Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.11780 AU021895expressed sequence AU021895 13    105290 
 Mm.11780 Tm7sf1transmembrane 7 superfamily member 1 13  13 6.0 cM  83924 
 Gene Ontology integral to membrane
 Human Homolog TM7SF1[transmembrane 7 superfamily member 1 (upregulated in kidney)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 73 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCTCAACAGCA (2)
TCAGCAATAA (2)
24.40.0244
Cb medulloblastomaAATGCTGACA
CTCAACAGCA (2)
TCAGCAATAA (2)
13.80.0138
P8 GC+1d cultureCTCAACAGCA (2)
GCTCCACAGG (2)
GTCTGTACGT (2)
TCAGCAATAA (2)
TGGTACAAAA (2)
34.10.0341
P8 GC+SHH+1d cultureCTCAACAGCA (2)
GCTCCACAGG (2)
TCAGCAATAA (2)
29.30.0293
3T3 fibroblastsCACACTTTAC (3)
CTCAACAGCA (2)
GCTCCACAGG (2)
TCAGCAATAA (2)
24.50.0245
E15 cortexCTCAACAGCA (2)
GCCTCTCTCT
34.60.0346
P1 cortexGCCTCTCTCT
TCAGCAATAA (2)
13.60.0136
HypothalamusCACACTTTAC (3)
CTCAACAGCA (2)
TCAGCAATAA (2)
7.20.0072
E12.5 retinaCTCAACAGCA (2)
GCTCCACAGG (2)
TCAGCAATAA (2)
37.60.0376
E14.5 retinaCTCAACAGCA (2)
TCAGCAATAA (2)
TCCCTCCCTC (3)
36.40.0364
E16.5 retinaCACACTTTAC (3)
CTCAACAGCA (2)
GCCTCTCTCT
TCAGCAATAA (2)
27.10.0271
E18.5 retinaCCTGTCATTT (2)
CTCAACAGCA (2)
GCCTCTCTCT
TCAGCAATAA (2)
TGCTAAAAAA
32.70.0327
P0.5 retinaCTCAACAGCA (2)
GCCTCTCTCT
GCTCCACAGG (2)
TCAGCAATAA (2)
45.20.0452
P2.5 retinaCCTGTCATTT (2)
CTCAACAGCA (2)
GCCTCTCTCT
GCTCCACAGG (2)
TCAGCAATAA (2)
33.50.0335
P4.5 retinaCTCAACAGCA (2)
TCAGCAATAA (2)
31.70.0317
P6.5 retinaCCTGTCATTT (2)
CTCAACAGCA (2)
GCCTCTCTCT
TCAGCAATAA (2)
TGCTAAAAAA
26.80.0268
P10.5 crx- retinaCACACTTTAC (3)
CTCAACAGCA (2)
GCCTCTCTCT
GTCTGTACGT (2)
TCAGCAATAA (2)
410.041
P10.5 crx+ retinaAATGCTGACA
CTCAACAGCA (2)
GCTCCACAGG (2)
TCAGCAATAA (2)
TGCTAAAAAA
230.023
Adult retinalAATGCTGACA
CTCAACAGCA (2)
GCCTCTCTCT
TCCCTCCCTC (3)
TGGTACAAAA (2)
31.60.0316
ONLCTCAACAGCA (2)
TCAGCAATAA (2)
TGCTAAAAAA
13.40.0134