Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.28052 Ubp1upstream binding protein 1 9    22221 
 Gene Ontology angiogenesis
 Human Homolog UBP1[upstream binding protein 1 (LBP-1a)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 51 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATTTATGGAA (2)
GAGGTGAAAA (2)
GCACCAGCAG (2)
6.50.0065
Cb medulloblastomaATTTATGGAA (2)
GCACCAGCAG (2)
6.90.0069
P8 GC+1d cultureAGATCCAGAA (2)
ATTTATGGAA (2)
GCACCAGCAG (2)
TGGTCACACA (2)
7.90.0079
P8 GC+SHH+1d cultureATTTATGGAA (2)
GCACCAGCAG (2)
8.20.0082
3T3 fibroblastsGCACCAGCAG (2)
10.50.0105
E15 cortexGCACCAGCAG (2)
4.90.0049
P1 cortexGAGGTGAAAA (2)
4.50.0045
HypothalamusATTTATGGAA (2)
GAGGTGAAAA (2)
GCACCAGCAG (2)
16.30.0163
E12.5 retinaATTTATGGAA (2)
GCACCAGCAG (2)
150.015
E14.5 retinaATTTATGGAA (2)
CTTAAAAGTG (3)
GCACCAGCAG (2)
14.60.0146
E16.5 retinaATTTATGGAA (2)
GCACCAGCAG (2)
TGGTCACACA (2)
21.70.0217
E18.5 retinaATTTATGGAA (2)
CTTAAAAGTG (3)
GCACCAGCAG (2)
21.80.0218
P0.5 retinaATTTATGGAA (2)
GAGGTGAAAA (2)
GCACCAGCAG (2)
7.90.0079
P2.5 retinaATTTATGGAA (2)
GAGGTGAAAA (2)
GCACCAGCAG (2)
35.20.0352
P4.5 retinaATTTATGGAA (2)
CTTAAAAGTG (3)
GCACCAGCAG (2)
27.70.0277
P6.5 retinaAGATCCAGAA (2)
ATTTATGGAA (2)
GAGGTGAAAA (2)
GCACCAGCAG (2)
250.025
P10.5 crx- retinaATTTATGGAA (2)
GCACCAGCAG (2)
24.20.0242
P10.5 crx+ retinaATTTATGGAA (2)
CTTAAAAGTG (3)
GCACCAGCAG (2)
250.025
Adult retinalATTTATGGAA (2)
GCACCAGCAG (2)
9.30.0093
ONLAGATCCAGAA (2)
ATTTATGGAA (2)
GCACCAGCAG (2)
15.30.0153