Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.104368	Rpl32	ribosomal protein L32	6	6 50.5 cM	19951
Gene Ontology	cytosolic large ribosomal subunit (sensu Eukarya) | cytosolic large ribosomal subunit (sensu Eukarya) | intracellular | protein biosynthesis | protein biosynthesis | ribosome | RNA binding | structural constituent of ribosome | structural constituent of ribosome
Human Homolog	RPL32[ribosomal protein L32]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 87 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC TTTTATGTTT (2) 179.4 0.1794 P8 Cb GC CTGCCCAGCG 3.3 0.0033 P8 Cb GC CTTTATGTTT 1.6 0.0016 P8 Cb GC TTTAATGTTT (2) 1.6 0.0016 P8 Cb GC TTTTATGTCT (2) 1.6 0.0016 Cb medulloblastoma TTTTATGTTT (2) 30.1 0.0301 Cb medulloblastoma CACACAAGCC 2.3 0.0023 Cb medulloblastoma CTTTATGTTT 2.3 0.0023 P8 GC+1d culture TTTTATGTTT (2) 161 0.161 P8 GC+1d culture CACACAAGCC 4.6 0.0046 P8 GC+1d culture CTGCCCAGCG 1.1 0.0011 P8 GC+1d culture TTTTATGGTT 1.1 0.0011 P8 GC+SHH+1d culture TTTTATGTTT (2) 149.9 0.1499 P8 GC+SHH+1d culture CACACAAGCC 2.3 0.0023 P8 GC+SHH+1d culture CTGCCCAGCG 2.3 0.0023 P8 GC+SHH+1d culture TTTAAGGTTT 1.2 0.0012 P8 GC+SHH+1d culture TTTTATGGTT 1.2 0.0012 3T3 fibroblasts TTTTATGTTT (2) 45.6 0.0456 3T3 fibroblasts TGCTTGGTTT (2) 3.5 0.0035 E15 cortex CTGCCCAGCG 24.7 0.0247 E15 cortex CACACAAGCC 4.9 0.0049 E15 cortex TTTTATGTTT (2) 4.9 0.0049 P1 cortex TTTTATGTTT (2) 95.5 0.0955 P1 cortex TTTTATGGTT 4.5 0.0045 P1 cortex TTTTATGTCT (2) 4.5 0.0045 Hypothalamus TTTTATGTTT (2) 65.2 0.0652 Hypothalamus CACACAAGCC 7.2 0.0072 Hypothalamus TGCTTGGTTT (2) 7.2 0.0072 Hypothalamus ATGCCGTAAA 3.6 0.0036 Hypothalamus CTGCCCAGCG 3.6 0.0036 Hypothalamus TTTATGTTTA (2) 1.8 0.0018 Hypothalamus TTTTATGGTT 1.8 0.0018 E12.5 retina TTTTATGTTT (2) 215.9 0.2159 E12.5 retina CACACAAGCC 5.6 0.0056 E12.5 retina CTGCCCAGCG 3.8 0.0038 E12.5 retina TTTATGTTTA (2) 3.8 0.0038 E12.5 retina TCTTATGTTT 1.9 0.0019 E12.5 retina TGCTTGGTTT (2) 1.9 0.0019 E14.5 retina TTTTATGTTT (2) 382.6 0.3826 E14.5 retina CACACAAGCC 12.8 0.0128 E14.5 retina TGCTTGGTTT (2) 12.8 0.0128 E14.5 retina CTGCCCAGCG 7.3 0.0073 E14.5 retina TTTAAGGTTT 3.6 0.0036 E14.5 retina TTTATGTTTA (2) 1.8 0.0018 E16.5 retina TTTTATGTTT (2) 490.8 0.4908 E16.5 retina TGCTTGGTTT (2) 18.1 0.0181 E16.5 retina CTGCCCAGCG 9.1 0.0091 E16.5 retina CACACAAGCC 7.2 0.0072 E16.5 retina CTTTATGTTT 3.6 0.0036 E16.5 retina TTTATGTTTA (2) 1.8 0.0018 E16.5 retina TTTTATGGTT 1.8 0.0018 E18.5 retina TTTTATGTTT (2) 247.4 0.2474 E18.5 retina CACACAAGCC 1.8 0.0018 E18.5 retina CTGCCCAGCG 1.8 0.0018 E18.5 retina CTTTATGTTT 1.8 0.0018 E18.5 retina TGCTTGGTTT (2) 1.8 0.0018 E18.5 retina TTTATGTTTA (2) 1.8 0.0018 P0.5 retina TTTTATGTTT (2) 98.1 0.0981 P0.5 retina CTGCCCAGCG 2 0.002 P0.5 retina TGCTTGGTTT (2) 2 0.002 P0.5 retina TTTTATGGTT 2 0.002 P0.5 retina TTTTATGTCT (2) 2 0.002 P2.5 retina TTTTATGTTT (2) 158.4 0.1584 P2.5 retina CACACAAGCC 3.5 0.0035 P2.5 retina TCTTATGTTT 1.8 0.0018 P4.5 retina TTTTATGTTT (2) 89.2 0.0892 P4.5 retina TGCTTGGTTT (2) 4 0.004 P4.5 retina CTGCCCAGCG 2 0.002 P6.5 retina TTTTATGTTT (2) 88.4 0.0884 P6.5 retina CACACAAGCC 5 0.005 P6.5 retina ATGCCGTAAA 1.7 0.0017 P6.5 retina TGCTTGGTTT (2) 1.7 0.0017 P6.5 retina TTTTATGGTT 1.7 0.0017 P10.5 crx- retina TTTTATGTTT (2) 243.4 0.2434 P10.5 crx- retina TGCTTGGTTT (2) 5.6 0.0056 P10.5 crx- retina CTTTATGTTT 3.7 0.0037 P10.5 crx- retina TTTTATGTCT (2) 3.7 0.0037 P10.5 crx- retina ATGCCGTAAA 1.9 0.0019 P10.5 crx- retina CACACAAGCC 1.9 0.0019 P10.5 crx+ retina TTTTATGTTT (2) 44.2 0.0442 P10.5 crx+ retina TCTTATGTTT 1.9 0.0019 P10.5 crx+ retina TTTTATGGTT 1.9 0.0019 Adult retinal TTTTATGTTT (2) 7.4 0.0074 ONL TTTTATGTTT (2) 47.9 0.0479 ONL TTTAATGTTT (2) 9.6 0.0096 ONL CTTTATGTTT 3.8 0.0038 ONL TTTATGTTTA (2) 1.9 0.0019