Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.87611 Cul1cullin 1 6  6 B3  26965 
 Mm.87611 AW743318expressed sequence AW743318 6    101402 
 Mm.87611 A930035D04RikRIKEN cDNA A930035D04 gene 6    320946 
 Mm.87611 9430013L14RikRIKEN cDNA 9430013L14 gene 6    77241 
 Clusters 
   Neighbors    

Total 10 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 47 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCTACCGCACT (4)6.50.0065
Cb medulloblastomaCTACCGCACT (4)2.30.0023
Cb medulloblastomaGCCTCTGCTT (5)2.30.0023
P8 GC+1d cultureCTACCGCACT (4)6.80.0068
P8 GC+1d cultureGACTGAAGCA (4)1.10.0011
P8 GC+1d cultureGAGAGATGTT (4)1.10.0011
P8 GC+1d cultureGCCTCTGCTT (5)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureCTACCGCACT (4)10.50.0105
P8 GC+SHH+1d cultureGACTGAAGCA (4)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureGAAGGTTCGG (4)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureGCCTCTGCTT (5)1.20.0012
3T3 fibroblastsCTACCGCACT (4)17.50.0175
E15 cortexCTACCGCACT (4)14.80.0148
P1 cortexGACTGAAGCA (4)4.50.0045
P1 cortexGAGAGATGTT (4)4.50.0045
P1 cortexGCCTCTGCTT (5)4.50.0045
HypothalamusCTACCGCACT (4)1.80.0018
HypothalamusGAAGGTTCGG (4)1.80.0018
E12.5 retinaCTACCGCACT (4)7.50.0075
E14.5 retinaCTACCGCACT (4)10.90.0109
E14.5 retinaGCCTCTGCTT (5)5.50.0055
E14.5 retinaGAGAGATGTT (4)1.80.0018
E16.5 retinaGCCTCTGCTT (5)3.60.0036
E16.5 retinaCTACCGCACT (4)1.80.0018
E18.5 retinaCTACCGCACT (4)3.60.0036
E18.5 retinaTATTCATAGA (4)1.80.0018
P0.5 retinaCTACCGCACT (4)21.60.0216
P2.5 retinaCTACCGCACT (4)5.30.0053
P2.5 retinaGCCTCTGCTT (5)1.80.0018
P4.5 retinaCATTTGTACA (4)20.002
P4.5 retinaCTACCGCACT (4)20.002
P4.5 retinaGAAGGTTCGG (4)20.002
P6.5 retinaCTACCGCACT (4)8.30.0083
P6.5 retinaCATTTGTACA (4)3.30.0033
P6.5 retinaGCCTCTGCTT (5)1.70.0017
P10.5 crx- retinaCTACCGCACT (4)20.40.0204
P10.5 crx- retinaGCCTCTGCTT (5)9.30.0093
P10.5 crx- retinaTATTCATAGA (4)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGCCTCTGCTT (5)13.50.0135
P10.5 crx+ retinaCTACCGCACT (4)5.80.0058
P10.5 crx+ retinaGAAGGTTCGG (4)1.90.0019
Adult retinalCTACCGCACT (4)11.10.0111
Adult retinalGCCTCTGCTT (5)5.60.0056
Adult retinalGAGAGATGTT (4)1.90.0019
ONLCTACCGCACT (4)5.70.0057
ONLGCCTCTGCTT (5)5.70.0057
ONLTATTCATAGA (4)1.90.0019