Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.4215	Cat	catalase	2	2 57.0 cM	12359
Gene Ontology	catalase activity | catalase activity | electron transport | mitochondrion | oxidoreductase activity | oxidoreductase activity, acting on peroxide as acceptor | peroxidase activity | peroxisome | response to oxidative stress
Human Homolog	KIAA1033[KIAA1033 protein]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 212 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAAAAAAAAA (2) AAATGGCTAT AAGAGATGAT ACAGCCAGGG (3) ACCAAGGCAA (2) ATGCAAGTAT GAAAAAAAAA (2) GAAAAAAGAA GAAGGACAAA GGAAAAAAAA (2) TGTGTGAAAA TGTGTGCGTG (3) TGTGTGTATG (3) TGTGTGTGTG (2) 322.8 0.3228 Cb medulloblastoma AAAAAAAAAA (2) AAATGGCTAT ACAGCCAGGG (3) ACCAAGGCAA (2) GAAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) GGGGAAGGGG TGTGTGCGTG (3) TGTGTGTGTG (2) 1072.9 1.0729 P8 GC+1d culture AAAAAAAAAA (2) AAATGGCTAT AAGAGATGAT ACAGCCAGGG (3) ACCAAGGCAA (2) ATGCAAGTAT GAAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) GGGGAAGGGG TGTGTGAAAA TGTGTGCGTG (3) TGTGTGTATG (3) TGTGTGTGTG (2) 302.4 0.3024 P8 GC+SHH+1d culture AAAAAAAAAA (2) AAATGGCTAT AAGAGATGAT ACAGCCAGGG (3) ATGCAAGTAT GAAAAAAAAA (2) GAAGGACAAA GGAAAAAAAA (2) TAGATCATTT TGGATCTGAA TGTGTGCGTG (3) TGTGTGTGTG (2) 419.2 0.4192 3T3 fibroblasts AAAAAAAAAA (2) ACAGCCAGGG (3) GGGGAAGGGG TGTGTGTGTG (2) 66.5 0.0665 E15 cortex AAAAAAAAAA (2) ACAGCCAGGG (3) ACCAAGGCAA (2) GAAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) TGTGTGCGTG (3) 291.8 0.2918 P1 cortex AAAAAAAAAA (2) AAATGGCTAT GAAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) TGTGTGCGTG (3) TGTGTGTGTG (2) 327.2 0.3272 Hypothalamus AAAAAAAAAA (2) AAATGGCTAT AAGAGATGAT ACAGCCAGGG (3) ATGCAAGTAT GAAAAAAAAA (2) GAAGGACAAA GGAAAAAAAA (2) TAGATCATTT TGTGTGAAAA TGTGTGTATG (3) TGTGTGTGTG (2) TTTTCCAAAA 264.4 0.2644 E12.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAATGGCTAT AAGAGATGAT ACAGCCAGGG (3) ATGCAAGTAT GAAAAAAAAA (2) GAAGGACAAA GAGGCTCTGG (5) GGAAAAAAAA (2) TGTGTGCGTG (3) TGTGTGTGTG (2) TGTGTGTTTG TTTTCCAAAA 263.1 0.2631 E14.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAATGGCTAT ACAGCCAGGG (3) ACCAAGGCAA (2) ATGCAAGTAT GAAAAAAAAA (2) GAAAAAAGAA GAGGCTCTGG (5) GGAAAAAAAA (2) TGGATCTGAA TGTGTGTGTG (2) TGTGTGTTTG 238.6 0.2386 E16.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAATGGCTAT AAGAGATGAT ACAGCCAGGG (3) ATGCAAGTAT GAAAAAAAAA (2) GAAGGACAAA GGAAAAAAAA (2) TCTTCCAAAA (2) TGTGTGCGTG (3) TGTGTGTATG (3) TGTGTGTGTG (2) 148.3 0.1483 E18.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAATGGCTAT AAGAGATGAT ACCAAGGCAA (2) ATGCAAGTAT GAAAAAAAAA (2) GAAGGACAAA GGAAAAAAAA (2) TGTGTGTATG (3) TGTGTGTGTG (2) TGTGTGTTTG TTTTCCAAAA 543.8 0.5438 P0.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAATGGCTAT AAGAGATGAT ACAGCCAGGG (3) ACCAAGGCAA (2) ATGCAAGTAT GAAAAAAAAA (2) GAAGGACAAA GGAAAAAAAA (2) TGTGTGCGTG (3) TGTGTGTGTG (2) 223.7 0.2237 P2.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAATGGCTAT AAGAGATGAT ACAGCCAGGG (3) ACCAAGGCAA (2) ATGCAAGTAT GAAAAAAAAA (2) GAGGCTCTGG (5) GGAAAAAAAA (2) GGGGAAGGGG TCTTTCAAAA (5) TGTGTGTGTG (2) TTTTCCAAAA 487.6 0.4876 P4.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAATGGCTAT AAGAGATGAT ACAGCCAGGG (3) ATGCAAGTAT GAAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) GGGGAAGGGG TCTTTCAAAA (5) TGTGTGAAAA TGTGTGTGTG (2) 424.2 0.4242 P6.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAATGGCTAT ACAGCCAGGG (3) ACCAAGGCAA (2) ATGCAAGTAT GAAAAAAAAA (2) GAGGCTCTGG (5) GGAAAAAAAA (2) TCTTTCAAAA (5) TGTGTGCGTG (3) TGTGTGTGTG (2) 391.9 0.3919 P10.5 crx- retina AAAAAAAAAA (2) AAATGGCTAT ACAGCCAGGG (3) ATGCAAGTAT GAAAAAAAAA (2) GGAAAAAAAA (2) TGTGTGCGTG (3) TGTGTGTGTG (2) 146.8 0.1468 P10.5 crx+ retina AAAAAAAAAA (2) AAATGGCTAT ACAGCCAGGG (3) ACCAAGGCAA (2) GAAAAAAAAA (2) GAAAAAAGAA GAAGGACAAA GGAAAAAAAA (2) TCTTTCAAAA (5) TGTGTGTGTG (2) TGTGTGTTTG 226.6 0.2266 Adult retinal AAAAAAAAAA (2) AAATGGCTAT ACAGCCAGGG (3) ACCAAGGCAA (2) ATGCAAGTAT GAAAAAAAAA (2) GAGGCTCTGG (5) GGAAAAAAAA (2) TCTTTCAAAA (5) TGTGTGCGTG (3) TGTGTGTGTG (2) TGTGTGTTTG 165.2 0.1652 ONL AAAAAAAAAA (2) ACAGCCAGGG (3) ACCAAGGCAA (2) GAAAAAAAAA (2) GAAAAAAGAA GGAAAAAAAA (2) GGGGAAGGGG TGTGTGTATG (3) TGTGTGTGTG (2) 197.2 0.1972