Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.4876 Rcn1reticulocalbin 1 2  2 58.0 cM  19672 
 Gene Ontology calcium ion binding | endoplasmic reticulum | extracellular space
 Human Homolog RCN1[reticulocalbin 1, EF-hand calcium binding domain]
 Clusters 
   Neighbors    

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SAGE Tags

Total 54 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAGATCCAGCT (2)
CCTGCTCCAA
TTAATGAGGT (2)
TTTGTTGTGA
8.10.0081
P8 GC+1d cultureAGATCCAGCT (2)
GTATTTCAAA
TTAATGAGGT (2)
TTTGTTGTGA
13.70.0137
P8 GC+SHH+1d cultureAAAGGGCTCT
AGATCCAGCT (2)
GTATTTCAAA
TTAATGAGGT (2)
8.30.0083
3T3 fibroblastsAAAGGGCTCT
AGATCCAGCT (2)
TTAATGAGGT (2)
140.014
E15 cortexAGATCCAGCT (2)
CCTGCTCCAA
19.70.0197
HypothalamusAGATCCAGCT (2)
GGTGCAGGGG (2)
TTAATGAGGT (2)
TTTGTTGTGA
90.009
E12.5 retinaAAAGGGCTCT
GTATTTCAAA
TTAATGAGGT (2)
TTTGTTGTGA
16.90.0169
E14.5 retinaAGATCCAGCT (2)
GGTGCAGGGG (2)
GTATTTCAAA
5.40.0054
E16.5 retinaAGATCCAGCT (2)
CCTGCTCCAA
TTAATGAGGT (2)
TTTGTTGTGA
90.009
E18.5 retinaGTATTTCAAA
GTCATACAGT
3.60.0036
P0.5 retinaAGATCCAGCT (2)
GTCATACAGT
TTAATGAGGT (2)
9.80.0098
P2.5 retinaAGATCCAGCT (2)
CCTGCTCCAA
GTATTTCAAA
TTAATGAGGT (2)
7.20.0072
P4.5 retinaAGATCCAGCT (2)
TTAATGAGGT (2)
40.004
P6.5 retinaAGATCCAGCT (2)
GGTGCAGGGG (2)
GTATTTCAAA
TTAATGAGGT (2)
TTTGTTGTGA
11.80.0118
P10.5 crx- retinaAGATCCAGCT (2)
5.60.0056
P10.5 crx+ retinaAGATCCAGCT (2)
GTATTTCAAA
3.80.0038
Adult retinalAGATCCAGCT (2)
GTATTTCAAA
130.013
ONLAGATCCAGCT (2)
1.90.0019