Mouse Retina SAGE Library

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Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

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UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.41102	2610030H06Rik	RIKEN cDNA 2610030H06 gene	X		67048
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

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SAGE Tags

Total 93 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC GAGGTTAACC (2) TAATTTTCCC (2) TATCCCTGGG (3) TTAAAAAAAA (2) TTAAAAAAAG (2) 29.4 0.0294 Cb medulloblastoma GAGCGTCTTG GAGGTTAACC (2) TAATTTTCCC (2) TTAAAAAAAA (2) TTAAAAAGAA (5) 74 0.074 P8 GC+1d culture AAGACCTCAT (3) GAGCGTCTTG GAGGTTAACC (2) GCACCCATAA TAATTTTCCC (2) TTAAAAAAAA (2) TTAAAAAGAA (5) 53.4 0.0534 P8 GC+SHH+1d culture CTGTGGAACT GAGCGTCTTG GAGGTTAACC (2) GCACCCATAA TAATTTTCCC (2) TTAAAAAAAA (2) TTAAAAAAAG (2) TTAAAAAGAA (5) 55.2 0.0552 3T3 fibroblasts GCACCCATAA 3.5 0.0035 E15 cortex GCACCCATAA TTAAAAAAAA (2) 9.8 0.0098 P1 cortex GAGCGTCTTG GCACCCATAA TAATTTTCCC (2) TTAAAAAAAA (2) 31.7 0.0317 Hypothalamus GAGGTTAACC (2) GCACCCATAA TAATTTTCCC (2) TATCCCTGGG (3) TTAAAAAAAA (2) TTAAAAAAAG (2) 41.6 0.0416 E12.5 retina AAGTTGTTTT CTGTGGAACT GAGGTTAACC (2) GCACCCATAA TTAAAAAAAA (2) 32 0.032 E14.5 retina GAGGTTAACC (2) TTAAAAAAAA (2) 29.2 0.0292 E16.5 retina AAGTTGTTTT GAGGTTAACC (2) TAATTTTCCC (2) TTAAAAAAAA (2) TTAAAAAAAG (2) 28.9 0.0289 E18.5 retina GAGGTTAACC (2) GCACCCATAA TAATTTTCCC (2) TTAAAAAAAA (2) 65.4 0.0654 P0.5 retina GAGCGTCTTG GAGGTTAACC (2) GCACCCATAA TAATTTTCCC (2) TATCCCTGGG (3) TTAAAAAAAA (2) 43.3 0.0433 P2.5 retina AAGTTGTTTT GAGCGTCTTG GAGGTTAACC (2) TAATTTTCCC (2) TTAAAAAAAA (2) TTAAAAAAAG (2) 63.5 0.0635 P4.5 retina GAGGTTAACC (2) GCACCCATAA TAATTTTCCC (2) TTAAAAAAAA (2) TTAAAAAAAG (2) 73.4 0.0734 P6.5 retina CTGTGGAACT GAGGTTAACC (2) TTAAAAAAAA (2) 33.4 0.0334 P10.5 crx- retina AAGACCTCAT (3) AAGTTGTTTT CTGTGGAACT GAGGTTAACC (2) GCACCCATAA TTAAAAAAAA (2) TTAAAAAAAG (2) 37.4 0.0374 P10.5 crx+ retina AAGACCTCAT (3) GAGGTTAACC (2) TAATTTTCCC (2) TTAAAAAAAA (2) 19.2 0.0192 Adult retinal GAGGTTAACC (2) TTAAAAAAAA (2) 9.3 0.0093 ONL AAGACCTCAT (3) GAGGTTAACC (2) GCACCCATAA TAATTTTCCC (2) TTAAAAAAAA (2) TTAAAAAAAG (2) 22.9 0.0229