Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.105331 A930007D18RikRIKEN cDNA A930007D18 gene 4    77789 
 Mm.105331 Psip1PC4 and SFRS1 interacting protein 1 4    101739 
 Mm.105331 E030018J20RikRIKEN cDNA E030018J20 gene 4    319879 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 125 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAGACTGCTTT (3)
GTTATTGATG (4)
GTTGGTCTGT (4)
TAATCTACAG (3)
TCACAGGTGT (5)
24.60.0246
Cb medulloblastomaGCCACTTGGA
GTTGGTCTGT (4)
TCCTCCTGTG
13.80.0138
P8 GC+1d cultureGATTGATTCT (4)
GCCACTTGGA
GTTATTGATG (4)
GTTGGTCTGT (4)
TAATCTACAG (3)
TCACAGGTGT (5)
TCCTCCTGTG
TTTTCAAATT
35.20.0352
P8 GC+SHH+1d cultureAGAAAGAAGC (3)
GTTATTGATG (4)
GTTGGTCTGT (4)
TAATCTACAG (3)
TATGTTCCTG (3)
TCACAGGTGT (5)
30.40.0304
3T3 fibroblastsGTCATAGCTG (2)
GTTGGTCTGT (4)
TCCTCCTGTG
280.028
E15 cortexAGAAAGAAGC (3)
GTCATAGCTG (2)
GTTATTGATG (4)
GTTGGTCTGT (4)
29.60.0296
P1 cortexCAAAACTATG (2)
GTTATTGATG (4)
GTTGGTCTGT (4)
TAATCTACAG (3)
45.40.0454
HypothalamusCAAAACTATG (2)
GTTGGTCTGT (4)
TAATCTACAG (3)
TAGACCAGGT (3)
90.009
E12.5 retinaATGCTTGTAA
CAAAACTATG (2)
GTAAGTTCCA (3)
GTTATTGATG (4)
GTTGGTCTGT (4)
TAATCTACAG (3)
TCACAGGTGT (5)
170.017
E14.5 retinaACCTACTCAG (3)
AGAAAGAAGC (3)
AGACTGCTTT (3)
GATTGATTCT (4)
GCCACTTGGA
GTAAGTTCCA (3)
GTTATTGATG (4)
GTTGGTCTGT (4)
TCACAGGTGT (5)
TTCCTCCTGT
TTTTCAAATT
23.40.0234
E16.5 retinaAGAAAGAAGC (3)
AGACTGCTTT (3)
ATGCTTGTAA
GTTGGTCTGT (4)
TAATCTACAG (3)
TCACAGGTGT (5)
TCACCGTCTG (3)
TTTTCAAATT
28.80.0288
E18.5 retinaAGAAAGAAGC (3)
GATTGATTCT (4)
GTTATTGATG (4)
GTTGGTCTGT (4)
TAATCTACAG (3)
TCACAGGTGT (5)
23.50.0235
P0.5 retinaGATTGATTCT (4)
GTCATAGCTG (2)
GTTATTGATG (4)
GTTGGTCTGT (4)
TAATCTACAG (3)
TCACAGGTGT (5)
TTCCTCCTGT
TTTTCAAATT
550.055
P2.5 retinaATGCTTGTAA
GATTGATTCT (4)
GTCATAGCTG (2)
GTTATTGATG (4)
GTTGGTCTGT (4)
TAATCTACAG (3)
TATGTTCCTG (3)
TCCTCCTGTG
TTCCTCCTGT
33.60.0336
P4.5 retinaGCCACTTGGA
GTCATAGCTG (2)
GTTGGTCTGT (4)
TAATCTACAG (3)
TATGTTCCTG (3)
TCACAGGTGT (5)
27.70.0277
P6.5 retinaGCCACTTGGA
GTAAGTTCCA (3)
GTCATAGCTG (2)
GTTGGTCTGT (4)
TAATCTACAG (3)
TATGTTCCTG (3)
TCACAGGTGT (5)
TTTTCAAATT
23.50.0235
P10.5 crx- retinaAGAAAGAAGC (3)
GCCACTTGGA
GTTGGTCTGT (4)
TAATCTACAG (3)
TCACAGGTGT (5)
TTTTCAAATT
22.40.0224
P10.5 crx+ retinaGCCACTTGGA
GTTATTGATG (4)
GTTGGTCTGT (4)
TAATCTACAG (3)
TCACAGGTGT (5)
TTTTCAAATT
21.10.0211
Adult retinalGATTGATTCT (4)
GTCATAGCTG (2)
GTTGGTCTGT (4)
TAATCTACAG (3)
TCACAGGTGT (5)
22.40.0224
ONLACCTACTCAG (3)
ATGCTTGTAA
GCCACTTGGA
GTCATAGCTG (2)
GTTGGTCTGT (4)
TAATCTACAG (3)
TAGACCAGGT (3)
TTTTCAAATT
22.80.0228