Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.40546 AI839402expressed sequence AI839402 16    106263 
 Mm.40546 Itsn1intersectin 1 (SH3 domain protein 1A) 16    16443 
 Gene Ontology calcium ion binding | endocytosis | lamellipodium | protein binding | small GTPase mediated signal transduction
 Human Homolog ITSN1[intersectin 1 (SH3 domain protein)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 112 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCTGGTTGCTGG (369)68.50.0685
P8 Cb GCATCAAGGGTG (4)9.80.0098
P8 Cb GCGGGCTGCTCA (7)9.80.0098
P8 Cb GCTGTGGAAGTG (6)8.20.0082
P8 Cb GCGATATGAATG (4)1.60.0016
P8 Cb GCTGATCGAAAT (2)1.60.0016
Cb medulloblastomaTGGTTGCTGG (369)113.30.1133
Cb medulloblastomaGGGCTGCTCA (7)6.90.0069
Cb medulloblastomaTGTGGAAGTG (6)4.60.0046
Cb medulloblastomaGCTTCTAGAG (2)2.30.0023
Cb medulloblastomaTATTCAGTTG (2)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTGGTTGCTGG (369)57.10.0571
P8 GC+1d cultureGGGCTGCTCA (7)9.10.0091
P8 GC+1d cultureTGTGGAAGTG (6)5.70.0057
P8 GC+1d cultureTGATCGAAAT (2)2.30.0023
P8 GC+1d cultureGATATGAATG (4)1.10.0011
P8 GC+1d cultureGCTTCTAGAG (2)1.10.0011
P8 GC+1d cultureTCTCATTTTA (3)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureTGGTTGCTGG (369)890.089
P8 GC+SHH+1d cultureGGGCTGCTCA (7)11.70.0117
P8 GC+SHH+1d cultureGATATGAATG (4)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureCATTTAACTG (3)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTATTCAGTTG (2)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTGGTGGTTTG (7)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTGTGGAAGTG (6)1.20.0012
3T3 fibroblastsTGGTTGCTGG (369)220.80.2208
3T3 fibroblastsGGGCTGCTCA (7)70.007
E15 cortexTGGTTGCTGG (369)277.10.2771
E15 cortexGGGCTGCTCA (7)24.70.0247
E15 cortexTATTCAGTTG (2)4.90.0049
P1 cortexTGGTTGCTGG (369)86.40.0864
P1 cortexCATTTAACTG (3)4.50.0045
P1 cortexGGGCTGCTCA (7)4.50.0045
P1 cortexTGATCGAAAT (2)4.50.0045
HypothalamusTGGTTGCTGG (369)349.60.3496
HypothalamusTCACATCCAA (5)5.40.0054
HypothalamusTGTGGAAGTG (6)5.40.0054
HypothalamusATCAAGGGTG (4)1.80.0018
HypothalamusGGGCTGCTCA (7)1.80.0018
HypothalamusTATTCAGTTG (2)1.80.0018
E12.5 retinaTGGTTGCTGG (369)157.70.1577
E12.5 retinaGGGCTGCTCA (7)20.70.0207
E12.5 retinaGAAAGAGCAA (2)3.80.0038
E12.5 retinaGATATGAATG (4)3.80.0038
E12.5 retinaATCAAGGGTG (4)1.90.0019
E12.5 retinaGCTTCTAGAG (2)1.90.0019
E12.5 retinaTGTGGAAGTG (6)1.90.0019
