Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.1022	D4Ucla1	DNA segment, Chr 4, University of California at Los Angeles 1	4	4 78.3 cM	28148
Mm.1022	Cdc42	cell division cycle 42 homolog (S. cerevisiae)	4	4 66.75 cM	12540
Gene Ontology	actin filament organization | filopodium | GTP binding | GTPase activity | GTPase activity | protein binding | Rho protein signal transduction | small GTPase mediated signal transduction
Human Homolog	CDC42[cell division cycle 42 (GTP binding protein, 25kDa)]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 245 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAAGTGGGTG AAATGAAATA (3) AAGGTGGGTG (2) ACTTTATTTA (2) ATTCTTTATA (3) GAAAAAAAAA (2) GAAAAAAGAA GGGATCAGTC (2) GGGTGGGGGA (3) TAAAAAAAAA (3) TACATAAAAT (2) TAGACAAGCC TATCTGCTTA (2) TGAGACAAGG (2) TTGGTTAAAA (2) 137 0.137 Cb medulloblastoma AAAGTGGGTG AAATGAAATA (3) AAGGTGGGTG (2) ACTTTATTTA (2) ATTCTTTATA (3) CCTTGGAATT GAAAAAAAAA (2) GGGTTGGGGA (2) GTCCAAGAAC (2) TAAAAAAAAA (3) TGAGACAAGG (2) TTGGTTAAAA (2) 337.4 0.3374 P8 GC+1d culture AAAGTGGGTG AAATGAAATA (3) AAGGTGGGTG (2) ACTTTATTTA (2) ATTCTTTATA (3) CCTTGGAATT GAAAAAAAAA (2) GAAGAAAAAA (3) GTCCAAGAAC (2) TAAAAAAAAA (3) TAAGAAAATG (3) TACATAAAAT (2) TATCTGCTTA (2) TCTCCTGATA (2) TGAGACAAGG (2) TGGGTAGGTG (2) TTGGTTAAAA (2) 155.1 0.1551 P8 GC+SHH+1d culture AAAGTGGGTG AAATGAAATA (3) AAGGTGGGTG (2) ACTTTATTTA (2) ATTCTTTATA (3) CCTTGGAATT CTTGTATTGA (2) GAAAAAAAAA (2) GAAGAAAAAA (3) GGGATCAGTC (2) GGGTGGGGGA (3) TAAAAAAAAA (3) TACATAAAAT (2) TATCTGCTTA (2) TCTCCTGATA (2) TGAGACAAGG (2) TGGGTAGGTG (2) TTGGTTAAAA (2) 200.6 0.2006 3T3 fibroblasts ATCAAGCAGA TAAAAAAAAA (3) TACATAAAAT (2) TGAGACAAGG (2) TGGGTAGGTG (2) 38.5 0.0385 E15 cortex GAAAAAAAAA (2) GGGATCAGTC (2) TAAAAAAAAA (3) TACATAAAAT (2) TATCTGCTTA (2) 79 0.079 P1 cortex AAAGTGGGTG AAGGTGGGTG (2) ATTCTTTATA (3) GAAAAAAAAA (2) GGGTGGGGAG (2) GGGTGGGGGA (3) TAAAAAAAAA (3) TATCTGCTTA (2) TCTCCTGATA (2) TTGGTTAAAA (2) 149.9 0.1499 Hypothalamus AAAGTGGGTG AAATGAAATA (3) ACTTTATTTA (2) ATCAAGCAGA GAAAAAAAAA (2) GGGTGGGGGA (3) GGGTTGGGGA (2) GTCCAAGAAC (2) TAAAAAAAAA (3) TACATAAAAT (2) TAGACAAGCC TATCTGCTTA (2) TCTCCTGATA (2) TGAGACAAGG (2) TGGGTAGGTG (2) TTGGTTAAAA (2) 353.1 0.3531 E12.5 retina AAAGTGGGTG AAGGTGGGTG (2) ATCAAGCAGA ATTCTTTATA (3) GAAAAAAAAA (2) GAAGAAAAAA (3) GGGATCAGTC (2) GGGTGGGGGA (3) TAAAAAAAAA (3) TACATAAAAT (2) TCTCCTGATA (2) TGAGACAAGG (2) 103.4 0.1034 E14.5 retina AAAGTGGGTG AAATGAAATA (3) ACTTTATTTA (2) ATTCTTTATA (3) GAAAAAAAAA (2) GAAAAAAGAA GAAGAAAAAA (3) GGGTGGGGAG (2) GGGTTGGGGA (2) GTCCAAGAAC (2) TAAAAAAAAA (3) TACATAAAAT (2) TATCTGCTTA (2) TGAGACAAGG (2) TTGGTTAAAA (2) 127.3 0.1273 E16.5 retina AAATGAAATA (3) AAGGTGGGTG (2) ACTTTATTTA (2) ATCAAGCAGA ATTCTTTATA (3) GAAAAAAAAA (2) GGGTTGGGGA (2) GTCCAAGAAC (2) TAAAAAAAAA (3) TAAGAAAATG (3) TACATAAAAT (2) TATCTGCTTA (2) TGAGACAAGG (2) TTGGTTAAAA (2) 88.5 0.0885 E18.5 retina AAAGTGGGTG AAATGAAATA (3) ACTTTATTTA (2) ATTCTTTATA (3) CCTGCAAAAG CTTGTATTGA (2) GAAAAAAAAA (2) GGGATCAGTC (2) GGGTGGGGGA (3) GGGTTGGGGA (2) TAAAAAAAAA (3) TACATAAAAT (2) TATCTGCTTA (2) TGAGACAAGG (2) 241.7 0.2417 P0.5 retina AAAGTGGGTG ATTCTTTATA (3) GAAAAAAAAA (2) TAAAAAAAAA (3) TATCTGCTTA (2) TGAGACAAGG (2) 90.3 0.0903 P2.5 retina AAAGTGGGTG ATCAAGCAGA ATTCTTTATA (3) CCTGCAAAAG GAAAAAAAAA (2) GAAGAAAAAA (3) GGGTGGGGAG (2) GGGTTGGGGA (2) GTCCAAGAAC (2) TAAAAAAAAA (3) TACATAAAAT (2) TCTCCTGATA (2) TGAGACAAGG (2) TTGGTTAAAA (2) 206 0.206 P4.5 retina AAAGTGGGTG AAATGAAATA (3) ATTCTTTATA (3) CCTTGGAATT GAAAAAAAAA (2) GGGATCAGTC (2) GGGTGGGGGA (3) GGGTTGGGGA (2) TAAAAAAAAA (3) TACATAAAAT (2) TCTCCTGATA (2) TGAGACAAGG (2) TTGGTTAAAA (2) 210.2 0.2102 P6.5 retina AAAGTGGGTG AAATGAAATA (3) ACTTTATTTA (2) ATCAAGCAGA CCTTGGAATT GAAAAAAAAA (2) GAAGAAAAAA (3) GGGTGGGGGA (3) GGGTTGGGGA (2) TAAAAAAAAA (3) TACATAAAAT (2) TATCTGCTTA (2) TGAGACAAGG (2) TTGGTTAAAA (2) 146.9 0.1469 P10.5 crx- retina AAAGTGGGTG AAATGAAATA (3) ACTTTATTTA (2) ATTCTTTATA (3) CCTTGGAATT GAAAAAAAAA (2) GGGTGGGGGA (3) GTCCAAGAAC (2) TAAAAAAAAA (3) TACATAAAAT (2) TATCTGCTTA (2) TCTCCTGATA (2) TGAGACAAGG (2) TTGGTTAAAA (2) 85.6 0.0856 P10.5 crx+ retina AAAGTGGGTG AAATGAAATA (3) AAGGTGGGTG (2) GAAAAAAAAA (2) GAAAAAAGAA GGGTGGGGGA (3) GTCCAAGAAC (2) TAAAAAAAAA (3) TACATAAAAT (2) TATCTGCTTA (2) TGAGACAAGG (2) 109.5 0.1095 Adult retinal AAAGTGGGTG ATTCTTTATA (3) CCTGCAAAAG GAAAAAAAAA (2) GGGTGGGGGA (3) GGGTTGGGGA (2) TAAAAAAAAA (3) TATCTGCTTA (2) TCTCCTGATA (2) 57.7 0.0577 ONL AAAGTGGGTG AAATGAAATA (3) ATTCTTTATA (3) GAAAAAAAAA (2) GAAAAAAGAA GAAGAAAAAA (3) GGGTTGGGGA (2) TAAAAAAAAA (3) TACATAAAAT (2) TCTCCTGATA (2) TTGGTTAAAA (2) 116.7 0.1167