Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.4871 Timp3tissue inhibitor of metalloproteinase 3 10  10 C1-D1 (10 47.0 cM)  21859 
 Mm.4871 B930095M22RikRIKEN cDNA B930095M22 gene 10    320124 
 Clusters 
   Neighbors    

Total 6 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 35 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATTGGTTACT (2)
CACACACAGG (5)
CCATTTTTTT (3)
TGTAGGCTGT (2)
TTATTTATGA (2)
19.50.0195
Cb medulloblastomaCACACACAGG (5)
GGAATAAAAG (3)
TGTAGGCTGT (2)
6.90.0069
P8 GC+1d cultureTGTAGGCTGT (2)
TTATTTATGA (2)
TTGTGCTTCT (2)
13.70.0137
P8 GC+SHH+1d cultureATTGGTTACT (2)
CACACACAGG (5)
TGTAGGCTGT (2)
TTATTTATGA (2)
TTGTGCTTCT (2)
9.30.0093
3T3 fibroblastsTGTAGGCTGT (2)
TTGTGCTTCT (2)
10.50.0105
HypothalamusGGAATAAAAG (3)
TGTAGGCTGT (2)
TTATTTATGA (2)
90.009
E12.5 retinaTTATTTATGA (2)
1.90.0019
E14.5 retinaCACACACAGG (5)
1.80.0018
E16.5 retinaCACACACAGG (5)
1.80.0018
E18.5 retinaCACACACAGG (5)
CCATTTTTTT (3)
3.60.0036
P0.5 retinaGGAATAAAAG (3)
TTATTTATGA (2)
5.90.0059
P4.5 retinaCCATTTTTTT (3)
TGTAGGCTGT (2)
40.004
P10.5 crx- retinaTGTAGGCTGT (2)
1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTGTAGGCTGT (2)
1.90.0019
Adult retinalCCATTTTTTT (3)
TGTAGGCTGT (2)
TTATTTATGA (2)
5.70.0057