E14.5 retinaTGGTTGCTGG (369)936.50.9365
E14.5 retinaGGGCTGCTCA (7)12.80.0128
E14.5 retinaGATATGAATG (4)5.50.0055
E14.5 retinaGAAAGAGCAA (2)3.60.0036
E14.5 retinaATCAAGGGTG (4)1.80.0018
E14.5 retinaCGCGACAGGT (3)1.80.0018
E14.5 retinaTGGTGGTTTG (7)1.80.0018
E16.5 retinaTGGTTGCTGG (369)767.90.7679
E16.5 retinaATCAAGGGTG (4)10.90.0109
E16.5 retinaGGGCTGCTCA (7)9.10.0091
E16.5 retinaGATATGAATG (4)3.60.0036
E16.5 retinaTGTGGAAGTG (6)3.60.0036
E16.5 retinaATTACGCCAA (233)1.80.0018
E16.5 retinaTGGTGGTTTG (7)1.80.0018
E18.5 retinaTGGTTGCTGG (369)252.80.2528
E18.5 retinaATCAAGGGTG (4)1.80.0018
E18.5 retinaGAAAGAGCAA (2)1.80.0018
E18.5 retinaGGGCTGCTCA (7)1.80.0018
E18.5 retinaTGGTGGTTTG (7)1.80.0018
E18.5 retinaTGTGGAAGTG (6)1.80.0018
P0.5 retinaTGGTTGCTGG (369)190.40.1904
P0.5 retinaGGGCTGCTCA (7)11.80.0118
P0.5 retinaTGTGGAAGTG (6)11.80.0118
P0.5 retinaATCAAGGGTG (4)20.002
P0.5 retinaATTACGCCAA (233)20.002
P0.5 retinaTATTCAGTTG (2)20.002
P0.5 retinaTCTCATTTTA (3)20.002
P0.5 retinaTGGTGGTTTG (7)20.002
P2.5 retinaTGGTTGCTGG (369)165.40.1654
P2.5 retinaGGGCTGCTCA (7)8.80.0088
P2.5 retinaTGTGGAAGTG (6)70.007
P2.5 retinaGATATGAATG (4)3.50.0035
P2.5 retinaATCAAGGGTG (4)1.80.0018
P2.5 retinaTCACATCCAA (5)1.80.0018
P2.5 retinaTGGTGGTTTG (7)1.80.0018
P4.5 retinaTGGTTGCTGG (369)150.60.1506
P4.5 retinaGATATGAATG (4)40.004
P4.5 retinaTGTGGAAGTG (6)40.004
P4.5 retinaGGGCTGCTCA (7)20.002
P6.5 retinaTGGTTGCTGG (369)156.70.1567
P6.5 retinaTGTGGAAGTG (6)8.30.0083
P6.5 retinaGATATGAATG (4)50.005
P6.5 retinaGGGCTGCTCA (7)50.005
P6.5 retinaTCACATCCAA (5)1.70.0017
P6.5 retinaTCTCATTTTA (3)1.70.0017
P10.5 crx- retinaTGGTTGCTGG (369)280.50.2805
P10.5 crx- retinaTGTGGAAGTG (6)9.30.0093
P10.5 crx- retinaGGGCTGCTCA (7)5.60.0056
P10.5 crx- retinaATCAAGGGTG (4)3.70.0037
P10.5 crx+ retinaTGGTTGCTGG (369)101.90.1019
P10.5 crx+ retinaGGGCTGCTCA (7)5.80.0058
P10.5 crx+ retinaTATTCAGTTG (2)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaTGTGGAAGTG (6)1.90.0019
Adult retinalTGGTTGCTGG (369)214.80.2148
Adult retinalTGTGGAAGTG (6)5.60.0056
Adult retinalATTACGCCAA (233)3.70.0037
Adult retinalCGCGACAGGT (3)3.70.0037
Adult retinalTGGTGGTTTG (7)3.70.0037
Adult retinalCATTTAACTG (3)1.90.0019
Adult retinalGAAAGAGCAA (2)1.90.0019
Adult retinalGGGCTGCTCA (7)1.90.0019
Adult retinalTCTCATTTTA (3)1.90.0019
ONLTGGTTGCTGG (369)398.40.3984
ONLGAAAGAGCAA (2)19.20.0192
ONLGATATGAATG (4)1.90.0019