Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.4714 Yaf2YY1 associated factor 2 15    67057 
 Mm.4714 D030074K08RikRIKEN cDNA D030074K08 gene 15    320531 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 60 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAATGTGGT (6)4.90.0049
P8 Cb GCTAACTATTAC (2)4.90.0049
P8 Cb GCGTAATGTCAC (3)3.30.0033
P8 Cb GCGTCAGACTCT (3)1.60.0016
P8 Cb GCTAATGAGTTT (3)1.60.0016
Cb medulloblastomaTCTGTGACCC (6)4.60.0046
Cb medulloblastomaGTAATGTCAC (3)2.30.0023
Cb medulloblastomaTGACTCTAGT (4)2.30.0023
Cb medulloblastomaTGTTTTACTA (4)2.30.0023
P8 GC+1d cultureAAAATGTGGT (6)1.10.0011
P8 GC+1d cultureATGTCTTTAA (8)1.10.0011
P8 GC+1d cultureGAGATGCAGA (4)1.10.0011
P8 GC+1d cultureTAACTATTAC (2)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureGAGATGCAGA (4)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureAAAATGTGGT (6)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureTAACTATTAC (2)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureGTCAGACTCT (3)1.20.0012
3T3 fibroblastsGAGATGCAGA (4)70.007
P1 cortexTGTTTTACTA (4)4.50.0045
HypothalamusTAATGAGTTT (3)7.20.0072
HypothalamusGTAATGTCAC (3)3.60.0036
HypothalamusAAAATGTGGT (6)1.80.0018
HypothalamusGAGATGCAGA (4)1.80.0018
HypothalamusTAACTATTAC (2)1.80.0018
HypothalamusTCTGTGACCC (6)1.80.0018
HypothalamusTGACTCTAGT (4)1.80.0018
E12.5 retinaAAAATGTGGT (6)1.90.0019
E12.5 retinaATGTCTTTAA (8)1.90.0019
E12.5 retinaGAGATGCAGA (4)1.90.0019
E12.5 retinaTGACTCTAGT (4)1.90.0019
E14.5 retinaTAATGAGTTT (3)3.60.0036
E14.5 retinaAAAATGTGGT (6)1.80.0018
E14.5 retinaATGTCTTTAA (8)1.80.0018
E14.5 retinaTCTGTGACCC (6)1.80.0018
E16.5 retinaAAAATGTGGT (6)1.80.0018
E16.5 retinaGAGATGCAGA (4)1.80.0018
E16.5 retinaTAACTATTAC (2)1.80.0018
E18.5 retinaTAATGAGTTT (3)3.60.0036
E18.5 retinaTAACTATTAC (2)1.80.0018
P0.5 retinaGTAATGTCAC (3)20.002
P0.5 retinaTGTTTTACTA (4)20.002
P2.5 retinaTGACTCTAGT (4)3.50.0035
P2.5 retinaTAACTATTAC (2)1.80.0018
P2.5 retinaTAATGAGTTT (3)1.80.0018
P4.5 retinaGTAATGTCAC (3)40.004
P4.5 retinaAAAATGTGGT (6)20.002
P4.5 retinaGAGATGCAGA (4)20.002
P4.5 retinaTAACTATTAC (2)20.002
P4.5 retinaTAATGAGTTT (3)20.002
P6.5 retinaAAAATGTGGT (6)1.70.0017
P10.5 crx- retinaTAACTATTAC (2)9.30.0093
P10.5 crx- retinaTAATGAGTTT (3)9.30.0093
P10.5 crx- retinaAAAATGTGGT (6)3.70.0037
P10.5 crx- retinaGAGATGCAGA (4)1.90.0019
P10.5 crx- retinaGTCAGACTCT (3)1.90.0019
P10.5 crx- retinaTCTGTGACCC (6)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGTAATGTCAC (3)1.90.0019
Adult retinalTAACTATTAC (2)3.70.0037
Adult retinalATGTCTTTAA (8)1.90.0019
ONLTCTGTGACCC (6)1.90.0019