTCACCA
| 11.6 | 0.0116 |
| P8 GC+1d culture | AGCTCAGTGT CACAGCTGCT (3) TAAAAAGTCA TATCGCTGGT (2) TATGGCATCT TTTGTCACCA
| 15.8 | 0.0158 |
| P8 GC+SHH+1d culture | CACAGCTGCT (3) TAAAAAGTCA TATCGCTGGT (2) TTTGTCACCA
| 27 | 0.027 |
| 3T3 fibroblasts | TATGGCATCT TTTGTCACCA
| 14 | 0.014 |
| E15 cortex | TATCGCTGGT (2) TTTGTCACCA
| 9.8 | 0.0098 |
| P1 cortex | TTTGTCACCA
| 9.1 | 0.0091 |
| Hypothalamus | CACAGCTGCT (3) TATCGCTGGT (2) TTTGTCACCA
| 19.9 | 0.0199 |
| E12.5 retina | CACAGCTGCT (3) TTTGTCACCA
| 30.1 | 0.0301 |
| E14.5 retina | TAAAAAGTCA TATCGCTGGT (2) TATGGCATCT TTTGTCACCA
| 27.3 | 0.0273 |
| E16.5 retina | AGCTCAGTGT CACAGCTGCT (3) TAAAAAGTCA TATCGCTGGT (2) TATGGCATCT TTTGTCACCA
| 34.3 | 0.0343 |
| E18.5 retina | CACAGCTGCT (3) TAAAAAGTCA TTTGTCACCA
| 27.2 | 0.0272 |
| P0.5 retina | AGCTCAGTGT TTTGTCACCA
| 37.3 | 0.0373 |
| P2.5 retina | TAAAAAGTCA TATCGCTGGT (2) TATGGCATCT TTTGTCACCA
| 33.6 | 0.0336 |
| P4.5 retina | TAAAAAGTCA TTTGTCACCA
| 35.7 | 0.0357 |
| P6.5 retina | TATCGCTGGT (2) TTTGTCACCA
| 18.4 | 0.0184 |
| P10.5 crx- retina | TATCGCTGGT (2) TTTGTCACCA
| 7.5 | 0.0075 |
| P10.5 crx+ retina | TAAAAAGTCA TATCGCTGGT (2) TTTGTCACCA
| 40.3 | 0.0403 |
| Adult retinal | TTTGTCACCA
| 9.3 | 0.0093 |
| ONL | TAAAAAGTCA TTTGTCACCA
| 5.7 | 0.0057 |