Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.10699 Vamp4vesicle-associated membrane protein 4 1  1 85.0 cM  53330 
 Gene Ontology biological_process unknown | integral to membrane | molecular_function unknown
 Human Homolog VAMP4[vesicle-associated membrane protein 4]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 98 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCGTGGCACACA (2)
GTGGCACACG (3)
TGGGTGCCCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
22.80.0228
Cb medulloblastomaGCTTTGGCTG (2)
GTGGCACACA (2)
GTGGCACACG (3)
TGGGTGCCCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
25.40.0254
P8 GC+1d cultureGCTTTGGCTG (2)
GTGGCACACA (2)
GTGGCACACG (3)
GTTTTTAAAA (2)
TGGGTGCCCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
37.60.0376
P8 GC+SHH+1d cultureAAGGTGGGGG (3)
GCTTTGGCTG (2)
GTGGCACACA (2)
GTGGCACACG (3)
GTTTTTAAAA (2)
TGGGTGCCCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
26.90.0269
3T3 fibroblastsGCTTTGGCTG (2)
GTGGCACACA (2)
GTGGCACACG (3)
TGGGTGCCCT (2)
560.056
E15 cortexGCTTTGGCTG (2)
GTGGCACACA (2)
GTGGCACACG (3)
TGGGTGCCCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
108.70.1087
P1 cortexGTGGCACACA (2)
GTGGCACACG (3)
GTTTTTAAAA (2)
TTTTTTTTTT (2)
22.60.0226
HypothalamusGCTTTGGCTG (2)
GTGGCACACA (2)
GTTTTTAAAA (2)
TGGGTGCCCT (2)
TTTTAAAGCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
23.40.0234
E12.5 retinaGTGGCACACA (2)
GTGGCACACG (3)
TGGGTGCCCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
37.50.0375
E14.5 retinaGCTTTGGCTG (2)
GTGGCACACA (2)
GTGGCACACG (3)
TTTTTTTTTT (2)
63.70.0637
E16.5 retinaGTGGCACACA (2)
GTGGCACACG (3)
GTTTTTAAAA (2)
TGGGTGCCCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
30.80.0308
E18.5 retinaATCTCTGCTA
GCTTTGGCTG (2)
GTGGCACACA (2)
GTGGCACACG (3)
TGGGTGCCCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
30.90.0309
P0.5 retinaGCTTTGGCTG (2)
GTGGCACACA (2)
GTGGCACACG (3)
GTTTTTAAAA (2)
TGGGTGCCCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
45.20.0452
P2.5 retinaAAGGTGGGGG (3)
GTGGCACACA (2)
GTGGCACACG (3)
TTTTTTTTTT (2)
35.20.0352
P4.5 retinaGTGGCACACA (2)
GTGGCACACG (3)
GTTTTTAAAA (2)
TGGGTGCCCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
43.70.0437
P6.5 retinaGTGGCACACA (2)
GTGGCACACG (3)
TGGGTGCCCT (2)
TTTTAAAGCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
45.10.0451
P10.5 crx- retinaGCTTTGGCTG (2)
GTGGCACACA (2)
GTGGCACACG (3)
TGGGTGCCCT (2)
TTTTAAAGCT (2)
24.20.0242
P10.5 crx+ retinaGTGGCACACA (2)
GTGGCACACG (3)
TGGGTGCCCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
230.023
Adult retinalGCTTTGGCTG (2)
GTGGCACACA (2)
GTGGCACACG (3)
TTTTAAAGCT (2)
TTTTTTTTTT (2)
31.60.0316
ONLAAGGTGGGGG (3)
GTGGCACACA (2)
GTGGCACACG (3)
TTTTTTTTTT (2)
38.30.0383