Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.59812 1200009B18RikRIKEN cDNA 1200009B18 gene 6    67456 
 Mm.59812 4732416N19RikRIKEN cDNA 4732416N19 gene 6    320737 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 119 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAGAGCAACC (2)
ATGTGAATAA (3)
GAATTGGACA
GTTAATAAAG (2)
GTTTTAAAAA (3)
TCTACTTACT (2)
TTGTGCAATA (2)
27.60.0276
Cb medulloblastomaATGTGAATAA (3)
GAATTGGACA
GTCATCTTTA
GTTAATAAAG (2)
GTTTTAAAAA (3)
25.30.0253
P8 GC+1d cultureAAGAGCAACA (2)
ATGTGAATAA (3)
ATTTCTTTAC (2)
GTCATCTTTA
GTTAATAAAG (2)
GTTTTAAAAA (3)
TCAGGCTGTT (2)
TCTACTTACT (2)
TGAGACTAAG (2)
22.60.0226
P8 GC+SHH+1d cultureATGTGAATAA (3)
ATTTCTTTAC (2)
GAAACTCTAG (3)
GTCATCTTTA
GTTTTAAAAA (3)
TCTACTTACT (2)
TTGTGCAATA (2)
35.20.0352
E15 cortexGAATTGGACA
GTTTTAAAAA (3)
9.80.0098
P1 cortexGAAACTCTAG (3)
GTCATCTTTA
90.009
HypothalamusAAGAGCAACA (2)
ATGTGAATAA (3)
GAAACTCTAG (3)
GGCATCTTTA (2)
GTCATCTTTA
TCAGGCTGTT (2)
TCTACTTACT (2)
TGAGACTAAG (2)
23.50.0235
E12.5 retinaAAGAGCAACC (2)
ATGTGAATAA (3)
GAAACTCTAG (3)
GTCATCTTTA
GTTTTAAAAA (3)
TCAGGCTGTT (2)
30.10.0301
E14.5 retinaAAGAGCAACC (2)
ATGTGAATAA (3)
GAAACTCTAG (3)
GTCATCTTTA
GTTAATAAAG (2)
GTTTTAAAAA (3)
TCAGGCTGTT (2)
400.04
E16.5 retinaAAGAGCAACC (2)
ATGTGAATAA (3)
GAAACTCTAG (3)
GTCATCTTTA
GTTTTAAAAA (3)
45.10.0451
E18.5 retinaAAGAGCAACC (2)
ATGTGAATAA (3)
GAATTGGACA
GTCATCTTTA
GTTAATAAAG (2)
GTTTTAAAAA (3)
TTGTGCAATA (2)
70.90.0709
P0.5 retinaAAGAGCAACC (2)
ATGTGAATAA (3)
GAAACTCTAG (3)
GTTAATAAAG (2)
19.80.0198
P2.5 retinaATGTGAATAA (3)
CACTCTGGTG (2)
GAAACTCTAG (3)
GAATTGGACA
GGCATCTTTA (2)
GTCATCTTTA
GTTAATAAAG (2)
GTTTTAAAAA (3)
TCTACTTACT (2)
TTGTGCAATA (2)
33.60.0336
P4.5 retinaAAGAGCAACC (2)
ATGTGAATAA (3)
GAAACTCTAG (3)
GTCATCTTTA
GTTAATAAAG (2)
GTTTTAAAAA (3)
TCAGGCTGTT (2)
TCTACTTACT (2)
TTGTGCAATA (2)
55.70.0557
P6.5 retinaAAGAGCAACA (2)
ATGTGAATAA (3)
CACTCTGGTG (2)
GAAACTCTAG (3)
GAATTGGACA
GGCATCTTTA (2)
GTCATCTTTA
GTTTTAAAAA (3)
TGAGACTAAG (2)
35.20.0352
P10.5 crx- retinaAAGAGCAACC (2)
ATGTGAATAA (3)
GAAACTCTAG (3)
GTCATCTTTA
29.70.0297
P10.5 crx+ retinaAAGAGCAACA (2)
AAGAGCAACC (2)
ATGTGAATAA (3)
GAAACTCTAG (3)
GTCATCTTTA
TTGTGCAATA (2)
26.90.0269
Adult retinalATGTGAATAA (3)
GAATTGGACA
GGCATCTTTA (2)
GTCATCTTTA
TCTACTTACT (2)
TTGTGCAATA (2)
11.40.0114
ONLATGTGAATAA (3)
ATTTCTTTAC (2)
GAAACTCTAG (3)
GTTTTAAAAA (3)
TCTACTTACT (2)
TTGTGCAATA (2)
26.70.0267