Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.102305 Tnrc6trinucleotide repeat containing 6 7    233833 
 Mm.102305 2010321I05RikRIKEN cDNA 2010321I05 gene 7    76695 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 116 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCACTTTTTGGC (2)
TGTGTGCTGG (2)
TTGTTTTGAA (2)
TTTGTGCTGG
130.013
Cb medulloblastomaACTTTTTGGC (2)
AGAGAATTGG (3)
CTGTTTTGTG (3)
GTTCTCAGGA (2)
TGGTTTGAAG
TTGTTTTGAA (2)
20.70.0207
P8 GC+1d cultureACTTCGTTAA (2)
ACTTTTTGGC (2)
CAGCAGCCTC (3)
CTGTTTTGAA (3)
GTTCTCAGGA (2)
TTGTTTTGAA (2)
TTTGTGCTGG
26.10.0261
P8 GC+SHH+1d cultureACTTTTTGGC (2)
AGAGAATTGG (3)
CTGTTTTGAA (3)
GTTCTCAGGA (2)
TGGTTTGAAG
TGTGGGATGT (3)
TTTAGCCTTC (2)
130.013
3T3 fibroblastsGCCCACAATA
TGTGTGCTGG (2)
10.50.0105
E15 cortexACTTTTTGGC (2)
CAGCAGCCTC (3)
GTTCTCAGGA (2)
TTTGTGCTGG
24.60.0246
P1 cortexAGAGAATTGG (3)
TGTGTGCTGG (2)
TTGTTTTGAA (2)
13.50.0135
HypothalamusACTTCGTTAA (2)
CAGCAGCCTC (3)
CTGTTTTGAA (3)
GTTCTCAGGA (2)
TCAGGTCTCT
TTGTTTTGAA (2)
16.20.0162
E12.5 retinaACTTCGTTAA (2)
ACTTTTTGGC (2)
GCCCACAATA
TGGTTTGAAG
TGTGTGCTGG (2)
TTGCCTACCT
TTGTTTTGAA (2)
33.80.0338
E14.5 retinaACTTCGTTAA (2)
ACTTTTTGGC (2)
CAGCAGCCTC (3)
GTTCTCAGGA (2)
TGGTTTGAAG
TTGCCTACCT
12.60.0126
E16.5 retinaACTTCGTTAA (2)
ACTTTTTGGC (2)
CTGTTTTGAA (3)
CTGTTTTGTG (3)
GTTCTCAGGA (2)
TGGTTTGAAG
TTGCCTACCT
TTGTTTTGAA (2)
TTTGTGCTGG
270.027
E18.5 retinaACTTCGTTAA (2)
ACTTTTTGGC (2)
CAGCAGCCTC (3)
GTTCTCAGGA (2)
TGGTTTGAAG
TGTGTGCTGG (2)
16.30.0163
P0.5 retinaACTTTTTGGC (2)
GTTCTCAGGA (2)
TTGTTTTGAA (2)
TTTAGCCTTC (2)
11.90.0119
P2.5 retinaACTTTTTGGC (2)
CTGTTTTGAA (3)
GTTCTCAGGA (2)
TCAGGTCTCT
TGGTTTGAAG
TGTGTGCTGG (2)
TTGTTTTGAA (2)
TTTAGCCTTC (2)
TTTGTGCTGG
26.70.0267
P4.5 retinaAGAGAATTGG (3)
CTGTTTTGAA (3)
GTTCTCAGGA (2)
TGGTTTGAAG
TGTGGGATGT (3)
TTGTTTTGAA (2)
160.016
P6.5 retinaACTTCGTTAA (2)
ACTTTTTGGC (2)
CAGCAGCCTC (3)
CTGTTTTGAA (3)
GTTCTCAGGA (2)
TGGTTTGAAG
TGTGGGATGT (3)
31.80.0318
P10.5 crx- retinaACTTTTTGGC (2)
CTGTTTTGAA (3)
TGGTTTGAAG
TTGTTTTGAA (2)
TTTAGCCTTC (2)
16.80.0168
P10.5 crx+ retinaACTTTTTGGC (2)
AGAGAATTGG (3)
GTTCTCAGGA (2)
TGGTTTGAAG
TGTGGGATGT (3)
TGTGTGCTGG (2)
TTTAGCCTTC (2)
32.60.0326
Adult retinalACTTCGTTAA (2)
ACTTTTTGGC (2)
AGAGAATTGG (3)
CTGTTTTGAA (3)
TTGTTTTGAA (2)
16.80.0168
ONLACTTTTTGGC (2)
CAGCAGCCTC (3)
CTGTTTTGTG (3)
TGGTTTGAAG
TGTGGGATGT (3)
TGTGTGCTGG (2)
15.20.0152