Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.10299 Col5a2procollagen, type V, alpha 2 1    12832 
 Mm.10299 1110014L14RikRIKEN cDNA 1110014L14 gene 1    73740 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 104 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCGAGGGTAAAG (3)
TCAAAAAAAA (2)
TCAGATCTGT (2)
TTATTAAAAA (6)
24.40.0244
Cb medulloblastomaATCAAAGTTC (2)
CCTGGGCTCT
GAGGGTAAAG (3)
TCAAAAAAAA (2)
TCACATCTGT (3)
TGTGTGCGAG
110.90.1109
P8 GC+1d cultureATCAAAGTTC (2)
ATGGCACACT (2)
GTGACAACTA (2)
GTGTTCCTGG (3)
TAACAGAAGC (2)
TCAAAAAAAA (2)
TCACATCTGT (3)
TCAGATCTGT (2)
TGTGTGCGAG
TTATTAAAAA (6)
TTTTTTTCCC (3)
38.60.0386
P8 GC+SHH+1d cultureGTGACAACTA (2)
GTGTTCCTGG (3)
TCAAAAAAAA (2)
TCACATCTGT (3)
TTATTAAAAA (6)
620.062
3T3 fibroblastsGTGTTCCTGG (3)
TAACAGAAGC (2)
TCAAAAAAAA (2)
31.50.0315
E15 cortexTCAAAAAAAA (2)
14.80.0148
P1 cortexCCTGGGCTCT
TCAAAAAAAA (2)
TCAGATCTGT (2)
31.70.0317
HypothalamusCCTGGGCTCT
GTGTTCCTGG (3)
TCAAAAAAAA (2)
TCAGATCTGT (2)
TGTGTGCGAG
470.047
E12.5 retinaATCAAAGTTC (2)
GTGTTCCTGG (3)
TCAAAAAAAA (2)
TCACATCTGT (3)
TTTTTTTCCC (3)
39.50.0395
E14.5 retinaATCAAAGTTC (2)
ATGGCACACT (2)
CCTGGGCTCT
GTGTTCCTGG (3)
TAACAGAAGC (2)
TCAAAAAAAA (2)
TTATTAAAAA (6)
TTTTTTTCCC (3)
58.10.0581
E16.5 retinaATCAAAGTTC (2)
GAGGGTAAAG (3)
GTGACAACTA (2)
GTGTTCCTGG (3)
TCAAAAAAAA (2)
TCACATCTGT (3)
TTATTAAAAA (6)
32.50.0325
E18.5 retinaATCAAAGTTC (2)
GTGACAACTA (2)
TCAAAAAAAA (2)
TTTTTTTCCC (3)
61.80.0618
P0.5 retinaATCAAAGTTC (2)
CCTGGGCTCT
TCAAAAAAAA (2)
TCACATCTGT (3)
TCAGATCTGT (2)
TTTTTTTCCC (3)
43.30.0433
P2.5 retinaATCAAAGTTC (2)
ATGGCACACT (2)
GAGGGTAAAG (3)
GTGACAACTA (2)
TCAAAAAAAA (2)
TCACATCTGT (3)
TCAGATCTGT (2)
51.20.0512
P4.5 retinaATCAAAGTTC (2)
TCAAAAAAAA (2)
TCACATCTGT (3)
TCAGATCTGT (2)
TTATTAAAAA (6)
49.60.0496
P6.5 retinaATCAAAGTTC (2)
GTGTTCCTGG (3)
TCAAAAAAAA (2)
TCACATCTGT (3)
TGTGTGCGAG
TTATTAAAAA (6)
TTTTTTTCCC (3)
56.80.0568
P10.5 crx- retinaGAGGGTAAAG (3)
TCAAAAAAAA (2)
TCACATCTGT (3)
TGTGTGCGAG
TTATTAAAAA (6)
TTTTTTTCCC (3)
280.028
P10.5 crx+ retinaATCAAAGTTC (2)
CCTGGGCTCT
TCAAAAAAAA (2)
TTTTTTTCCC (3)
30.70.0307
Adult retinalATCAAAGTTC (2)
ATGGCACACT (2)
TCAAAAAAAA (2)
TGTGTGCGAG
29.80.0298
ONLTCAAAAAAAA (2)
TTATTAAAAA (6)
TTTTTTTCCC (3)
210.021