Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.73276 5830401L18RikRIKEN cDNA 5830401L18 gene 2    319222 
 Mm.73276 Stau1staufen (RNA binding protein) homolog 1 (Drosophila) 2    20853 
 Gene Ontology double-stranded RNA binding | intracellular | mRNA localization, intracellular | protein binding | ribonucleoprotein complex | RNA binding
 Human Homolog STAU[staufen, RNA binding protein (Drosophila)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 107 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAACCCCCTC (2)
ACTGACTCAG (2)
CCGCTGATCC
CTGGCTTCTT (2)
9.80.0098
Cb medulloblastomaAAACCCCCTC (2)
GAATATAAGT (2)
6.90.0069
P8 GC+1d cultureAAACCCCCTC (2)
CAGAACATTA (2)
CCGCTGATCC
CTATGGTGTG (2)
CTGGCTTCTT (2)
GAATATAAGT (2)
TAACTGGCAA (3)
TCTCCCTGCC
400.04
P8 GC+SHH+1d cultureAAAATTGGCT (5)
AAACCCCCTC (2)
AGTGGGAAGG (2)
CAGAACATTA (2)
CCGCTGATCC
CTATGGTGTG (2)
CTGGCTTCTT (2)
GAAAATGGTG
GAATATAAGT (2)
TCTCCCTGCC
41.20.0412
3T3 fibroblastsCCGCTGATCC
CTATGGTGTG (2)
CTGGCTTCTT (2)
TCTCCCTGCC
490.049
E15 cortexGAATATAAGT (2)
4.90.0049
P1 cortexAAACCCCCTC (2)
CCGCTGATCC
CTGGCTTCTT (2)
45.40.0454
HypothalamusGAATATAAGT (2)
3.60.0036
E12.5 retinaAAAATTGGCT (5)
AAACCCCCTC (2)
ACTGACTCAG (2)
CTGGCTTCTT (2)
CTGGGCTTCT (2)
GAATATAAGT (2)
28.30.0283
E14.5 retinaAAACCCCCTC (2)
ACTGACTCAG (2)
AGTGGGAAGG (2)
CAGAACATTA (2)
CTGGCTTCTT (2)
GAAAATGGTG
GAATATAAGT (2)
200.02
E16.5 retinaAAAATTGGCT (5)
AAACCCCCTC (2)
ACTGACTCAG (2)
GAATATAAGT (2)
TCTCCCTGCC
23.50.0235
E18.5 retinaAAAATTGGCT (5)
AAACCCCCTC (2)
AGTGGGAAGG (2)
CAGAACATTA (2)
CTGGCTTCTT (2)
CTGGGCTTCT (2)
GAAAATGGTG
GAATATAAGT (2)
25.40.0254
P0.5 retinaAAACCCCCTC (2)
ACTGACTCAG (2)
CAGAACATTA (2)
CCGCTGATCC
CTATGGTGTG (2)
CTGGCTTCTT (2)
GAAAATGGTG
GAATATAAGT (2)
TCTCCCTGCC
39.30.0393
P2.5 retinaAAAATTGGCT (5)
AAACCCCCTC (2)
ACTGACTCAG (2)
AGTGGGAAGG (2)
CAGAACATTA (2)
CTGGCTTCTT (2)
GAATATAAGT (2)
TCTCCCTGCC
42.30.0423
P4.5 retinaAAACCCCCTC (2)
AGTGGGAAGG (2)
CTATGGTGTG (2)
CTGGCTTCTT (2)
GAATATAAGT (2)
TAACTGGCAA (3)
TCTCCCTGCC
31.80.0318
P6.5 retinaAAACCCCCTC (2)
AGTGGGAAGG (2)
CAGAACATTA (2)
CCGCTGATCC
CTGGCTTCTT (2)
GAATATAAGT (2)
19.90.0199
P10.5 crx- retinaAAACCCCCTC (2)
ACTGACTCAG (2)
CCGCTGATCC
CTGGGCTTCT (2)
GAATATAAGT (2)
TCTCCCTGCC
18.80.0188
P10.5 crx+ retinaAAACCCCCTC (2)
GAATATAAGT (2)
TCTCCCTGCC
11.50.0115
Adult retinalAAACCCCCTC (2)
CCGCTGATCC
CTGGCTTCTT (2)
GAATATAAGT (2)
TCTCCCTGCC
24.20.0242
ONLAAAATTGGCT (5)
AAACCCCCTC (2)
CCGCTGATCC
GAATATAAGT (2)
15.20.0152