Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.275332 Apg7lautophagy 7-like (S. cerevisiae) 6    74244 
 Gene Ontology autophagy | protein binding | ubiquitin activating enzyme activity
 Human Homolog APG7L[APG7 autophagy 7-like (S. cerevisiae)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 92 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCTCTCAAAAAA (22)4.90.0049
P8 Cb GCTGTCTGCCTG (3)3.30.0033
P8 Cb GCCTGTCTGTGT (3)1.60.0016
P8 Cb GCGAGTAACTGT1.60.0016
P8 Cb GCGTTTGCCTGA (9)1.60.0016
P8 Cb GCTCCTCAAAAA (3)1.60.0016
Cb medulloblastomaTCTCAAAAAA (22)9.20.0092
Cb medulloblastomaTCCTCAAAAA (3)4.60.0046
Cb medulloblastomaGAGTAACTGT2.30.0023
Cb medulloblastomaTGTCTGCCTG (3)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTCTCAAAAAA (22)3.40.0034
P8 GC+1d cultureGTTTGCCTGA (9)2.30.0023
P8 GC+1d cultureCCACCCTAGG (3)1.10.0011
P8 GC+1d cultureGAGATGGGGT (4)1.10.0011
P8 GC+1d cultureGAGTAACTGT1.10.0011
P8 GC+1d cultureGCTTGTGACT (2)1.10.0011
P8 GC+1d cultureTGTGCCTGCA (2)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureTCTCAAAAAA (22)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureGAGATGGGGT (4)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureGAGTAACTGT2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureACAACACTGC (4)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureAGTGACGAGG1.20.0012
3T3 fibroblastsGTTTGCCTGA (9)10.50.0105
3T3 fibroblastsGAGATGGGGT (4)3.50.0035
3T3 fibroblastsTGTCTGCCTG (3)3.50.0035
E15 cortexGTTTGCCTGA (9)9.90.0099
E15 cortexACAACACTGC (4)4.90.0049
E15 cortexCTGTCTGTGT (3)4.90.0049
E15 cortexTCTCAAAAGA (5)4.90.0049
E15 cortexTGTGCCTGCA (2)4.90.0049
P1 cortexGTTTGCCTGA (9)4.50.0045
P1 cortexTCTCAAAAGA (5)4.50.0045
P1 cortexTGTGCCTGCA (2)4.50.0045
HypothalamusTCTCAAAAAA (22)5.40.0054
HypothalamusCCACCCTAGG (3)1.80.0018
HypothalamusGGGGCCAGAT1.80.0018
E12.5 retinaCCACCCTAGG (3)1.90.0019
E14.5 retinaGTTTGCCTGA (9)3.60.0036
E14.5 retinaTCTCAAAAAA (22)3.60.0036
E14.5 retinaCTGTCTGTGT (3)1.80.0018
E14.5 retinaGAGTAACTGT1.80.0018
E16.5 retinaTCTCAAAAAA (22)3.60.0036
E16.5 retinaAGTGACGAGG1.80.0018
E16.5 retinaCCACCCTAGG (3)1.80.0018
E16.5 retinaGAGATGGGGT (4)1.80.0018
E16.5 retinaTGTCTGCCTG (3)1.80.0018
E16.5 retinaTGTGCCTGCA (2)1.80.0018
E18.5 retinaTCTCAAAAAA (22)5.50.0055
E18.5 retinaCTGTCTGTGT (3)1.80.0018
E18.5 retinaGAGTAACTGT1.80.0018
E18.5 retinaGTTTGCCTGA (9)1.80.0018
E18.5 retinaTCCTCAAAAA (3)1.80.0018
E18.5 retinaTCTCAAACAA (4)1.80.0018
E18.5 retinaTGTCTGCCTG (3)1.80.0018
E18.5 retinaTGTGCCTGCA (2)1.80.0018
P0.5 retinaGGGGCCAGAT20.002
P0.5 retinaGTTTGCCTGA (9)20.002
P0.5 retinaTGTGCCTGCA (2)20.002
P2.5 retinaGAGTAACTGT1.80.0018
P2.5 retinaGCTTGTGACT (2)1.80.0018
P2.5 retinaGGGGCCAGAT1.80.0018
P2.5 retinaGTTTGCCTGA (9)1.80.0018
P2.5 retinaTCCTCAAAAA (3)1.80.0018
P2.5 retinaTCTCAAAAAA (22)1.80.0018
P2.5 retinaTCTCAAAAGA (5)1.80.0018
P4.5 retinaAGTGACGAGG20.002
P4.5 retinaGTTTGCCTGA (9)20.002
P4.5 retinaTCCTCAAAAA (3)20.002
P4.5 retinaTCTCAAAAAA (22)20.002
P4.5 retinaTGTCTGCCTG (3)20.002
P4.5 retinaTGTGCCTGCA (2)20.002
P6.5 retinaTCTCAAAAAA (22)3.30.0033
P6.5 retinaACAACACTGC (4)1.70.0017
P6.5 retinaGAGTAACTGT1.70.0017
P6.5 retinaGCTTGTGACT (2)1.70.0017
P6.5 retinaTCCCAGCATC (2)1.70.0017
P6.5 retinaTCTCAAAAGA (5)1.70.0017
P6.5 retinaTCTCAAACAA (4)1.70.0017
P10.5 crx- retinaGAGTAACTGT1.90.0019
P10.5 crx- retinaGTTTGCCTGA (9)1.90.0019
P10.5 crx- retinaTCTCAAACAA (4)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCCACCCTAGG (3)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaGTTTGCCTGA (9)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaTCTCAAAAAA (22)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaTGTGCCTGCA (2)1.90.0019
Adult retinalTCCCAGCATC (2)44.40.0444
Adult retinalTCTCAAAAAA (22)7.40.0074
Adult retinalAGTGACGAGG1.90.0019
Adult retinalTCTCAAAAGA (5)1.90.0019
ONLTCCCAGCATC (2)26.80.0268
ONLTCTCAAAAAA (22)7.70.0077
ONLGAGATGGGGT (4)3.80.0038