Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.1155 Tuba4tubulin, alpha 4 1  1 C4  22145 
 Gene Ontology GTP binding | microtubule | microtubule-based movement | microtubule-based process | structural constituent of cytoskeleton | structural molecule activity
 Human Homolog TUBA1[tubulin, alpha 1 (testis specific)]
 Clusters 
   Neighbors    

Total 6 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 90 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCTATTAAAAG (2)
CTGAGCAACA (2)
GCTCCAGCCC (2)
GGATTCAGCC (2)
GTTAAAAAAA (2)
TAGCGCGCCC (3)
TGCCCCGGGC
34.10.0341
Cb medulloblastomaCAAGGAGACT (2)
CTATTAAAAG (2)
GCTCCAGCCC (2)
GTTAAAAAAA (2)
TGCCCCGGGC
50.80.0508
P8 GC+1d cultureCTGAGCAACA (2)
GTTAAAAAAA (2)
TAGCGCGCCC (3)
TGCCCCGGGC
18.20.0182
P8 GC+SHH+1d cultureCTGAGCAACA (2)
GCCCTGTTGC (2)
GTTAAAAAAA (2)
TGCCCCGGGC
TGGACCTGAC (2)
24.70.0247
3T3 fibroblastsCTGAGCAACA (2)
GCTGTGCCTG (5)
TAGCGCGCCC (3)
10.50.0105
E15 cortexCTGAGCAACA (2)
TGCCCCGGGC
24.70.0247
P1 cortexGTTAAAAAAA (2)
TGCCCCGGGC
90.009
HypothalamusAAGCAAGAGC
CAAGGAGACT (2)
CTATTAAAAG (2)
CTGAGCAACA (2)
GCTCCAGCCC (2)
GTTAAAAAAA (2)
TGCCCCGGGC
TGGACCTGAC (2)
36.20.0362
E12.5 retinaCTGAGCAACA (2)
GCTGTGCCTG (5)
GTTAAAAAAA (2)
9.50.0095
E14.5 retinaAAGCAAGAGC
CAAGGAGACT (2)
CTGAGCAACA (2)
GCTCCAGCCC (2)
GCTGTGCCTG (5)
GTTAAAAAAA (2)
TGCCCCGGGC
34.40.0344
E16.5 retinaCAAGGAGACT (2)
CTGAGCAACA (2)
GCTCCAGCCC (2)
GCTGTGCCTG (5)
GTTAAAAAAA (2)
TGCCCCGGGC
30.70.0307
E18.5 retinaGTTAAAAAAA (2)
TGCCCCGGGC
TTGGACTGAC
32.70.0327
P0.5 retinaCTGAGCAACA (2)
GCCCTGTTGC (2)
GTTAAAAAAA (2)
TGCCCCGGGC
13.70.0137
P2.5 retinaCAAGGAGACT (2)
CTGAGCAACA (2)
GTTAAAAAAA (2)
10.60.0106
P4.5 retinaCAAGGAGACT (2)
CTGAGCAACA (2)
GCTGACAGTG (2)
GTTAAAAAAA (2)
17.90.0179
P6.5 retinaCAAGGAGACT (2)
CTGAGCAACA (2)
GCTGACAGTG (2)
GTTAAAAAAA (2)
TGCCCCGGGC
TGGACCTGAC (2)
TTGGACTGAC
31.80.0318
P10.5 crx- retinaCTGAGCAACA (2)
GCTGACAGTG (2)
GGATTCAGCC (2)
GTTAAAAAAA (2)
TGCCCCGGGC
22.40.0224
P10.5 crx+ retinaCTATTAAAAG (2)
GTTAAAAAAA (2)
TGGACCTGAC (2)
19.20.0192
Adult retinalCTATTAAAAG (2)
GCTCCAGCCC (2)
GCTGACAGTG (2)
GGATTCAGCC (2)
TGCCCCGGGC
16.80.0168
ONLGCTCCAGCCC (2)
GCTGACAGTG (2)
GTTAAAAAAA (2)
TGCCCCGGGC
9.50.0095