Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.87773 Tra1tumor rejection antigen gp96 10  10 49.0 cM  22027 
 Mm.87773 Targ2transforming growth factor alpha regulated gene 2     21361 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 68 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCTGTATAAAAA (3)27.70.0277
P8 Cb GCAATTCTCTGT (4)8.20.0082
P8 Cb GCACAAGATTTT (2)8.20.0082
P8 Cb GCGATCTTGCTG (3)3.30.0033
P8 Cb GCGCTGGGTCAA (2)3.30.0033
P8 Cb GCTCACAGACAC (2)3.30.0033
P8 Cb GCAGGGTCCTGT (2)1.60.0016
P8 Cb GCGGTATAAAAA (2)1.60.0016
Cb medulloblastomaTGTATAAAAA (3)50.90.0509
Cb medulloblastomaACAAGATTTT (2)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTGTATAAAAA (3)45.70.0457
P8 GC+1d cultureACAAGATTTT (2)2.30.0023
P8 GC+1d cultureAATTCTCTGT (4)1.10.0011
P8 GC+1d cultureGATCTTGCTG (3)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureTGTATAAAAA (3)72.60.0726
P8 GC+SHH+1d cultureACAAGATTTT (2)70.007
P8 GC+SHH+1d cultureAATTCTCTGT (4)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureGATCTTGCTG (3)1.20.0012
3T3 fibroblastsTCACAGACAC (2)49.10.0491
3T3 fibroblastsAGGGTCCTGT (2)70.007
E15 cortexAATTCTCTGT (4)9.90.0099
E15 cortexTGTATAAAAA (3)9.90.0099
E15 cortexTCACAGACAC (2)4.90.0049
P1 cortexTGTATAAAAA (3)145.40.1454
P1 cortexACAAGATTTT (2)22.70.0227
P1 cortexAATTCTCTGT (4)9.10.0091
HypothalamusTGTATAAAAA (3)77.90.0779
HypothalamusACAAGATTTT (2)1.80.0018
HypothalamusGATCTTGCTG (3)1.80.0018
E12.5 retinaTGTATAAAAA (3)26.30.0263
E12.5 retinaAATTCTCTGT (4)1.90.0019
E12.5 retinaACAAGATTTT (2)1.90.0019
E12.5 retinaTCACAGACAC (2)1.90.0019
E14.5 retinaTGTATAAAAA (3)510.051
E14.5 retinaACAAGATTTT (2)5.50.0055
E14.5 retinaTCACAGACAC (2)1.80.0018
E16.5 retinaTGTATAAAAA (3)56.10.0561
E16.5 retinaGCTGGGTCAA (2)3.60.0036
E16.5 retinaACAAGATTTT (2)1.80.0018
E18.5 retinaTGTATAAAAA (3)1110.111
E18.5 retinaACAAGATTTT (2)5.50.0055
E18.5 retinaAGGGTCTGTG (2)3.60.0036
P0.5 retinaTGTATAAAAA (3)25.50.0255
P0.5 retinaACAAGATTTT (2)13.70.0137
P0.5 retinaGATCTTGCTG (3)20.002
P2.5 retinaTGTATAAAAA (3)42.20.0422
P2.5 retinaTCACAGACAC (2)1.80.0018
P4.5 retinaTGTATAAAAA (3)69.30.0693
P4.5 retinaACAAGATTTT (2)40.004
P6.5 retinaTGTATAAAAA (3)76.70.0767
P6.5 retinaAATTCTCTGT (4)1.70.0017
P6.5 retinaGATCTTGCTG (3)1.70.0017
P6.5 retinaGGTATAAAAA (2)1.70.0017
P6.5 retinaTCACAGACAC (2)1.70.0017
P10.5 crx- retinaTGTATAAAAA (3)31.60.0316
P10.5 crx- retinaGATCTTGCTG (3)7.40.0074
P10.5 crx- retinaAGGGTCTGTG (2)1.90.0019
P10.5 crx- retinaTCACAGACAC (2)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTGTATAAAAA (3)53.80.0538
P10.5 crx+ retinaACAAGATTTT (2)5.80.0058
P10.5 crx+ retinaGATCTTGCTG (3)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGCTGGGTCAA (2)1.90.0019
Adult retinalTGTATAAAAA (3)20.40.0204
Adult retinalACAAGATTTT (2)1.90.0019
Adult retinalGGTATAAAAA (2)1.90.0019
ONLTGTATAAAAA (3)26.80.0268
ONLACAAGATTTT (2)3.80.0038
ONLTCACAGACAC (2)1.90.0019